научный журнал по биологии Молекулярная биология ISSN: 0026-8984

Архив научных статейиз журнала «Молекулярная биология»

  • АССОЦИАЦИЯ ПОЛИМОРФНЫХ ЛОКУСОВ ГЕНОВ, УЧАСТВУЮЩИХ В МЕТАБОЛИЗМЕ НИКОТИНА И ТОКСИЧЕСКИХ ВЕЩЕСТВ СИГАРЕТНОГО ДЫМА (CHRNA3/5, CYP2A6, NQO1), А ТАКЖЕ В РЕПАРАЦИИ ДНК (XRCC1, XRCC3, XPC, XPA), С ХРОНИЧЕСКОЙ ОБСТРУКТИВНОЙ БОЛЕЗНЬЮ ЛЕГКИХ

    АЗНАБАЕВА Ю.Г., АХМАДИШИНА Л.З., БУРДЮК Ю.В., ВИКТОРОВА Т.В., ЗАГИДУЛЛИН Ш.З., КОРЫТИНА Г.Ф., КОЧЕТОВА О.В. — 2014 г.

    В работе изучали, связаны ли полиморфные варианты генов CHRNA5/A3, CYP2A6, NQO1, XPС, XRCC1, XRCC3, XPD, XPA с возникновением и развитием хронической обструктивной болезни легких в этнической группе татар. Показано, что с возникновением этой болезни ассоциированы локусы CHRNA5 (rs16969968) (P = 0.0001, OR = 2.24 в рецессивной модели) и CHRNA3 (rs1051730) (P = 0.0001, OR = 2.72 в рецессивной модели). Риск развития заболевания связан с вариантом без делеции локуса CYP2A6 (del) (P = 0.00001, OR = 2.77). Локусы NQO1 (rs1131341), XRCC1 (rs25487), XRCC3 (rs861539), XPС (rs2228001) и XPA (rs1800975) также ассоциированы с развитием этой болезни (P = 0.000001, OR = = 2.67; P = 0.00001, OR = 0.51; P = 0.0003, OR = 1.76; P = 0.0004, OR = 0.54 и P = 0.007, OR = 0.74 в аддитивной модели). Установлена взаимосвязь между статусом курения и локусом XPA (rs1800975) (Pinteract = 0.002), а локусы rs16969968, rs1051730 кластера генов CHRNA3/5 связаны с развитием заболевания только в группе курильщиков. У носителей делеции гена CYP2A6 (CYP2A6*4) снижается показатель индекса курения (P = 0.0019). Генотип TT локуса XRCC3 (rs861539) характеризуется более низкими показателями функции внешнего дыхания: жизненной емкости легких (P = 0.0487), функции форсированной жизненной емкости легких (P = 0.0032) и объема форсированного выдоха за первую секунду (P = 0.02). Величина показателя форсированной жизненной емкости легких зависит от генотипа локуса XPA (rs1800975) (P = 0.0028).

  • АССОЦИАЦИЯ ПОЛИМОРФНЫХ МАРКЕРОВ ARG72PRO ГЕНА-ОНКОСУПРЕССОРА TP53 И T309G ГЕНА MDM2 C РИСКОМ РАЗВИТИЯ НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНОГО РАКА ЛЕГКОГО У РУССКИХ МОСКОВСКОГО РЕГИОНА

    АТКАРСКАЯ М.В., БРАГА Э.А., БУРДЕННЫЙ А.М., ЖИЖИНА Г.П., ЗАВАРЫКИНА Т.М., КАЗУБСКАЯ Т.П., ЛОГИНОВ В.И., НОСИКОВ В.В. — 2014 г.

    Изучена ассоциация полиморфных маркеров Arg72Pro гена ТР53 и T309G гена МDM2 с риском развития немелкоклеточного рака легкого у русских жителей Московского региона. Обнаружена ассоциация генотипа Pro/Pro полиморфного маркера Arg72Pro гена ТР53 (OR = 5.46, p = 8 ? 10-6) и генотипа TG полиморфного маркера T309G гена MDM2 (OR = 5.57, p = 0.007) с повышенным риском развития немелкоклеточного рака легкого. Показана ассоциация предрасполагающих генотипов Pro/Pro полиморфного маркера Arg72Pro гена ТР53 и TG полиморфного маркера T309G гена MDM2 с риском развития аденокарциномы (OR = 8.71, p = 3 ? 10-6 и OR = 8.13, p = 0.003) и плоскоклеточного рака легкого (OR = 4.2, p = 0.001 и OR = 7.02, p = 0.002). Обнаружена ассоциация сочетанных генотипов двух полиморфных маркеров Arg72Pro и T309G генов ТР53 и MDM2 как с риском развития немелкоклеточного рака легкого, так и двух его гистотипов – аденокарциномы и плоскоклеточного рака легкого (OR = 7.9, p = 0.01; OR = 9.12, p = 0.02; OR = 7.31, p = 0.03 соответственно).

