научный журнал по биологии Микробиология ISSN: 0026-3656

Архив научных статейиз журнала «Микробиология»

  • ПИГМЕНТАЦИЯ SERRATIA MARCESCENS И СПЕКТРАЛЬНЫЕ СВОЙСТВА ПРОДИГИОЗИНА

    АНДРЕЕВА И.Н., ОГОРОДНИКОВА Т.И. — 2015 г.

    Пигментация Serratia marcescens зависит от состава ростовой среды. На глицерин-пептонной среде культура окрашена в красный цвет, на среде с ацетатом – в желтый (желто-оранжевый), окраска культуры определяется рН среды. В клетках культуры S. marcescens, растущей на глицерин-пептонной среде и имеющей визуально красный цвет, присутствуют две спектральные формы продигиозина: “красная” с максимумом поглощения 535 нм и “желтая” (460–470 нм). Спектр поглощения продигиозина в составе нативного пигмент-белкового комплекса отличается от спектра пигмента, растворенного в этаноле, и сходен с абсорбционным профилем клеточной суспензии наличием в нем дополнительного максимума поглощения при 500 нм. Чувствительность продигиозина к низкоинтенсивному свету видимого диапазона зависит от состояния совместно солюбилизированного с ним белка. Светочувствительность продигиозина в комплексе с нативным белком близка к светочувствительности пигмента в составе целостной бактериальной клетки. Продигиозин, выделенный в денатурирующих условиях, менее чувствителен к освещению. Как “красная”, так и “желтая” формы продигиозина в растворе флуоресцируют в области 560–565 нм; in vivo более выражена флуоресценция “красной” формы пигмента.

  • ПРЕПАРАТЫ СЕКРЕТИРУЕМОЙ РНКАЗЫ BACILLUS PUMILUS: ОДИН ФЕРМЕНТ ИЛИ ДВА?

    ВЕРШИНИНА В.И., ДУДКИНА Е.В., ИЛЬИНСКАЯ О.Н., ЛАЙКОВ А.В., УЛЬЯНОВА В.В., ХОДЖАЕВА В.С. — 2015 г.

    Проведен иммунохимический анализ очищенных препаратов РНКазы Вacillus pumilus (биназы), представленных ферментом заводского производства (Институт органического синтеза, Рига, Латвия), ферментами, выделенными из культуральной жидкости нативного штамма-продуцента В. pumilus и рекомбинантного штамма Escherichia coli BL21, несущего плазмиду pGEMGX1/ent/Bi. Установлено, что при электрофорезе всех трех образцов очищенной биназы обнаруживаются две белковые фракции, обладающие рибонуклеазной активностью. Определена молекулярная масса фракций – соответственно, около 12 и 25 кДа. Исключена возможность присутствия в препаратах второй секретируемой РНКазы В. pumilus – биназы II. Как низкомолекулярный, так и высокомолекулярный белки взаимодействовали со специфическими антителами к биназе в реакции иммуноблоттинга, что указывает на их антигенную идентичность. Различие в молекулярной массе исследуемых белков свидетельствует о том, что биназа в растворе может быть представлена двумя формами – мономером и димером.

  • ПРОДУКЦИЯ КСИЛИТА И ЭТАНОЛА, АКТИВНОСТЬ КЛЮЧЕВЫХ ФЕРМЕНТОВ КАТАБОЛИЗМА D-КСИЛОЗЫ У МУТАНТОВ PACHYSOLEN TANNOPHILUS

    БОЛОТНИКОВА О.И., ГИНАК А.И., МИХАЙЛОВА Н.П., ТРУШНИКОВА Е.П. — 2015 г.

