научный журнал по химии Биоорганическая химия ISSN: 0132-3423

Архив научных статейиз журнала «Биоорганическая химия»

  • АФФИННЫЕ СОРБЕНТЫ НА ОСНОВЕ ДНК-АПТАМЕРОВ ДЛЯ СОРБЦИИ IGE ЧЕЛОВЕКА

    АДАМОВА И.Ю., АФАНАСЬЕВА О.И., ГЛИНКИНА К.А., ЛЕВАШОВ П.А., ОВЧИННИКОВА Е.Д., ПОКРОВСКИЙ С.Н., СПИРИДОНОВА В.А. — 2014 г.

    Для сорбции IgE из плазмы крови человека синтезированы три аффинных сорбента на основе полисахаридной матрицы с использованием ДНК-аптамеров в качестве лигандов. Cорбенты показали высокую сорбционную эффективность: в зависимости от ориентации ДНК-аптамеров на матрице экспериментальные значения констант сорбции IgE составили 0.11–0.17 нМ. Показана стабильность разработанных аффинных сорбентов при многократном использовании и подобраны условия их регенерации.

  • ВЛИЯНИЕ РЕКОМБИНАНТНОГО АНАЛОГА НУКЛЕОФОЗМИНА-1 НА ПРОНИКНОВЕНИЕ СИНТЕТИЧЕСКИХ РНК В КЛЕТКИ АДЕНОКАРЦИНОМЫ ЧЕЛОВЕКА MCF-7

    БАРЯКИН Д. Н., КОВАЛЬ О. А., КУЛИГИНА Е. В., РАБИНОВ И. В., РИХТЕР В. А., САВЕЛЬЕВА А. В., СЕМЕНОВ Д. В., СТЕПАНОВ Г. А. — 2014 г.

    Получен и охарактеризован рекомбинантный аналог (Npm1-His6) нуклеофозмина-1 человека, многофункционального ядрышкового фосфопротеина NPM1, участвующего в ключевых процессах жизнедеятельности клеток, таких, как транскрипция, репарация и митоз. Проведен анализ взаимодействия полученного Npm1-His6 с синтетическими некодирующими РНК in vitro и его влияния на эффективность накопления внеклеточных нуклеиновых кислот в клетках аденокарциномы молочной железы MCF-7. Установлено, что рекомбинантный белок Npm1-His6 увеличивает эффективность трансфекции РНК, обладающей развитой вторичной структурой, в клетки человека. Полученные данные позволяют заключить, что нуклеофозмин-1 не только связывает РНК c развитой вторичной структурой, но и способствует захвату и интернализации таких РНК клетками человека.

  • ВОЗДЕЙСТВИЕ ВНЕКЛЕТОЧНЫХ ПРОТЕАЗ МИКРОМИЦЕТОВ РОДА ASPERGILLUS НА БЕЛКИ СИСТЕМЫ ГЕМОСТАЗА

    БАРАНОВА Н.А., ЕГОРОВ Н.С., ЗВОНАРЕВА Е.С., КРЕЙЕР В.Г., ОСМОЛОВСКИЙ А.А. — 2014 г.

    Проведен скрининг среди микромицетов рода Aspergillus на предмет секреции ими внеклеточных протеолитических ферментов, способных воздействовать на белки системы гемостаза человека. Обнаружена способность внеклеточных протеаз аспергиллов расщеплять специфичные для белков системы гемостаза хромогенные пептидные субстраты, а также активировать ряд проферментов (протеин С, Х фактор и протромбин). Впервые показана способность внеклеточных протеаз микромицетов активировать Х фактор плазмы крови человека.

  • ВЫДЕЛЕНИЕ ПОМОЛОВОЙ КИСЛОТЫ ИЗ CHAMAENERION ANGUSTIFOLIUM И ОЦЕНКА ЕЕ ПОТЕНЦИАЛЬНОЙ ГЕНОТОКСИЧНОСТИ В БАКТЕРИАЛЬНЫХ ТЕСТ-СИСТЕМАХ

    ДУДАРЕВА Т. А., КУКИНА Т. П., САЛЬНИКОВА О. И., СИНИЦИНА О. И., ФРОЛОВА Т. С. — 2014 г.