  • АССОЦИАЦИЯ ПОЛИМОРФНЫХ МАРКЕРОВ ГЕНОВ SLC18A1, TPH1 И RELN С РИСКОМ РАЗВИТИЯ ПАРАНОИДНОЙ ФОРМЫ ШИЗОФРЕНИИ

    ГАЛАКТИОНОВА Д.Ю., ГАРЕЕВА А.Э., НАСЕДКИНА Т.В., ХУСНУТДИНОВА Э.К. — 2014 г.

    Разработан биочип для анализа полиморфных маркеров в генах, ассоциированных с риском развития шизофрении, – DISC1, RELN, ZNF804A, PLXNA2, COMT, SLC18A1, CACNA1C, ANK3, TPH1, PLAA и SNAP-25. Определены частоты генотипов и аллелей этих генов у 198 больных шизофренией и 192 здоровых жителей Башкортостана ( русских и татар). Установлено, что частота аллеля A (p = 0.007) и генотипа АА (p = 0.002) полиморфного маркера rs2270641 A>C гена SLC18A1 у больных параноидной шизофренией была ниже, чем у здоровых индивидов. Частота генотипа АА локуса rs1800532 C>A гена TPH1 (p = 0.036) в группе больных шизофренией была выше, чем у здоровых. У больных параноидной шизофренией этнических татар частота аллеля С (p = 0.039) полиморфного маркера rs7341475 C>T гена RELN была ниже, а генотипа АА полиморфного маркера rs1800532 C>A гена TPH1 (p = 0.019, OR = 2.52, CI = 1.18–5.38) выше, чем у здоровых индивидов. Частота аллеля С (p = 0.0001) и генотипа GC (p = 0.0001) полиморфного маркера rs1327175 G>С гена PLXNA2 повышена в группе больных параноидной шизофренией с отягощенной наследственностью. Полученные данные дают основание полагать, что полиморфные маркеры генов SLC18A1, TPH1, RELN ассоциированы с риском развития шизофрении.

  • АФФИННАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ И ПРОТЕОМНЫЙ СКРИНИНГ КАК ЭФФЕКТИВНЫЙ МЕТОД ПОИСКА БЕЛКОВ-МИШЕНЕЙ ДЛЯ БЕЛКА S100A4

    КОШЕЛЕВ Ю.А. — 2014 г.

    Аффинная хроматография с последующей идентификацией селективно связавшихся белков может служить эффективным способом обнаружения новых биологически значимых молекулярных взаимодействий. При оптимизации данного метода необходимо учитывать структуру молекулы, ее поверхностный заряд, а также возможность регулирования конформационных изменений, влияющих на гидрофобные свойства ее поверхности. Используя данный метод, мы идентифицировали новые белки-мишени для белка S100A4, среди которых оказались белки цитоскелета Sept2, Sept7, Sept11 и транскрипционный кофактор Ddx5. Взаимодействие с септинами могло бы объяснить механизм влияния белка S100A4 на увеличение подвижности клетки, а с кофактором Ddx5 – механизм регулирования уровня экспрессии таких генов, как гена Е-кадгерина, р21 (Waf1/Cip1), Bnip3 и других. Предложенный протокол может быть применим для поиска белков-мишений других членов семейства S100, молекулы которых имеют высоко гомологичную первичную и пространственную структуры.

  • ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ МЕЖДУ DAXX И БЕЛКОМ E2 ВИРУСА ПАПИЛЛОМЫ ЧЕЛОВЕКА (ТИП 16)

    LI L., LIU A.Y., LIU L.Z., LIU Y., TANG S.Y., WAN Y.P., YU M.J., ZHANG Y. — 2014 г.