    Изучена продукция ксилита и этанола, а также активность ключевых ферментов катаболизма D-ксилозы у мутантов дрожжей Pаchysolen tannophilus с измененным ростом на D-ксилозе, ксилите, этаноле или D-глюкозе в качестве единственного источника углерода. Угнетение активности ксилозоредуктазы с преимущественным сродством к НАДФН и ксилитдегидрогеназы до 4.40 и 4.80 мкмоль мг-1 мин-1 соответственно индуцировало накопление 0.25 г ксилита на г потребленной D-ксилозы. Наибольшая активность НАДН/НАДФН-ксилозоредуктазы и ксилитдегидрогеназы (6.00–6.80 и 6.80–8.40 мкмоль мг-1 мин-1) зафиксирована у штаммов, продуцирующих 0.24–0.26 г этанола на г D-ксилозы. Обсуждается использование мутантов Pа. tannophilus для анализа регуляции катаболизма D-ксилозы.

  • РАЗНООБРАЗИЕ КУПРОПРОТЕИНОВ И СИСТЕМ ГОМЕОСТАЗА МЕДИ У MELIORIBACTER ROSEUS – ФАКУЛЬТАТИВНО АНАЭРОБНОГО ТЕРМОФИЛЬНОГО ПРЕДСТАВИТЕЛЯ НОВОГО ФИЛУМА IGNAVIBACTERIAE

    АВАКЯН М.Р., БОНЧ-ОСМОЛОВСКАЯ Е.А., ГАВРИЛОВ С.Н., КАРНАЧУК О.В., КУБЛАНОВ И.В., ПОДОСОКОРСКАЯ О.А., ФРАНК Ю.А. — 2015 г.

    В геноме Melioribacter roseus, одного из двух представителей недавно описанного филума Ignavibacteria был проведен поиск генов, кодирующих белки, связанные с транспортом меди и содержащие медь в качестве кофактора, с последующей их характеристикой. В результате геномного анализа у данного факультативно анаэробного организма были выявлены различные медьсодержащие оксидоредуктазы. Было исследовано влияние концентрации ионов Cu2+ в культуральной среде на рост M. roseus. В результате геномного анализа у данного факультативно анаэробного организма были выявлены различные медьсодержащие оксидоредуктазы. Было детектировано три АТФазы, осуществляющие транспорт меди, одна из которых (MROS_1511) с большой вероятностью участвует в сборке медьсодержащей цитохром с-оксидазы, тогда как две других (MROS_0327 и MROS_0791) обладают, по-видимому, детоксификационной функцией. Наличие нескольких медьсодержащих оксидоредуктаз и систем гомеостаза меди у M. roseus соотносится с ранее высказанной гипотезой происхождения филума Ignavibacteriae от общего с Bacteroidetes и Chlorobi аэробного предка.

  • РАЗРУШЕНИЕ БАКТЕРИАЛЬНЫХ БИОПЛЕНОК РЕКОМБИНАНТНЫМ ДИСПЕРСИНОМ B

    АВЕТИСЯН Л.Р., БОКША И.С., БОЛЬШАКОВА Т.Н., ГАЛУШКИНА З.М., ГРИШИН А.В., ДОБРЫНИНА О.Ю., КАРЯГИНА А.С., ЛАВРОВА Н.В., ЛУНИН В.Г., ЛЯЩУК А.М., УМЯРОВ А.М., ЧЕРНУХА М.Ю., ШАГИНЯН И.А. — 2015 г.

    В клетках Escherichia coli клонирован и экспрессирован синтетический ген, кодирующий белок, последовательность которого соответствует таковой дисперсина В из Aggregatibacter actinomycetemcomitans. Разработан метод очистки и проведено тестирование активности рекомбинантного дисперсина В in vitro. Этот фермент использован в опытах по разрушению биопленок, образованных микророрганизмами разных видов. Наибольшую активность рекомбинантный дисперсин В проявлял в отношении биопленок, формируемых Staphylococcus epidermidis. Биопленки, образованные Burkholderia cenocepacia и Achromobacter xylosoxidans, оказались более устойчивы к действию фермента.

