научная статья по теме ОСОБЕННОСТИ БИОСИНТЕЗА ВНЕКЛЕТОЧНОЙ МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗЫ PROTEUS MIRABILIS Биология

Текст научной статьи на тему «ОСОБЕННОСТИ БИОСИНТЕЗА ВНЕКЛЕТОЧНОЙ МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗЫ PROTEUS MIRABILIS»

МИКРОБИОЛОГИЯ

УДК 579.222

ОСОБЕННОСТИ БИОСИНТЕЗА ВНЕКЛЕТОЧНОЙ МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗЫ Proteus mirabilis

© 2015 г. Н. М. Замалютдинова*, М. Р. Шарипова*, Л. М. Богомольная**, Е. С. Божокина***, А. М. Марданова*

*Казанский федеральный университет, 420008 Казань, ул. Кремлевская, 18 **Техасский аграрный университет, Техас, США ***Институт цитологии РАН, 194064 Санкт-Петербург, Тихорецкий просп., 4 E-mail: mardanovaayslu@mail.ru Поступила в редакцию 12.05.2014 г.

Исследованы биосинтез металлопротеиназы штаммом Proteus mirabilis 5127-1 на разных средах и влияние на биосинтез глюкозы и мочевины. Отмечено, что бактерии P. mirabilis 5127-1 секретируют в среду металлопротеиназу в виде двух изоформ (52 и 50 кДа). Установлено, что синтез протеиназы полностью подавляется при росте бактерий на синтетических средах, а также в присутствии в среде LB глюкозы. Показано, что добавление в среду мочевины приводит к увеличению продуктивности культуры по синтезу протеиназы. Максимальная продуктивность культуры по синтезу протеиназы обнаружена на среде с натуральной мочой. При росте бактерий на искусственной моче протеиназа появлялась в среде только после 12 ч роста в виде одной изоформы.

DOI: 10.7868/S0002332915010142

Proteus mirabilis, условно-патогенная грамот-рицательная бактерия семейства Enterobacteri-aceae, — возбудитель оппортунистических и госпитальных инфекций, поражающих респираторный тракт, кожу, ожоговые поверхности и раны (Endimiani et al., 2005). Чаще всего P. mirabilis является причиной инфекций мочевыводящих путей, особенно при длительном использовании катетеров (Jakobsen et al., 2008). Один из факторов вирулентности этих бактерий — внеклеточная ме-таллопротеиназа (Senior et al., 1987). Установлена корреляция между способностями штамма к роению и к секреции протеиназ. Штаммы, не способные к роению, были протеолитически неактивны (Senior, 1999; Walker et al., 1999). Ген металлопротеиназы P. mirabilis (zapA) входит в состав оперона, включающего в себя гены, кодирующие АТФ-зависимую транспортную систему, которая обеспечивает перенос фермента из клеток в куль-туральную среду. Белок, кодируемый геном zapA, относится к семейству серрализинов (Wassif et al., 1995).

При изучении транскриптома роящихся клеток P. mirabilis показано, что экспрессия гена zapA увеличивается в роящихся клетках, особенно сильно на стадии консолидации (Pearson et al., 2010). В то же время исследование экспрессии генов P. mirabilis in vivo в процессе инфицирования мочевыводящих путей показало, что ген zapA экс-прессировался на базовом уровне или даже ниже. Предполагается, что либо экспрессия этого гена

может быть специфична к месту локализации бактерий в мочевых путях, либо незначительные изменения на уровне транскрипции могут приводить к значимым изменениям в активности (Pearson et al., 2011).

Цель работы — характеристика биосинтеза внеклеточной протеиназы штаммом P. mirabilis 5127-1 на разных средах и в зависимости от присутствия глюкозы и мочевины в среде культивирования. Штамм P. mirabilis 5127-1 был предоставлен Е.С. Божокиной (Институт цитологии РАН).