    Целью работы стало изучение взаимодействия белка E2 вируса папилломы человека (HPV16) и белка, ассоциированного с доменом смерти (Daxx). Локализацию и колокализацию белка промиелоцитарного лейкоза (PML) и E2 с Daxx в клетках Caski наблюдали с помощью метода непрямой иммунофлуоресценции. Взаимодействие E2 с Daxx анализировали методами коиммунопреципитации и вестерн-блотинга, а также в дрожжевой двугибридной системе. Флуоресцентные сигналы от Daxx и PML главным образом оказались соответственно в цитоплазме и в ядре клеток Caski. На совмещенном снимке по-прежнему были видны оба типа сигнала. В то же время при совмещении красного сигнала от E2 и зеленого сигнала от Daxx они отображаются как желтый в цитоплазме клеток Caski. Дрожжи, трансформированные одновременно плазмидами pGBKT7/Daxx и pGADT7/E2 либо pGADT7/E2 TAD, могут расти на средах SD/-Trp-Leu-His и SD/-Trp-Leu-His-Ade. Таким образом, в клетках Caski белок Daxx не локализуется совместно с PML, но колокализуется с E2 HPV16 – в основном в цитоплазме. Также показано, что E2 HPV16 и его домен активации транскрипции (TAD) могут взаимодействовать с Daxx.

  • ВКЛАД АКТИВНЫХ ФОРМ КИСЛОРОДА В БАКТЕРИЦИДНОЕ ДЕЙСТВИЕ ХИНОЛОНОВ – ИНГИБИТОРОВ ДНК-ГИРАЗЫ

    ЗАВИЛЬГЕЛЬСКИЙ Г.Б., КОТОВА В.Ю., МИРОНОВ А.С. — 2014 г.

    ), проводимого супероксиддисмутазами SodA и SodB, c последующей реакцией Фентона и формированием токсичного гидроксил-радикала OH. При низких концентрациях хинолонов (налидиксовая кислота <20 мкг/мл; норфлоксацин <500 нг/мл) вклад активных форм кислорода в их антимикробный эффект практически отсутствует. ::lux; pKatG ‘::lux. Показано, что хинолоны (налидиксовая кислота, норфлоксацин) индуцируют в клетках E. coli SOS-ответ и окислительный стресс с образованием супероксид-аниона O . Определены основные параметры SOS-ответа и окислительного стресса в зависимости от концентрации хинолонов. Образование супероксид-аниона O происходит практически одновременно с SOS-ответом. Мутантный штамм E. coli sodA sodB, не содержащий активных форм супероксиддисмутаз SodA и SodB, характеризуется повышенной резистентностью к хинолонам по сравнению с клетками дикого типа. Бактерицидное действие хинолонов, взятых в высоких концентрациях (налидиксовая кислота – >20 мкг/мл; норфлоксацин – >500 нг/мл), частично связано с превращением супероксид-аниона в пероксид водорода (H2O2), проводимого супероксиддисмутазами SodA и SodB, c последующей реакцией Фентона и формированием токсичного гидроксил-радикала OH. При низких концентрациях хинолонов (налидиксовая кислота <20 мкг/мл; норфлоксацин <500 нг/мл) вклад активных форм кислорода в их антимикробный эффект практически отсутствует.

  • ВЛИЯНИЕ СВЯЗЫВАНИЯ ОРТОСТЕРИЧЕСКИХ ЛИГАНДОВ НА КОНФОРМАЦИОННУЮ ПОДВИЖНОСТЬ -АДРЕНОРЕЦЕПТОРА. МЕТОД МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ

    НОВИКОВ Г.В., СИВОЖЕЛЕЗОВ В.С., ШАЙТАН К.В. — 2014 г.

    Методом молекулярной динамики исследовано влияние связывания ортостерических лигандов на конформационную подвижность -адренорецептора. Анализ траекторий молекулярной динамики показал, что в апоансамбле рецептора обнаружена небольшая доля конформеров, структурно схожих с его активными формами. В этих структурах регистрировали отклонение трансмембранной спирали VI на величину порядка 2.5–3 A по сравнению с неактивной конформацией. Показано, что явление лиганднезависимой (конститутивной) активности рецептора связано со структурной подвижностью этого белка. С другой стороны, образование комплекса рецептора с полным агонистом приводило к смещению физико-химического равновесия рецептора в сторону его активного подсостояния. Наконец, связывание обратного агониста преимущественно стабилизировало рецептор в области его неактивных конформаций. Таким образом, связывание обратных агонистов является универсальным способом ингибирования спонтанной активности лигандактивируемых рецепторов in vivo. Полученные результаты указывают на то, что связывание лигандов должно приводить к перераспределению предсуществующих конформационных степеней свободы рецептора, а не является движущей силой структурных изменений в нем. Следовательно, ансамбль биологически значимых конформаций рецептора уже предопределен на уровне его пространственной архитектуры и может использоваться клеткой в соответствии с ее физиологическими потребностями.