  • РАСПРОСТРАНЕНИЕ, РАЗНООБРАЗИЕ И ЧИСЛЕННОСТЬ МЕТАНОГЕННЫХ АРХЕЙ В НАЗЕМНЫХ ГОРЯЧИХ ИСТОЧНИКАХ КАМЧАТКИ И ОСТРОВА САН-МИГЕЛЬ

    БОНЧ-ОСМОЛОВСКАЯ Е.А., МЕРКЕЛЬ А.Ю., ПОДОСОКОРСКАЯ О.А., ЧЕРНЫХ Н.А. — 2015 г.

    Путем детекции и анализа гена mcrA, кодирующего ключевой фермент метаногенеза – метил-коэнзим М-редуктазу, проведена оценка распространения и разнообразия метаногенных архей в наземных горячих источниках Камчатки и о. Сан-Мигель (Азоры). Для этого предварительно была проведена реконструкция филогении метаногенов на основании анализа последовательностей гена mcrA, являющегося общим функциональным и филогенетическим маркером этой физиологической группы прокариот. Установлено, что метаногены присутствуют в большинстве исследованных наземных горячих источников с температурами в диапазоне 51–89°C, но составляют при этом незначительную часть микробной популяции. Обнаруженные в образцах из горячих источников гены mcrA принадлежали как представителям родов Methanothermobacter, Methanothermus и Methanothrix, выявленных ранее в этих же местообитаниях, так и метаногенам, ранее в горячих источниках не обнаруженным. Среди последних – представители Methanomassiliicoccales, Methanocellales и Methanomethylovorans, а также новый филогенетически обособленный кластер некультивируемых метаногенных архей – MCR-2a, причем последняя группа присутствовала во всех источниках с положительным результатом детекции гена mcrA. Проведенные исследования свидетельствуют о разнообразии термофильных метаногенов, обитающих в наземных горячих источниках, и наличии среди них новых групп с неизвестной пока субстратной специфичностью.

  • РЕГУЛЯЦИЯ ПРОЦЕССА ФОРМИРОВАНИЯ БИОПЛЕНОК PSEUDOMONAS CHLORORAPHIS В СИСТЕМЕ IN VITRO

    ВЕСЕЛОВА М.А., ГАННЕСЕН А.В., ЖУРИНА М.В., ПЛАКУНОВ В.К., ХМЕЛЬ И.А. — 2015 г.

    Установлено, что у мутантов Pseudomonas chlororaphis 449 с частично или полностью подавленным накоплением N-ацилгомосеринлактонов способность к стимуляции роста биопленок в присутствии азитромицина резко снижена или полностью отсутствует. Биопленки штамма дикого типа, предформированные в присутствии стимулирующих концентраций азитромицина, интенсивнее окрашиваются специфичным для полисахаридов красителем 1,9-диметилметиленовым синим (DMMB) и более устойчивы к тепловому шоку. Это указывает на накопление в них структурных полисахаридов матрикса, выполняющих защитную роль при тепловом шоке. Сверхнизкие концентрации азитромицина (0.001–0.01 мкг/мл) ингибируют рост биопленок P. chlororaphis 449 и P. chlororaphis 66 с преимущественным подавлением синтеза полисахаридов, окрашиваемых DMMB.

  • СВЕРХСИНТЕЗ ИНВЕРТАЗЫ МОЖЕТ ОБЕСПЕЧИТЬ СЕЛЕКЦИОННЫМ ШТАММАМ SACCHAROMYCES CEREVISIAE ФЕРМЕНТАЦИЮ ИНУЛИНА

    НАУМОВ Г.И., НАУМОВА Е.С. — 2015 г.

    В связи с публикациями о селекционных штаммах Saccharomyces cerevisiae, якобы обладающих инулиназой, в обзоре обобщены литературные сведения, позволяющие считать, что в действительности имел место сверхсинтез инвертазы – обычного фермента этих дрожжей.