    Исследован состав липофильных компонентов, содержащихся в лекарственном растении иван-чай узколистный (Chamaenerion angustifolium), на сырье трех лет сбора. Методом хроматомасс-спектрометрического анализа впервые обнаружено 28 алифатических и 6 тритерпеновых кислот. С помощью теста Эймса и SOS-хромотеста показано, что помоловая кислота не обладает генотоксическими и мутагенными свойствами.

  • ГИБРИДНЫЕ ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ БЕЛКИ НА ОСНОВЕ 10-ГО ДОМЕНА ФИБРОНЕКТИНА ЧЕЛОВЕКА

    БОЛДЫРЕВА Е.Ф., ГАПИЗОВ С.Ш., ДОЛГИХ Д.А., КИРПИЧНИКОВ М.П., КРЮКОВА Е.А., ЛУКАШЕВ Е.П., ПЕТРОВСКАЯ Л.Е., СВИРЩЕВСКАЯ Е.В., ШИНГАРОВА Л.Н., ЯКИМОВ С.А. — 2014 г.

    В работе представлен новый тип гибридных молекул, включающих красный флуоресцентный белок mCherry и 10-й домен фибронектина человека типа III (10Fn3) – один из альтернативных каркасных белков, на основе которого могут быть получены рекомбинантные аналоги антител различной специфичности. Сконструированы различные варианты гена, кодирующего гибридный флуоресцентный белок, и изучена их экспрессия в клетках Escherichia coli. Установлено, что расположение mCherry на N-конце гибридного белка и предложенная нами модификация его N-концевой аминокислотной последовательности способствуют увеличению выхода продукта экспрессии в растворимой форме. На основе предложенной конструкции получен гибридный флуоресцентный белок ChIBF, содержащий -интегринсвязывающий вариант 10Fn3, и продемонстрирована возможность его использования для визуализации -интегрина на поверхности эпителиальных клеток MDCK методом конфокальной микроскопии.

  • ДВА МЕХАНИЗМА СВОРАЧИВАНИЯ БЕЛКОВ: ТЕОРЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ

    БОШКОВА Е.А., ЕФИМОВ А.В. — 2014 г.

    В работе рассматриваются два возможных механизма сворачивания белков: “зародышевый” – на примере белков, содержацих -уголки, и “блочный” – на примере сериновых протеаз. Анализ пространственного строения -уголков и закономерностей в кодирующих их аминокислотных последовательностях позволил сделать вывод о том, что -уголки способны свернуться в свои уникальные структуры самостоятельно и могут служить зародышами или готовыми структурными блоками при сворачивании белков. Структуры более высокого прядка могут возникнуть последовательной пристройкой других -тяжей к -уголку как к зародышу в соответствии с определенным набором правил и запретов. С другой стороны, -уголок может явиться готовым структурным блоком, и комплементарное объединение двух -уголков может привести к образованию пространственных укладок цепи, которые встречаются в доменах сериновых протеаз и подобных им белков.

  • ИЗМЕНЕНИЕ УРОВНЯ БЕЛКОВ ТЕПЛОВОГО ШОКА СЕМЕЙСТВА 70 КДА В НЕЙТРОФИЛАХ ЧЕЛОВЕКА ПОД ДЕЙСТВИЕМ ТЕПЛОВОГО ШОКА

    БОЙКО А.А., ВЕТЧИНИН С.С., КОВАЛЕНКО Е.И., САПОЖНИКОВ А.М. — 2014 г.