  • ВНУТРИКЛЕТОЧНАЯ ЛОКАЛИЗАЦИЯ РЕГУЛЯТОРНЫХ БЕЛКОВ ДЕНСОВИРУСА РЫЖЕГО ТАРАКАНА BLATTELLA GERMANICA

    SCHAL C., КАПЕЛИНСКАЯ Т.В., МАРТЫНОВА Е.У., МУХА Д.В. — 2014 г.

    Методом вестерн-блотинга ядерных и цитоплазматических экстрактов инфицированной денсовирусом BgDNV пересеваемой культуры клеток рыжего таракана Blattella germanica исследована внутриклеточная локализация регуляторных белков изучаемого вируса. Показано, что два белка (NS1 и NS3) характеризуются преимущественно ядерной локализацией, в то время как белок NS2 равномерно распределен между ядром и цитоплазмой. Полученные данные важны для понимания потенциальных функций регуляторных белков денсовирусов. Внутриклеточная локализация белка NS3 денсовирусов определена впервые.

  • ГЕНЕТИЧЕСКИ МОДИФИЦИРОВАННЫЕ ЖИВОТНЫЕ КАК МОДЕЛИ ПАТОЛОГИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА ПРИ ПСОРИАЗЕ

    БРУСКИН С.А., МЕЗЕНЦЕВ А.В., СОБОЛЕВА А.Г. — 2014 г.

    Псориаз – хроническое рецидивирующее заболевание, поражающее преимущественно кожу и имеющее аутоиммунную природу. Изучать развитие псориаза в контролируемых условиях, а также отдельные аспекты патологического процесса позволяют экспериментальные модели этого заболевания. Получено множество мышиных моделей, которые в большей или меньшей степени воспроизводят проявления псориаза у человека. Генетически модифицированные животные помогают отыскивать новые гены, мутации в которых могут стать причиной болезни, а также выявлять новые терапевтические мишени. На лабораторных животных проводится тестирование новых препаратов и терапевтических приемов. Цель нашего обзора состояла в анализе опубликованных данных о лабораторных животных, используемых для моделирования псориатического процесса.

  • ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЛОКУСЫ, КОНТРОЛИРУЮЩИЕ ВЕС СЕЛЕЗЕНКИ И УРОВЕНЬ АРТЕРИАЛЬНОГО ДАВЛЕНИЯ, У КРЫС ЛИНИИ НИСАГ СО СТРЕСС-ЗАВИСИМОЙ АРТЕРИАЛЬНОЙ ГИПЕРТЕНЗИЕЙ

    АБРАМОВА Т.О., МАРКЕЛЬ А.Л., РЕДИНА О.Е., СМОЛЕНСКАЯ С.Э. — 2014 г.

    В последние два десятилетия показана важная роль иммунной системы в процессе развития гипертонии. Цель настоящей работы – генетическое картирование признаков “абсолютный вес селезенки” и “относительный вес селезенки” и сравнение обнаруженных нами локусов с локусами, которые описаны ранее для признаков “артериальное давление в покое и при стрессе”. В качестве модельной системы использовали крыс линии НИСАГ с наследуемой артериальной гипертензией, индуцируемой стрессом. Изучали группу самцов-гибридов F2 (НИСАГ ? WAG) в возрасте 6 мес., полученных при скрещивании гипертензивных крыс линии НИСАГ и нормотензивных крыс линии WAG. Впервые найден достоверный локус в дистальной части хромосомы 1 и пять вероятных локусов, ассоциированных с признаком “относительный вес селезенки”, а также четыре вероятных локуса, ассоциированных с признаком “абсолютный вес селезенки”. Достоверный локус на хромосоме 1 является общим для признаков “относительный вес селезенки”, “уровень артериального давления в покое” и “уровень артериального давления при стрессе” у крыс линии НИСАГ. Развитие стресс-зависимой гипертензии у крыс этой линии может быть связано с изменением генетического контроля функции селезенки.

  • ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И ВЗАИМООТНОШЕНИЯ ПОПУЛЯЦИЙ СЕВЕРНОЙ ЕВРАЗИИ ПО ПОЛИМОРФНЫМ ИНСЕРЦИЯМ ALU-ЭЛЕМЕНТА

    ВОЕВОДА М.И., СТЕПАНОВ В.А., ХАРЬКОВ В.Н., ХИТРИНСКАЯ И.Ю. — 2014 г.