  • СКРИНИНГ ПРОДУЦЕНТОВ ПРОТЕИНАЗ С ФИБРИНОЛИТИЧЕСКОЙ И КОЛЛАГЕНОЛИТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЯМИ СРЕДИ МИКРОМИЦЕТОВ

    БАРАНОВА Н.А., ЕГОРОВ Н.С., КРЕЙЕР В.Г., КУРАКОВ А.В., МАТВЕЕВА Э.О., ОСМОЛОВСКИЙ А.А., ШАРКОВА Т.С. — 2015 г.

    Проведен скрининг продуцентов протеиназ с фибринолитической (плазминоподобной и активаторной к плазминогену) и коллагенолитической активностями среди 83 штаммов микроскопических грибов разных экологических групп. Энтомопатогенные микромицеты, по сравнению с сапротрофами, потенциальными фитопатогенами и эпифитами секретировали протеиназы с более высокой фибринолитической и коллагенолитической активностью. Выявлены штаммы микромицетов, протеолитические ферменты которых обладали коллагеназной активностью и штаммы-продуценты протеиназ с плазминоподобной активностью. Среди исследованных микромицетов не было обнаружено штаммов, способных секретировать протеиназы только с активаторной к плазминогену активностью. Найден продуцент внеклеточных протеиназ с высокой активаторной к плазминогену, плазминоподобной и коллагенолитической активностями – Tolypocladium inflatum k1. Показано, что удельная активаторная к плазминогену активность T. inflatum k1 на 20% выше плазминоподобной активности.

  • СНИЖЕНИЕ АКТИВНОСТИ И ИЗМЕНЕНИЕ СТРУКТУРЫ МЕТАНОТРОФНОГО СООБЩЕСТВА ВЕРХОВОГО БОЛОТА В РЕЗУЛЬТАТЕ ПОЖАРА

    БЕЛОВА C.Э., ДАНИЛОВА О.В., ДЕДЫШ С.Н., КУЛИЧЕВСКАЯ И.С. — 2015 г.

    На примере торфяных массивов верхового болота Тасин Борское, Владимирская область, пострадавших от пожара 2007 года, проведена оценка нарушений в функционировании сообществ метанотрофных бактерий, играющих ключевую роль в контроле эмиссии метана. Потенциальная активность метанокисляющего “фильтра” выгоревших локусов торфяника и численность слагающих его метанотрофных бактерий была существенно редуцирована по сравнению с ненарушенными участками болота. Молекулярный анализ состава метанотрофного сообщества с помощью ПЦР-амплификации и клонирования фрагментов гена pmoA, кодирующего мембранную метанмонооксигеназу, выявил замену типичных ацидофильных болотных метанотрофов II типа менее активными в кислых средах метанотрофами I типа. Таким образом, как состав, так и активность метанокисляющего “фильтра” выгоревших участков верхового болота претерпели существенные изменения, четко прослеживаемые и после 7-летнего периода естественного восстановления экосистемы, что указывает на их долговременный характер.

  • СО2-КОНЦЕНТРИРУЮЩИЙ МЕХАНИЗМ И ЕГО ОСОБЕННОСТИ У ГАЛОАЛКАЛОФИЛЬНЫХ ЦИАНОБАКТЕРИЙ

    КУПРИЯНОВА Е.В., САМЫЛИНА О.С. — 2015 г.