    Изучены изменения в содержании конститутивного и индуцируемого белков семейства белков теплового шока 70 кДа (HSP70), вызванные тепловым шоком, в человеческих нейтрофилах – лейкоцитах с нетипично коротким периодом жизни, обеспечивающих в организме неспецифическую защиту от бактериальных патогенов. При анализе внутриклеточного содержания конститутивного и индуцируемого белков HSP70 методом проточной цитометрии в нейтрофилах была выявлена двухфазная динамика изменения уровня белка, характеризующаяся их увеличением непосредственно после теплового шока и последующим снижением этого уровня в течение 15–30 мин после завершения термического воздействия. Поскольку ингибитор белкового синтеза циклогексимид не приводил к изменению регистрируемого профиля динамики, сделано заключение, что увеличение уровня HSP70 не связано с синтезом этих белков de novo, но может быть обусловлено изменением конформации молекул HSP70 и увеличением доступности определенных эпитопов для связывания с антителами. С помощью панели антител, специфичных к N-концевому АТР-связывающему либо С-концевому субстратсвязывающему доменам белка, удалось показать, что ассоциированное с тепловым шоком возрастание внутриклеточного уровня HSP70, детектируемое с помощью методов клеточной иммунофлуоресценции и проточной цитометрии, обусловлено увеличением эффективности связывания антител, распознающих субстратсвязывающий домен. Также продемонстрировано, что снижение внутриклеточного уровня HSP70, наблюдаемое после теплового шока, может быть частично обусловлено выбросом во внеклеточное пространство как конститутивного, так и индуцируемого белков HSP70, регулируемым с участием ABC-транспортеров.

  • ИММУНИЗАЦИЯ СИНТЕТИЧЕСКИМ ФРАГМЕНТОМ РЕЦЕПТОРА НЕЙРОТРОФИНОВ Р75 ПРЕДОТВРАЩАЕТ ПОТЕРЮ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ ПАМЯТИ И СНИЖАЕТ УРОВЕНЬ БЕТА-АМИЛОИДА У МЫШЕЙ С ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНО ИНДУЦИРОВАННОЙ ФОРМОЙ БОЛЕЗНИ АЛЬЦГЕЙМЕРА

    АЛЕКСАНДРОВА И.Ю., АРСЕНЬЕВ А.С., БОБКОВА Н.В., ВОЛКОВА Т.Д., ВОЛЬПИНА О.М., ЗАПОРОЖСКАЯ Я.В., КАМЫНИНА А.В., КОРОЕВ Д.О., МЕДВИНСКАЯ Н.И., САМОХИН А.Н. — 2014 г.

    В патогенезе болезни Альцгеймера центральную роль играет бета-амилоидный пептид, нейротоксическое действие которого обусловлено взаимодействием с рядом рецепторов, локализованных на поверхности нервных клеток. Одной из мишеней бета-амилоида является многофункциональный рецептор нейротрофинов р75, в норме ответственный за поддержание баланса выживающих и погибающих клеток мозга, особенно ацетилхолинсинтезирующих нейронов базальных ядер переднего мозга. Мы предположили, что стимуляция продукции антител, направленных к потенциальным участкам связывания р75 с бета-амилоидом, может явиться эффективным инструментом для иммунотерапии болезни Альцгеймера, характеризующейся холинергическим дефицитом. Было выбрано четыре потенциально иммуноактивных фрагмента рецептора р75 и осуществлен их синтез. Изучение иммунопротективного действия пептидов, проведенное на мышах с экспериментально индуцированной формой болезни Альцгеймера, позволило выявить два фрагмента, эффективно предохраняющих пространственную память животных от нарушений. С использованием ИФА гомогенатов мозга было показано, что только иммунизация фрагментом 155–164 рецептора р75 приводила к существенному снижению уровня бета-амилоида у экспериментальных животных. Таким образом, выявлены два иммуногенных фрагмента рецептора р75, которые могут стать основой для создания новых средств терапии болезни Альцгеймера.

  • КАЛЬПАИНЫ И ИХ ЭНДО- И ЭКЗОГЕННЫЕ РЕГУЛЯТОРЫ В РАЗЛИЧНЫХ МОДЕЛЯХ НЕЙРОДЕГЕНЕРАЦИИ

    КАНЦЕРОВА Н.П., ЛЫСЕНКО Л.А., НЕМОВА Н.Н., РЕНДАКОВ Н.Л. — 2014 г.