    Используя набор из восьми полиморфных Alu-инсерций, впервые охарактеризовали аутосомный генофонд населения Сибири, Средней Азии и Дальнего Востока (27 популяций 12 этнических групп). Результаты анализа свидетельствуют о значительном уровне генетического разнообразия в популяциях Северной Евразии и о существенной дифференциации генофонда населения этого региона. Установлено, что в локусе CD4 частота аллеля Alu (–) обратно пропорциональна количеству “монголоидного компонента” популяции. Наименьшую частоту Alu-делеции в локусе CD4 имели эскимосы (0.012), а наибольшую – русские и украинцы (0.35). Показано, что европеоидные популяции Северной Евразии (русские, таджики, узбеки), так же как тюркские этнические группы Южной Сибири (алтайцы, тувинцы) и популяции хантов и манси являются реципиентами значительного потока генов по сравнению с этносами Восточной Сибири и Дальнего Востока. Результаты корреляционного анализа свидетельствуют о связи генетических расстояний с антропологическими характеристиками популяций.

  • ГЛЮКОЗА В ВЫСОКОЙ КОНЦЕНТРАЦИИ СТИМУЛИРУЕТ МЕЖКЛЕТОЧНЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ЧЕРЕЗ ЩЕЛЕВЫЕ КОНТАКТЫ В КУЛЬТУРЕ НЕОНАТАЛЬНЫХ ФИБРОБЛАСТОВ СЕРДЦА ЧЕРЕЗ АКТИВАЦИЮ AMPK

    CHEN F., CHEN F.-X., FU G.-S., HU S.-J., MOU Y., ZHAO W.-T. — 2014 г.

    Фибробласты сердца, как известно, необходимы для адаптивных ответов в патогенезе сердечно-сосудистых заболеваний, а усиление межклеточных коммуникаций в миокардиальных клетках и фибробластах сердца выступает как ключевой фактор в поддержании функциональной целостности сердца. AMP-активируемая киназа (AMPK) – ключевая сигнальная киназа стресса – играет важную роль в выживании клеток и в усилении их функций. Однако лежащие в основе этих явлений связи между AMPK и щелевыми межклеточными контактами (GJIC) пока слабо изучены. В представленной работе связь между AMPK и GJIC в неонатальных фибробластах сердца, обработанных глюкозой в высокой концентрации, оценивали по миграции фибробластов, переносу красителя и экспрессии коннексина 43 (Cx43). 5-аминоимидазол-4-карбоксамид- -D-рибофуранозид (AICAR) и соединение C (CC) использованы для регуляции активности AMPK. Уровни миграции клеток и экспрессии белка Cx43 в неонатальных фибробластах сердца возрастали в ходе обработки глюкозой в высокой концентрации, что сопровождалось улучшением передачи красителя. Кроме того, высокие концентрации глюкозы стимулировали обильное фосфорилирование AMPK. При ингибировании фосфорилирования AMPK с помощью CC снижались уровни переноса красителя, миграции клеток и экспрессии белка Cx43 в неонатальных фибробластах сердца, тогда как активация AMPK с помощью AICAR имитировала процессы, индуцируемые глюкозой в высокой концентрации: миграцию клеток, экспрессию белка Cx43 и усиление переноса красителя. Похоже, что AMPK участвует в регуляции GJIC в неонатальных фибробластах сердца, обработанных глюкозой в высокой концентрации, включая миграцию клеток, перенос красителя, экспрессию и распределение Cx43.

  • ДИНАМИКА ОТВЕТА НА ТЕПЛОВОЙ ШОК ПРИ НАРУШЕНИИ ДЕЙСТВИЯ ОСНОВНОГО ФАКТОРА ТРАНСКРИПЦИИ (HSF)

    ГАРБУЗ Д.Г., ЗАЦЕПИНА О.Г., ФУНИКОВ С.Ю. — 2014 г.

    Экспрессия генов hsp регулируется универсальным фактором транскрипции теплового шока (HSF). Термочувствительная линия hsf 4 Drosophila melanogaster, мутантная по гену hsf, характеризуется отсутствием индукции всех генов hsp в ответ на тепловой шок. В представленной работе показано, что физиологическая функция HSF4, несмотря на ее подавление в результате теплового шока, не утрачивается полностью и со временем восстанавливается даже после сильного теплового воздействия. Проанализирована динамика накопления и деградации продуктов генов hsp на транскрипционном и трансляционном уровне. Показано, что индукция генов hsp, особенно гена hsp68, у мух мутантной линии происходит слабее, чем в контрольной линии с геном hsf дикого типа. Таким образом, несмотря на то, что HSF4 вызывает отсроченную активацию генов hsp, ответ линии hsf 4 на тепловой шок остается неполноценным.