    Цианобактерии – оксигенные фотоавтотрофы, живущие на Земле по крайней мере 3.5 млрд лет. Фотоассимиляция углекислоты цианобактериями происходит через цикл Кальвина, ключевым ферментом которого является РБФК/О, обладающий очень низким сродством к СО2. Последнее объясняется тем, что в Архее, когда формировался фотосинтетический аппарат, концентрация СО2 в атмосфере на несколько порядков превышала современную. Позже, в эпоху существования докембрийских микробных сообществ, произошла глобальная убыль содержания CO2 в атмосфере. Таким образом, в современных условиях перед всеми фотоавтотрофами, в том числе и перед цианобактериями, “стоит задача” по поддержанию адаптивных механизмов, позволяющих осуществлять эффективный фотосинтез. В клетках цианобактерий эту адаптацию обеспечивает функционирование СО2-концентрирующего механизма (ССМ), результатом действия которого является создание повышенной концентрации СО2 вблизи активных центров РБФК/О, что существенно повышает эффективность его фиксации в цикле Кальвина. До настоящего времени CСМ активно изучался только на пресноводных и морских штаммах цианобактерий. Наши исследования стали первыми в изучении ССМ галоалкалофильных цианобактерий из содовых озер. Показано, что экстремофильные галоалкалофильные цианобактерии обладают полноценным ССМ, имеющим структуру и принципы функционирования, аналогичные таковым у изученных пресноводных и морских штаммов. На основе анализа имеющихся данных сделан вывод, что генеральная функция ССМ в этих условиях может заключаться в регулировании количества неорганического углерода, поступающего в клетку.

  • СООБЩЕСТВА СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИХ БАКТЕРИЙ В ВОДНОЙ ТОЛЩЕ ГДАНЬСКОЙ ВПАДИНЫ БАЛТИЙСКОГО МОРЯ

    БРЮХАНОВ А.Л., КОРНЕЕВА В.А., КРЕК А.В., ПИМЕНОВ Н.В., ТУРОВА Т.П. — 2015 г.

    Методом ПЦР с праймерами на гены 16S рРНК шести основных филогенетических подгрупп сульфатредуцирующих бактерий (СРБ) проведен анализ разнообразия сообществ СРБ, обитающих в водной толще глубоководной зоны Гданьской впадины Балтийского моря, где в придонных водах наблюдалось присутствие H2S. С использованием денатурирующего градиентного гель-электрофореза с последующим секвенированием определены нуклеотидные последовательности реамплифицированных участков гена dsrB в исследуемых водных пробах. Впервые во всех исследованных гидрохимических слоях, включая и аэробную водную толщу, с помощью ПЦР были обнаружены участки гена dsrB, а также выявлено наличие гена 16S рРНК представителей подгрупп Desulfotomaculum, Desulfococcus–Desulfonema–Desulfosarcina и Desulfovibrio–Desulfomicrobium. Анализ транслированных аминокислотных последовательностей, кодируемых геном dsrB, показал их наибольшую гомологию с соответствующими последовательностями некультивируемых СРБ из различных морских местообитаний.

  • СОСТАВ ЛИПИДОВ В КЛЕТОЧНЫХ СТЕНКАХ И КЛЕТКАХ МИЦЕЛИЯ И СПОР МИЦЕЛИАЛЬНЫХ ГРИБОВ

    БОКАРЕВА Д.А., МЫСЯКИНА И.С., СЕРГЕЕВА Я.Э., ФЕОФИЛОВА Е.П. — 2015 г.

    В липидах клеточных стенок (КС), а также целых клеток мицелия и покоящихся клеток представителей мукоровых и аскомицетных грибов обнаружены количественные и качественные различия. Так, целые клетки мицелия (ЦК) содержали больше липидов, чем КС. В отличие от спор экзогенного покоя – спорангиоспор и конидий – наибольшее количество липидов, представленных триацилглицеринами (70%), содержали зиготы. Состав клеточных липидов мукоровых грибов содержал больше триацилглицеринов (ТАГ) и меньше полярных липидов, чем липиды аскомицетов. Все изученные КС и ЦК имели сходный состав жирных кислот (ЖК), однако их соотношение индивидуально для каждой структуры: в КС и ЦК мицелия преобладала линолевая кислота, а в спорах – олеиновая, что особенно заметно для ЦК конидий. Для КС, в отличие от ЦК, характерно то, что массивными липидами могут быть не фосфатидилэтаноламин (ФЭА) и фосфатидилхолин (ФХ), а свободные жирные кислоты (СЖК), стерины в свободной (ССт) и этерифицированной форме (ЭСт), фосфатидная кислота (ФК), метиловые эфиры ЖК (МЭЖК) и гликолипиды (ГЛ), что свидетельствует об особой функциональной значимости КС.