    На основании данных, полученных в серии экспериментов с лабораторными животными, сделаны заключения об изменении активности кальцийзависимых протеиназ в мозге крыс с индуцированной нейродегенерацией. Охарактеризованы свойства протеолитического и регуляторного компонентов кальпаиновой системы при действии нейротоксичных агентов – амилоидного -пептида и глутамата, а также установлены основные эндогенные регуляторные механизмы изменения интенсивности кальцийзависимого протеолиза. На изученных моделях нейродегенерации протестированы нейропротективные свойства экзогенных регуляторов кальпаинов, действующих по разным механизмам, – половых стероидов и регуляторов кальциевых каналов.

  • КЛЮЧЕВЫЕ ФЕРМЕНТЫ ДЕСТРУКЦИИ И АНГИОГЕНЕЗА КАК ФАКТОРЫ ПРОГРЕССИИ ОПУХОЛИ ПРИ ПЛОСКОКЛЕТОЧНОЙ КАРЦИНОМЕ ШЕЙКИ МАТКИ

    АНДРЕЕВА Ю.Ю., ЗАВАЛИШИНА Л.Э., КУГАЕВСКАЯ Е.В., СОЛОВЬЕВА Н.И., ТИМОШЕНКО О.С. — 2014 г.

    Ключевую роль в прогрессии опухоли играют два процесса – деструкция соединительно-тканного матрикса (СТМ) и ангиогенез. В процессе деструкции тканей ведущая роль принадлежит матриксным металлопротеиназам (ММП). Тканевые коллагеназы – ММП-1 и МТ1-ММП гидролизуют фибриллярные коллагены – основу СТМ и обеспечивают развитие инвазивного процесса. Желатиназы А и В (ММП-2 и ММП-9) гидролизуют коллаген IV типа – основу базальных мембран и способствуют развитию метастазирования. В регуляции их экспрессии и активности участвуют эндогенные активаторы и ингибиторы. Установлено, что ММП-9 высвобождает связанный с СТМ эндотелиальный фактор роста сосудов (VEGF) – основной индуктор ангиогенеза. В индукции синтеза VEGF принимает участие ангиотензин-превращающий фермент (АПФ) – ключевой фермент ренин-ангиотензиновой системы, который через ангиотензин II (АII) и его рецептор типа I – (АTIR) индуцирует синтез VEGF и стимулирует пролиферацию эндотелиальных клеток. Экспериментальные исследования посвящены изучению особенностей экспрессии ключевых ферментов деструкции и ангиогенеза при плоскоклеточной карциноме шейки матки (ПКШМ). Объекты исследования: ММП-1, МТ1-ММП, ММП-2 и ММП-9 и их эндогенные регуляторы ТИМП-1, ТИМП-2, а также АПФ. Работа проводилась на клиническом материале, содержащем образцы опухолевой ткани с учетом наличия или отсутствия метастазов в региональные лимфатические узлы и образцы морфологически нормальной ткани. Установлено, что основной вклад в деструктивный (инвазивный) потенциал карцином шейки матки, вносит увеличение экспрессии ММП-1, МТ1-ММП и ММП-9, низкая экспрессия ингибиторов – ТИМП-1 и ТИМП-2, и, в меньшей степени, – изменение экспрессии ММП-2. В метастазирующих опухолях обнаружено резкое увеличение экспрессии ММП-1 и ММП-9. Активность АПФ в опухоли в большинстве образцов была выше, чем активность в нормальной ткани. В прилегающей к опухоли морфологически нормальной ткани обнаружена существенная экспрессия ММП-1, ММП-2, ММП-9, а также АПФ, что вносит свой дополнительный вклад в увеличение деструктивного потенциала опухоли. Данные важны для понимания механизмов прогрессии опухоли, имеют прогностическое значение и могут влиять на терапевтическую стратегию в отношении пациента.