  • ДИНАМИЧЕСКИЕ XАРАКТЕРИСТИКИ ГЕРМИНАЛЬНОЙ ГРАНУЛЫ PING-ТЕЛЬЦА В СЕМЕННИКАХ DROSOPHILA MELANOGASTER

    КИБАНОВ М.В., НОСОВ Г.А., ОЛЕНИНА Л.В. — 2014 г.

    Изучены динамические характеристики piNG-тельца – крупной околоядерной гранулы, обнаруженной в сперматоцитах семенников Drosophila. piNG-тельце содержит рибонуклеопротеиновые комплексы, вовлеченные в piРНК-сайленсинг геномных повторов, включая транспозоны, в премейотических сперматоцитах с участием коротких piРНК. Конфокальная микроскопия фиксированных и нативных препаратов семенников показала, что piNG-тельце – подвижная структура, не занимающая постоянного положения у поверхности ядра относительно хромосомных территорий. FRAP-анализ выявил высокую скорость обмена молекул РНК-хеликазы Vasa в составе piNG-тельца и малых околоядерных гранул с цитозольным пулом Vasa. Нарушение сборки микротрубочек цитоскелета не влияет на стабильность piNG-тельца и малых гранул. Мы предполагаем, что сочетание подвижности piNG-тельца и постоянного обмена молекул белка Vasa обеспечивает эффективное “сканирование” всего объема цитоплазмы первичных сперматоцитов и своевременное распознавание и разрушение нежелательных транскриптов повторяющихся элементов генома.

  • ИЗМЕНЕНИЕ СВОЙСТВ ПРИОНА [PSI+] ПРИ КОМБИНИРОВАНИИ АМИНОКИСЛОТНЫХ ЗАМЕН В N-ДОМЕНЕ БЕЛКА SUP35

    БОНДАРЕВ С.А., ЖУРАВЛЕВА Г.А., ТРУБИЦИНА Н.П., ШИРОКОЛОБОВА Е.Д. — 2014 г.

    Прион [PSI +] – амилоидная изоформа фактора терминации трансляции Sup35 (eRF3). Несмотря на продолжительную историю исследований прионных амилоидов, структурная организация этих белковых агрегатов остается неизвестной. За образование прионных амилоидов Sup35р отвечает N-концевой домен этого белка, формирующий, согласно современным представлениям, суперскладчатую -структуру. Ранее мы получили пять двойных мутаций в участке SUP35, кодирующем прионный домен, и изучили свойства мутантных белков. Мутации sup35-M1 (YQ46-47KK) и sup35-M2 (QQ61-62KK) приводили к потере приона [PSI +], в то время как остальные мутантные аллели (sup35-M3, QQ70-71KK; sup35-M4, QQ80-81KK и sup35-M5 QQ89-90KK) поддерживали прион. С целью более детального изучения эффекта каждого аллеля на агрегацию Sup35р мы охарактеризовали поддержание и свойства приона [PSI+] в штаммах дрожжей с сочетанием разных комбинаций мутантных аллелей. Полученные нами данные позволили уточнить предполагаемую организацию -слоев, образуемых отдельными участками прионного домена Sup35p, в составе амилоида. Нами также получены свидетельства того, что мутации sup35-M2 и sup35-M4 меняют структуру прионных агрегатов. Дестабилизация приона под влиянием этих мутаций, судя по всему, связана со снижением эффективности фрагментации гетероагрегатов шаперонами.

  • ИЗМЕНЕНИЯ ПРОФИЛЯ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ ПРИ НЕСОВМЕСТИМОМ ВЗАИМОДЕЙСТВИИ МЕЖДУ LILIUM REGALE WILSON И FUSARIUM OXYSPORUM F. SP. LILII, ВЫЯВЛЕННЫЕ МЕТОДАМИ СУПРЕССИОННОЙ ВЫЧИТАЮЩЕЙ ГИБРИДИЗАЦИИ И АНАЛИЗА НА ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫХ МИКРОМАТРИЦАХ

    CHEN C., GE F., HE H., LIU D., RAO J., ZHANG N. — 2014 г.