  • СТЕРИЛЬНОСТЬ ГИБРИДОВ У ДРОЖЖЕЙ SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE: ГЕНЕТИЧЕСКИЙ РОД И МНОЖЕСТВО ВИДОВ IN STATU NASCENDI?

    КОНДРАТЬЕВА В.И., НАУМОВ Г.И., НАУМОВА Е.С. — 2015 г.

    Обнаружен феномен гибели аскоспор у многочисленных межштаммовых гибридов дрожжей Schizosaccharomyces pombe. Тем не менее, у них наблюдалась мейотическая рекомбинация родительских контрольных ауксотрофных маркеров на случайной выборке аскоспор. Представленные генетические и молекулярные данные свидетельствуют, по крайней мере, о географической дивергенции геномов популяций Sch. pombe. Обсуждается классификация рода, видов и разновидностей этих дрожжей.

  • СТРУКТУРА СООБЩЕСТВА АРХЕЙ В ФОТИЧЕСКОЙ ЗОНЕ ВОДНОЙ ТОЛЩИ ЧЕРНОГО МОРЯ

    БРЮХАНОВ А.Л., КОРНЕЕВА В.А., МЕРКЕЛЬ А.Ю., ПИМЕНОВ Н.В., ТАРАНОВ Е.А., ТАРНОВЕЦКИЙ И.Ю., ТОЩАКОВ С.В., ЧАСОВНИКОВ В.К. — 2015 г.

    Проведен качественный и количественный анализ структуры сообщества архей в фотической зоне водной толщи Черного моря. Методом ПЦР в реальном времени установлено, что численность архей на глубине 15 м составляет 2 ? 104 кл/мл или 4.2% от общей микробной популяции. С использованием технологии секвенирования путем синтеза (метод Illumina/Solexa) ампликонов гена 16S рРНК впервые изучена структура сообщества архей подповерхностной водной толщи. Наиболее многочисленная группа архей была представлена филогенетическим кластером Marinе Group II, относящимся к филуму Euryarchaeota. Их численность в зоне исследуемого района составила 1.2 1.7 ? 104 кл/мл. Вторым по численности (40% от свободноживущей популяции архей или 7.7 ? 103 кл/мл) оказался филогенетический кластер Marine Group I, относящийся к филуму Thaumarchaeota. Среди последовательностей Marine Group I на основании высокого уровня сходства (выше 90%) были выявлены последовательности кластера ‘Nitrosopumilus. Также удалось детектировать группу архей, принадлежащих к кластеру некультивируемых микроорганизмов Deep-sea Hydrothermal Vent Euryarchaeotic Group 6 (DHVEG-6) филума Euryarchaeota. Последовательности гена 16S рРНК, отнесенные к данному кластеру, были выявлены только во фракции взвеси. Большая часть последовательностей DHVEG-6 на основании высокого уровня гомологии (более 90%) была отнесена к кластеру ‘Parvarchaeum. Интересно, что, несмотря на заметный пик метана, наблюдаемый на глубине 15 м, детектировать последовательности метаногенов не удалось.

  • СТРУКТУРНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА И ЗАЩИТНОЕ ДЕЙСТВИЕ ВНЕКЛЕТОЧНЫХ ПЕПТИДНЫХ МЕТАБОЛИТОВ LUTEOCOCCUS JAPONICUS SUBSP. CASEI НА ПРОБИОТИЧЕСКИЕ БАКТЕРИИ

    ВОРОБЬЕВА Л.И., РОГОЖИН Е.А., САМОЙЛЕНКО В.А., ХАРЧЕНКО Н.В., ХОДЖАЕВ Е.Ю. — 2015 г.