  • КОМПОЗИТЫ ПЕПТИДО-НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ С НАНОЧАСТИЦАМИ ДИОКСИДА ТИТАНА. III+. КИНЕТИКА ДИССОЦИАЦИИ ПНК ИЗ НАНОКОМПОЗИТОВ, СОДЕРЖАЩИХ ДНК/ПНК-ДУПЛЕКСЫ

    АМИРХАНОВ Н.В., АМИРХАНОВ Р.Н., ЗАРЫТОВА В.Ф. — 2014 г.

    При доставке пептидо-нуклеиновых кислот (ПНК) в клетки в составе нанокомпозитов TiO2·PL·ДНК/ПНК, состоящих из наночастиц диоксида титана, покрытых полилизином (PL), и ДНК/ПНК-дуплексов, важным является не только их транспорт в клетку, но и возможность управления скоростью высвобождения препарата из нанокомпозита за счет диссоциации иммобилизованного ДНК/ПНК-дуплекса, после чего ПНК уходит в раствор. Выявлено, что константа скорости диссоциации ДНК/ПНК-дуплекса в составе TiO2·PL·ДНК/ПНК-нанокомпозитов зависит от числа комплементарных пар оснований в иммобилизованном ДНК/ПНК-дуплексе. Времена полуудерживания ПНК в составе исследованных нанокомпозитов с числом перекрывания в дуплексе, равным 10, 12, 14 и 16 п.о., составляют соответственно 10, 14, 22 и 70 мин. Таким образом, показано, что скорость высвобождения ПНК-препарата из созданных нанокомпозитов можно регулировать, меняя число перекрывания комплементарных пар оснований в иммобилизованном ДНК/ПНК-дуплексе. Создаваемые TiO2·PL·ДНК/ПНК-нанокомпозиты в перспективе могут быть использованы с целью эффективной доставки терапевтически значимых ПНК для их селективного воздействия на патогенные нуклеиновые кислоты в клетке.

  • КОНЪЮГАТЫ СТРЕПТОКИНАЗА-ПОЛИЭТИЛЕНГЛИКОЛЬ С ПОВЫШЕННОЙ СТАБИЛЬНОСТЬЮ И СНИЖЕННЫМИ ПОБОЧНЫМИ ЭФФЕКТАМИ

    АЙСИНА Р.Б., ВАРФОЛОМЕЕВ С.Д., ГЕРШКОВИЧ К.Б., ГУЛИН Д.А., МУХАМЕТОВА Л.И., ТЮПА Д.В. — 2014 г.

    Ковалентные конъюгаты СК-ПЭГ2 и СК-ПЭГ5 с различными степенями модификации аминогрупп белка получены вариацией времени инкубации стрептокиназы (СК) с активированным полиэтиленгликолем (M 2 и 5 кДа, ПЭГ2 и ПЭГ5); изучены их свойства в сравнении со свойствами свободной СК in vitro. Показано, что максимально стабильные в плазме и сохраняющие 80% исходной фибринолитической активности конъюгаты СК-ПЭГ2 и СК-ПЭГ5 образуются при степенях модификации аминогрупп белка 54 и 52% соответственно. При взаимодействии данных конъюгатов с плазминогеном в эквимолярных концентрациях образуются активаторные комплексы плазмина (Пл) Пл.-ПЭГ2 и Пл.-ПЭГ5, максимальная амидазная активность которых равна активности комплекса Пл с нативной СК. Найдено, что каталитическая эффективность активации плазминогена (kПг/KПг) комплексом Пл.-ПЭГ2 немного выше (2.84 мин-1 мкM-1), а комплексом Пл.-ПЭГ5 ниже (1.17 мин-1 мкM-1), чем немодифицированным комплексом Пл. (2.1 мин-1 мкM-1). Исследование кинетики лизиса сгустков из плазмы крови человека и истощение уровней плазминогена и фибриногена в плазме под действием равных доз свободной СК и указанных конъюгированных образцов СК показало, что конъюгаты СК-ПЭГ2 и СК-ПЭГ5 обладают высокой тромболитической активностью (89 и 72% от активности свободной СК соответственно) и вызывают в 3.5–4 раза меньшие побочные эффекты, чем свободная СК. Полученные нами конъюгаты СК-ПЭГ2 и СК-ПЭГ5 с повышенной стабильностью в плазме и низким уровнем побочных эффектов могут быть использованы в терапии тромботических заболеваний.

  • МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ АФФИННО-ОЧИЩЕННЫХ ПРОТЕАСОМ ИЗ КЛЕТОК МИЕЛОГЕННОЙ ЛЕЙКЕМИИ ЧЕЛОВЕКА ЛИНИИ К562

    АРТАМОНОВА Т.О., ХОДОРКОВСКИЙ М.А., ЦИМОХА А.С. — 2014 г.

    Протеасомы осуществляют регулируемый протеолиз большинства белков в клетке и тем самым играют ключевую роль в регуляции различных клеточных процессов. Одним из важных этапов в понимании функций протеасом в клетке и механизмов их регуляции является определение субъединичного состава и посттрансляционных модификаций протеасом. Для решения этой задачи на примере клеток миелогенной лейкемии человека использована стратегия аффинной очистки протеасом с последующим масс-спектрометрическим анализом. Протеасомы очищали из стабильной клеточной линии К562, экспрессирующей субъединицу (PSMB4) 20S протеасомы, меченную по С-концу HTBH-пептидом, включающим два фрагмента His6, специфический сайт расщепления Tobacco Etch Virus (TEV)-протеазой и сигнальную последовательность для биотинилирования in vivo, методом нековалентного связывания – через образование комплекса биотина со стрептавидином с последующей элюцией посредством TEV-протеазы. С помощью MALDI-ICR-масс-спектрометрии идентифицированы все субъединицы 26S протеасомы, а также регуляторы PA200 и . Показано, что с протеасомами ассоциированы белки теплового шока, компоненты убиквитин-протеасомной системы и некоторые белки цитоскелета. Выявлен ряд новых сайтов фосфорилирования, убиквитинилирования и N-концевые модификации у 16 субъединиц протеасом. Представленный масс-спектрометрический анализ будет крайне полезен для дальнейших протеомных исследований протеасом при клеточном стрессе.

  • МЕТОДЫ ЭКСПРЕСС-АНАЛИЗА СТАФИЛОКОККОВОГО ЭНТЕРОТОКСИНА А В ПРОДУКТАХ ПИТАНИЯ

    БРОВКО Ф.А., ВАЛЯКИНА Т.И., ВЕРТИЕВ Ю.В., ГРИШИН Е.В., ЛЮБАВИНА И.А. — 2014 г.

    Разработаны неинструментальные методы обнаружения стафилоккокового энтеротоксина А (SEA) в пробах питьевых молочных продуктов и мясном бульоне с помощью иммунохроматографии (ИХ) и дот-анализа. В качестве детектируемого компонента при проведении ИХ использовали конъюгат моноклональных антител (МА) к SEA с коллоидным золотом (МА-КЗ); при проведении дот-анализа использовали конъюгат МА-КЗ или биотинилированные антитела к SEA и конъюгат стрептавидин-пероксидаза (STR-HRP). Проведено сравнение результатов анализа SEA разработанными методами и методом иммуноферментного анализа (ИФА). Предел обнаружения составил, нг/мл: 10 (ИХ), 20 (дот-анализ, МА-КЗ), 10 (дот-анализ, STR-HRP), 4 (ИФА). Продолжительность анализа, мин: 25 (ИХ), 60 (дот-анализ, MA-КЗ), 70 (дот-анализ, STR-HRP), 150 (ИФА). Простота и доступность разработанных неинструментальных методов обнаружения позволяют проводить с их помощью единичное и массовое тестирование в условиях недостаточно оборудованных лабораторий, а также во внелабораторных условиях.

  • МОДЕЛЬ ТРАНСЛОКАЦИИ СИБИРЕЯЗВЕННОГО ЭКЗОТОКСИНА ВНУТРЬ КЛЕТКИ-МИШЕНИ

    НОСКОВ А.Н. — 2014 г.