    Фузариозное увядание, вызываемое почвенным патогенным грибом Fusarium oxysporum f. sp. lilii, – одно из основных заболеваний лилий (Lilium L.). С целью определения набора генов Lilium regale Wilson, уровень экспрессии которых изменяется в ответ на заражение F. оxysporum, создана библиотека кДНК из клеток корня L. regale, инфицированного F. оxysporum. С помощью супрессионной вычитающей гибридизации (SSH) выявлено 585 уникальных EST. Изменения профиля экспрессии генов L. regale при несовместимом взаимодействии L. regale и F. oxysporum обнаружены также при помощи анализа на олигонуклеотидных микроматрицах – полученные 585 EST сравнивали с кДНК восточно-гибридной лилии сорта ‘Siberia, восприимчивой к F. oxysporum. Анализ профилей экспрессии показал, что в реакции раннего ответа L. regale на инфицирование F. oxysporum вовлечены гены, кодирующие белки, связанные с патогенезом (PR), антиоксидантные ферменты и ферменты, вовлеченные в процессы вторичного метаболизма, факторы транскрипции, сигнальные белки, а также большое число генов с неизвестными функциями. При помощи количественной ОТ-ПЦР подтверждена правильность анализа на олигонуклеотидных микроматрицах. В представленной работе выявлены гены L. regale, экспрессия которых изменяется при взаимодействии с F. oxysporum, что помогает понять молекулярный механизм, определяющий устойчивость L. regale к F. oxysporum.

  • ИНДУЦИРОВАНИЕ МЕЖМОЛЕКУЛЯРНОЙ АССОЦИАЦИИ ДНК АМФИФИЛЬНЫМИ ПРОИЗВОДНЫМИ 1,3-ДИАЗААДАМАНТАНА С ГИДРОФОБНЫМИ БОКОВЫМИ ЦЕПЯМИ

    АРУТЮНЯН Г.Л., БОЧАРОВА Т.Н., ВОЛОДИН А.А., ГАБРИЕЛЯН А.Г., КАЛЮЖНЫЙ Д.Н., МАМАЕВА О.К., СМИРНОВА Е.А., ЩЕЛКИНА А.К. — 2014 г.

    Известно, что некоторые лиганды поликатионной природы эффективно ускоряют реакцию обмена гомологичных нитей ДНК. Еще один класс соединений, эффективно ускоряющих эту реакцию в системе коротких олигонуклеотидов, – амфифильные производные 1,3-диазаадамантанов. Показано, что ускорению реакции обмена нитей способствовала бoльшая длина гидрофобных боковых групп 1,3-диазаадамантанов. В данной работе оптическими методами исследовано взаимодействие c ДНК двух производных 1,3-диазаадамантанов с разной длиной боковых цепей. По увеличению интенсивности флуоресценции зонда 1-анилино-8-нафтален сульфоната определены области концентраций, в которых исследуемые 1,3-диазаадамантаны образуют мицеллы, а также определена область концентраций, при которых соединения существуют в виде истинных растворов. Афинность 1,3-диазаадамантанов к ДНК изучена методом вытеснения флуоресцирующего интеркалятора тиазолового оранжевого. Значительное увеличение гидродинамического объема короткой шпильки ДНК в комплексе с 1,3-диазаадамантанами наблюдали по возрастанию поляризации флуоресценции зонда бромистого этидия, связанного с ДНК. Межмолекулярную ассоциацию олигонуклеотидов ДНК при связывании с 1,3-диазаадамантанами подтвердили по безызлучательному переносу энергии в системе эквимолярной смеси флуоресцентномеченых шпилек. Показано, что количество положительных зарядов на производных 1,3-диазаадамантанов влияет на их афинность к ДНК, тогда как бoльшая длина боковых цепей обеспечивает эффективное межмолекулярное взаимодействие ДНК.

  • ИНДУЦИРУЕМЫЕ ДЕКВАЛИНОМ ИЗМЕНЕНИЯ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ФУНКЦИЙ ПРЕДШЕСТВУЮТ ОКИСЛИТЕЛЬНОМУ СТРЕССУ И АПОПТОЗУ В ЛИНИИ КЛЕТОК РС-3 РАКА ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ЧЕЛОВЕКА

    BOYANO-ADANEZ M.C., ESTAN M.C., GANAN-GOMEZ I., GARCIA-PEREZ A.I., MAKOWSKA K., SANCHO P. — 2014 г.