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

Бактерии культивировали при 37°C с интенсивностью качания 200 об./мин (вибростенд, Braun, Германия). Для культивирования бактерий использовали среду Лурия—Бертани (LB), синтетическую среду М9, синтетическую и натуральную мочу. Состав среды LB, %: триптон — 1, дрожжевой экстракт — 0.5, NaCl — 0.5, pH 8.5. Среда LBA содержала 2% агара (Sambrook et al., 1989). Мочевину в конечных концентрациях 4—600 мМ вносили в питательную среду перед посевом в виде стерильных растворов. Для изучения влияния глюкозы в среду LB вносили 1.5% глюкозы. Состав среды М9, г/л: Na2HPO4 - 6, KH2PO4 - 3, NaCl - 0.5, NH4Cl - 1. В среду М9 вносили глюкозу или глицерин в конечной концентрации 0.2%. Витамин В1 добавляли до конечной кон-

центрации 1 мг/мл. После автоклавирования на 1 л среды добавляли 1 мл 1 М раствора MgSO4 •

• 7H2O, 10 мл 0.01 М раствора CaCl2.

Состав искусственной мочи, г/л (Jones et al, 2007): пептон L37 — 1, дрожжевой экстракт — 0.05, молочная кислота — 0.1, лимонная кислота — 0.4, мочевина - 10, CaCl2 • 2H2O - 0.37, NaCl - 5.2, FeSO4 - 0.012, MgSO4 • 7H2O - 0.49, Na2SO4 •

• 10H20 - 3.2, KH2PO4 - 0.95, K2HPO4 - 1.2, NH4Cl - 1.3, H2O дистиллированная. В качестве натуральной мочи использовали детскую объединенную мочу, которую стерилизовали фильтрованием через мембранный фильтр с диаметром пор 0.2 мкм. Стерильность подтверждали высевом на среду LB. В качестве инокулята использовали 12-часовую культуру, выращенную на среде LB. Для определения казеинолитической активности использовали среду следующего состава, г/л: казеин -5, дрожжевой экстракт - 5, NaCl - 5, агар - 20.

Нуклеотидную последовательность гена 16S рРНК определяли и анализировали методом, описанным ранее (Janda, Abbott, 2007). Прирост биомассы измеряли нефелометрически на фотоэлек-трокалориметре КФК-2 при длине волны 590 нм. Биомассу выражали в единицах светопоглощения в кювете толщиной 1 см. Общее количество белка определяли методом Брэдфорд (Bradford, 1976). Биоинформационный анализ промоторной области гена zapA проводили с помощью базы данных ASAP (https://asap.ahabs.wisc.edu/ asap/home.php) и программы BPROM (www.softberry.com).

Протеолитическую активность в культураль-ной жидкости определяли по расщеплению казеина методом Каверзневой (Каверзнева, 1971). За единицу казеинолитической активности принимали количество фермента, которое приводило к освобождению 1 мкмоля тирозина за 1 мин. Азо-казеин расщепляли методом, описанным ранее (Wassif et al, 1995). За единицу активности принимали такое количество активности, которое приводит к увеличению оптической плотности на 0.1 единицы. Продуктивность культуры в отношении синтеза протеиназы определяли как отношение протеолитической активности в культу-ральной жидкости к биомассе и выражали в условных единицах. Супернатант культуральной жидкости получали центрифугированием культуры при 13000 об./мин в течение 15 мин.

В опытах по исследованию влияния ингибиторов в инкубационные смеси вносили в конечной концентрации 10 мМ орто--фенантролин и 2 мМ PMSF.

Электрофорез белков в полиакриламидном геле (ПААГ) в присутствии додецилсульфата натрия проводили по стандартной методике (Laem-mli, 1970). Зимографию проб культуральной жид-

кости P. mirabilis в ПААГ с желатином (1 мг/мл) проводили методом, описанным ранее (Oliver et al., 1999). Для проведения количественного анализа гели сканировали и полученные изображения обрабатывали с помощью программы Quanti Scan 2.1.