    На примере сибиреязвенного токсина предложен молекулярный механизм рецептор-опосредованного эндоцитоза для бинарных токсинов. В соответствии с этим механизмом внутрь клеток-мишеней из эндосомы проникают не отдельные эффекторные субъединицы, а олигомерный комплекс с общей структурой 7А + 7В. Для сибиреязвенного экзотоксина молекулярная масса такого комплекса составляет около 750 кДа.

  • МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МИШЕНИ ДЛЯ ПОИСКА ВЕЩЕСТВ, ОБЛАДАЮЩИХ ЭНДОТЕЛИОПРОТЕКТОРНЫМИ СВОЙСТВАМИ (ОБЗОРНАЯ СТАТЬЯ)

    ВОРОНКОВ А.В., ГЛУШКО А.А., ЧЕРНИКОВ М.В. — 2014 г.

    Нарушение функции эндотелия лежит в основе развития многих сердечно-сосудистых заболеваний, поэтому он становится самостоятельной мишенью терапевтического воздействия, а поиск новых веществ с эндотелиопротекторным действием является одной из перспективных задач фармакотерапии и медицинской химии. Эффективным инструментом для решения данной задачи является применение методов молекулярного моделирования. Применение этих методов возможно только при наличии детальной информации о трехмерном строении и функции молекулярных мишеней: рецепторов и ферментов, отвечающих за передачу сигналов как вне, так и внутри клеток эндотелия. В обзоре собрана информация о структуре и функциях различных макромолекул, вовлеченных в процесс регуляции сосудистого тонуса. Рассмотрена структура эндотелиальной NO-синтазы (КФ 1.14.13.39) (eNOS), ответственной за синтез оксида азота и вовлеченного в процесс регуляции сосудистого тонуса. С точки зрения регуляции активности eNOS подчеркивается важность ее субстрата L-аргинина, приводятся сведения о структуре и функциях транспортной системы L-аргинина. Также рассматриваются различные пути регуляции активности eNOS, среди которых активация и конкурентное ингибирование путем связывания экзогенных веществ с еe активным центром, ингибирование путем связывание кавеолина с еe оксигеназным доменом, а также регуляция путем фосфорилирования отдельных аминокислотных остатков eNOS протеинкиназами и их дефосфорилирования фосфатазами. Подчеркивается важность мембранных рецепторов эндотелиоцитов как мишеней для веществ с эндотелиопротекторной активностью. Среди них рецепторы эндотелина, фактора активации тромбоцитов, простагландинов, брадикинина, гистамина, серотонина, рецепторы, активируемые протеиназами. Подчеркивается важная роль ионных кальциевых и калиевых каналов сосудистых клеток в эндотелиопротекторном действии. Представленные в обзоре макромолекулы, в заключении, рассматриваются в качестве мишеней для поиска эндотелиопротекторных лекарственных препаратов предлагаемыми подходами и методами молекулярного моделирования.

  • НОВАЯ МЕТАЛЛОЭНДОПЕПТИДАЗА MORGANELLA MORGANII ZM

    ЗАМАЛЮТДИНОВА Н.М., МАРДАНОВА А.М., МИННУЛЛИНА Л.Ф., ШАРИПОВА М.Р. — 2014 г.

    В клетках Morganella morganii ZM обнаружили протеолитическую активность, которая ингибируется в присутствии о-фенантролина. Протеазы, содержащиеся в клеточном лизате M. morganii ZM, в отличие от гримелизина, неограниченно расщепляют скелетно-мышечный актин. Зимография с желатином позволила выявить в клетках этих бактерий несколько белков, расщепляющих желатин. Индивидуальная металлоэндопептидаза с молекулярной массой 35 кДа была выделена и очищена из клеточных лизатов M. morganii ZM с помощью сульфатаммонийного фракционирования и гидрофобной хроматографии.

  • НОВЫЙ ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЙ АНАЛОГ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ ТРАНСПОРТА АНАНДАМИДА В КЛЕТОЧНЫХ КУЛЬТУРАХ

    АКИМОВ М.Г., БЕЗУГЛОВ В.В., ГРЕЦКАЯ Н.М. — 2014 г.