    Митохондрии играют центральную роль в разнообразных физиологических и патологических состояниях, ассоциированных с выживанием и смертью клеток. Делокализованные липофильные катионы, такие как деквалин (DQA), накапливаются в раковых клетках, в которые они привлекаются высоким отрицательным трансмембранным потенциалом митохондрий. DQA проявляет сильную противоопухолевую активность в отношении злокачественных клеток разного типа, в том числе клеток РС-3 рака предстательной железы. Инкубация клеток с DQA в концентрации 1.5–100 мкМ в течение 24 и 48 ч снижает их жизнеспособность, что вместе с утратой трансмембранного потенциала митохондрий приводит к увеличению продукции активных форм кислорода и индуцирует смерть клеток по зависимому от каспазы 3 апоптотическому пути. Показано, что DQA вызывает зависимую от времени и концентрации смерть клеток, степень которой меняется от умеренной до сильной. Наибольший эффект достигается при инкубации клеток с 10 мкМ DQA в течение 48 ч, что может определяться особенностями кинетики накопления DQA в митохондриях, а также механизмами клеточной смерти, индуцируемой DQA. Эти данные показывают, что DQA можно рассматривать в качестве перспективного агента, который действует на клетки линии РС-3 рака предстательной железы человека и активирует каспазазависимый путь апоптоза. Этот факт указывает на возможные пути применения DQA в терапии рака.

  • ИНТРОГРЕССИЯ МАРКЕРОВ ЯДЕРНОЙ И МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК MUS MUSCULUS MUSCULUS В АБОРИГЕННЫЕ ПОПУЛЯЦИИ МЫШЕЙ СРЕДНЕЙ АЗИИ (M. M. WAGNERI) И ЮГА СИБИРИ (M. M. GANSUENSIS)

    СПИРИДОНОВА Л.Н. — 2014 г.

    Исследована изменчивость нуклеотидных последовательностей второго интрона гена гемоглобина b1-цепи (Hbb-b1) и полного контрольного региона митохондриальной ДНК (D-петля) у аборигенных и синантропных популяций Mus musculus wagneri Средней Азии и M. m. gansuensis юга Сибири. Показано, что частоты встречаемости варианта гемоглобина Hbbw1 в природных и городских популяциях мышей неодинаковы. Все мыши из природных биотопов исследованных территорий обладают типом мтДНК, характерным для подвида musculus. По-видимому, замещение таксон-специфичных митохондриальных гаплотипов у подвидов wagneri и gansuensis произошло вследствие поглотительной гибридизации с номинативным подвидом musculus, что согласуется и с результатами по ядерной ДНК (ген Hbb-b1) данной работы. Впервые обнаружено две дифференцированные гаплогруппы у аборигенного подвида wagneri (d = 0.01), одна из которых включает туркменских домовых мышей. Это может свидетельствовать об интрогрессии мтДНК синантропных форм из Туркмении в природные популяции казахстанских мышей. Обнаружен также тип мтДНК, характерный для подвида castaneus и ранее не встречавшийся в Средней Азии, у двух особей из природных биотопов Казахстана и Туркмении. Высказано предположение о том, что генетический поток ядерных и митохондриальных признаков M. musculus направлен от синантропных форм в сторону природных популяций.

  • КЛЕТОЧНЫЕ МИШЕНИ ПРОТИВООПУХОЛЕВЫХ РИБОНУКЛЕАЗ

    ИЛЬИНСКАЯ О.Н., МАКАРОВ А.А., МИТЬКЕВИЧ В.А. — 2014 г.

    Известно, что некоторые рибонуклеазы (РНКазы) оказывают селективное токсическое действие на опухолевые клетки, однако механизм их противоопухолевой активности во многом остается неясным. В представленном обзоре обсуждено взаимодействие РНКаз с клеточными компонентами, последствием которого является индукция апоптоза опухолевой клетки. Рассмотрены структуры клеточной поверхности, потенциальные акцепторы экзогенных РНКаз – кислые липиды и гликопротеины, гепарансульфат-содержащие протеогликаны, актин и ассоциированные с РНК белки. Клеточные мембраны нормальных и злокачественных клеток отличаются по составу этих компонентов, что во многом определяет избирательность действия РНКаз. В качестве внутриклеточных мишеней РНКаз рассмотрены РНК различного типа, приведены факты, показывающие возможность вмешательства экзогенных РНКаз в процесс РНК-интерференции. Обсуждена роль калиевых каналов, NF- B-зависимого сигнального пути и различных каспаз в апоптозе, индуцированном экзогенными РНКазами. Приведены доказательства того, что чувствительность клеток к действию экзогенных РНКаз связана с экспрессией определенных онкогенов, а именно RAS, KIT, AML1-ETO. Предполагается, что детализация механизмов цитотоксических эффектов РНКаз в восприимчивых к их действию малигнизированных клетках послужит основой для создания новых средств направленной противоопухолевой терапии.