Математическую обработку данных проводили с использованием программы Microsoft Excel путем расчета среднеквадратичного отклонения (а). Результаты считали достоверными при а < 15%. В качестве критерия достоверности получаемых разностей использовали критерий Стьюдента (P < < 0.05 — достоверный уровень значимости).

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Филогенетическое положение штамма 5127-1 установили путем анализа последовательности гена 16S рРНК. Показано, что штамм 5127-1 относится к виду P. mirabilis. Сходство генов 16S рРНК штамма 5127-1 и P. mirabilis CIFRI Ch-TSB28 составило 98.9%. При росте бактерий штамма 5127-1 на агаризованной среде с казеином штамм проявлял способность к роению и образовывал зоны гидролиза, что свидетельствует о его про-теолитической активности.

Для исследования специфичности протеиназы штамма P. mirabilis 5127-1 использовали такие субстраты, как казеин, азоказеин и желатин. Показано, что данный микроорганизм способен разлагать азоказеин, желатин и казеин, причем казеин разлагается менее эффективно. Полученные результаты согласуются с данными литературы, согласно которым многие штаммы P. mirabilis более эффективно расщепляют желатин, чем казеин (Senior, 1999). В дальнейших опытах для определения протеолитической активности в культу-ральной жидкости использовали азоказеин, а для зимографии — желатин.

Динамику роста и биосинтеза внеклеточных протеиназ P. mirabilis изучали при культивировании на среде LB при 37°С. Стационарная фаза роста наступала через 11—12 ч культивирования. Протеиназы выделялись в среду после 5 ч роста бактерий и продолжали секретироваться на всех этапах развития культуры (рис. 1), достигнув максимума в стационарной фазе роста бактерий. Внеклеточная протеолитическая активность полностью подавлялась 10 мМ орто-фенантроли-ном, ингибитором металлопротеиназ, и была нечувствительной к 2 мМ PMSF, ингибитору сери-новых протеиназ. Таким образом, внеклеточная протеиназа P. mirabilis 5127-1 является металло-протеиназой.

Рост бактерий и биосинтез протеиназ исследовали на синтетической среде М9, которую моди-

Q

О

H о о

Р

0.6

q^'a ............ -iïN- ill—¿mi—u-L-l

4 8 12 16 20 24 Время, ч

ii

28 32

36

0.4

0.2

40

S $

о

о «

m S H

Рис. 1. Динамика роста (1) и внеклеточной протеолитической активности P. mirabilis по расщеплению азоказеина (2), а также протеолитическая активность в присутствии 10 мМ орто-фенантролина (3). OD590 нм — оптическая плотность культуры при 590 нм.

3

2

1

0

фицировали добавлением различных органических компонентов. К солевой основе с тиамином (1 мг/мл) добавляли глюкозу или глицерин в качестве источника углерода в конечной концентрации 0.2%. Было установлено, что на модифицированных синтетических средах М9 бактерии растут более чем в 2 раза медленнее, чем на среде LB (16 ч культивирования) (рис. 2). Во всех вариантах сред в следовых количествах обнаруживалась протеолитическая активность по отношению к азоказеину. Однако она составляла не более 2% активности фермента в культуральной жидкости бактерий, выращенных на среде LB.

Показано, что в культуральной жидкости разных штаммов P. mirabilis присутствуют две изо-формы металлопротеиназы (Senior, 1999; Pearson

1.6

s 1.2

Q

О

н о о

Р

0.8

0.4

et al, 2008). Зимография белков культуральной жидкости позволила выявить изоформы внеклеточной протеиназы P. mirabilis с молекулярными массами 52 и 50 кДа (Oliver et al., 1999). Причины образования двух изоформ точно не известны. Предполагается, что изоформа с М = 5

Для дальнейшего прочтения статьи необходимо приобрести полный текст. Статьи высылаются в формате PDF на указанную при оплате почту. Время доставки составляет менее 10 минут. Стоимость одной статьи — 150 рублей.

Показать целиком