    Впервые синтезирован новый флуоресцентный аналог анандамида, содержащий BODIPY -FL-флуорофор, присоединенный к арахидоновой кислоте через 2,2-(этилендиокси)-бис(этилендиамин). На клетках глиомы C6 крысы показано, что флуоресцентный аналог является субстратом клеточной системы захвата анандамида (Km 4.5 ± 0.9 мкМ, Vmax 20 ± 1 амоль/(мин ? клетка)).

  • ОПРЕДЕЛЕНИЕ ПРОПЕПТИДОВ ЛИТИЧЕСКИХ ЭНДОПЕПТИДАЗ ALPA И ALPB LYSOBACTER SP. ХL1 МЕТОДОМ СЭНДВИЧ-ИММУНОФЕРМЕНТНОГО АНАЛИЗА НА ОСНОВЕ МОНОКЛОНАЛЬНЫХ АНТИТЕЛ

    БРОВКО Ф.А., ВАСИЛЬЕВА Н.В., КАРАТОВСКАЯ А.П., КРАСОВСКАЯ Л.А., ЛАТЫПОВ О.Р., ЛЕДОВА Л.А., РУДЕНКО Н.В., СТЕПНАЯ О.А., ЦФАСМАН И.М. — 2014 г.

    Внеклеточные литические эндопептидазы AlpA и AlpB грамотрицательной бактерии Lysobacter sp. ХL1 имеют высокую степень гомологии и синтезируются в виде препробелков, состоящих из сигнального пептида, пропептида и зрелой части. В данной работе получено два моноклональных антитела против пропептида эндопептидазы AlpA (ProA) и одиннадцать против пропептида эндопептидазы AlpB (ProB). Константы аффинности для антител к ProA составляли 2.9 ? 109 и 3.5 ? 109 М-1, а для антител к ProB – от 1.5 ? 108 до 2.2 ? 109 М-1. Полученные антитела не обладали иммуноперекрестной реактивностью между собой, а также со зрелыми формами ферментов. На основе моноклональных антител разработан сэндвич-иммуноферментный анализ, позволяющий количественно определять эти пропептиды в растворенной нативной форме. Линейный диапазон определения ProA составил 1.5–100.0 нг/мл с ошибкой измерения 6%, а для определения ProB – 0.2–6.25 нг/мл с ошибкой 6%. С помощью разработанного метода выявлены пропептиды ProA и ProB в лизате клеток Lysobacter sp. ХL1 в количестве 1.18 ± 0.03 и 0.096 ± 0.002 нг на 1 ОЕ540 бактериальной культуры соответственно. Иммунохимический метод определения разных форм литических эндопептидаз AlpA и AlpB может быть полезен при решении вопросов, связанных с их секрецией в окружающую среду.

  • ОПРЕДЕЛЕНИЕ ТОКСИНОВ STAPHYLOCOCCUS AUREUS МЕТОДОМ ИММУНО-ПЦР

    ДМИТРЕНКО О.А., ЗАВРИЕВ С.К., КОМАЛЕВА Р.Л., МАЕРЛЕ А.В., ПЕТРОВА Е.Э., РЯЗАНЦЕВ Д.Ю., СЕРГЕЕВ И.В., ТРОФИМОВ Д.Ю. — 2014 г.

    Разработаны высокочувствительные тест-системы для определения двух стафилококковых токсинов: энтеротоксина А (SEA) и токсина синдрома токсического шока (TSST), основанные на методе иммуно-ПЦР. Ключевым элементом разработанных систем явилось получение надмолекулярных комплексов бисбиотинилированных олигодезоксинуклеотидов со стрептавидином, которые были использованы в качестве ДНК-метки. Исследования специфичности разработанных тест-систем показали отсутствие перекрестных реакций при определении SEA и TSST. Чувствительность определения этих токсинов в супернатантах культур S. aureus составила не менее 10 пг/мл.