    Исследовано стрессозащитное действие экзометаболитов Luteococcus japonicus subsp. casei в отношении клеток транзиторных пробиотических бактерий штаммов рода Propionibacterium, Enterococcus faecium и дрожжей Saccharomyces cerevisiae Boulardii, подвергаемых действию желчных солей и кислотному стрессу. Защитным действием обладали: (1) внеклеточный пептидный реактивирующий фактор (РФ) и (2) пептидный компонент культуральной жидкости после выделения из нее РФ. Протекторное (превентивное внесение) и реактивирующее (после воздействия стрессора) действие РФ приводило к увеличению (в 1.5–2.0 раза) выживаемости транзиторных пробиотиков человека P. freudenreichii, P. acidipropionici и E. faecium, обработанных желчными солями (ЖС) или подвергнутых кислотному стрессу. Пептидная фракция КЖ обладала более сильным протекторным действием. В вариантах предынкубации с ней клеток P. acidipropionici их выживаемость в тех же стрессовых условиях увеличивалась в 14 (действие ЖС) и 8 (кислотный стресс) раз по сравнению с контролем. Дрожжи проявляли исключительно высокую устойчивость к действию применяемых стрессоров. Установлено, что в состав РФ входят две активные фракции гликопептидов с молекулярными массами 1.8 и 2.4 кДа. При определении аминокислотного состава гликопептидов в них обнаружены остатки глицина, лейцина, пролина, аргинина, аспартата/аспарагина и не найдено остатков ароматических и серосодержащих аминокислот, а также посттрансляционных модификаций по типу образования дисульфидных мостиков. Обсуждаются возможные механизмы реактивирующего и протекторного действия РФ.

  • СУЛЬФАТВОССТАНАВЛИВАЮЩАЯ БАКТЕРИЯ DESULFOVIBRIO HONTREENSIS SP. NOV., ВЫДЕЛЕННАЯ ИЗ МОРСКИХ ОБРАСТАНИЙ В РАЙОНЕ ПРИБРЕЖНОЙ ЗОНЫ ЮЖНОГО ВЬЕТНАМА

    БОРЗЕНКОВ И.А., ОСИПОВ Г.А., ТАРАСОВ А.Л. — 2015 г.

    Из морских обрастаний прибрежной зоны Южно-Китайского моря (г. Нячанг, СРВ) выделен штамм МЕ рода Desulfovibrio, имеющий физиологическое и филогенетическое сходство с видами “D. caledoniensis” SEBR 7250, D. portus MSL79 и D. dechloracetivorans ATCC 700912 (степень сродства генов 16S pРНК составляет 96.9, 95.9 и 95.8% соответственно). Грамотрицательные подвижные клетки штамма МЕ имеют форму вибрионов (0.4 0.6 ? 1.3–2 мкм) с одним жгутиком. Штамм МЕ растет при температуре от 20 до 39°С (оптимум роста при 34–37°С), в диапазоне рН от 5.8 до 8.5 (оптимум рН 6.8–7.5) и при солености 0.08–1.1 M Na+ (оптимум 0.2–0.3 М Na+). В присутствии сульфата штамм МЕ растет автотрофно на водороде, а также на лактате, формиате, пирувате, фумарате, малате, слабо – на сукцинате, глицерине, фруктозе. В отсутствие сульфата штамм МЕ сбраживает пируват, слабо – малат, но не лактат. В качестве акцепторов электронов использует сульфат, сульфит, тиосульфат, элементную серу и диметисульфоксид. Витамины и дрожжевой экстракт не обязательны для роста. Содержание Г + Ц – 52.4 мол. %. В составе клеточных жирных кислот преобладали C18:0 (13.9%), C16:0 (9.6%), iso-C16:0 (9.5%), C18:1w7 (8.8%), anteiso-C15:0 (8.1%), а также iso-C17:1 (7.2%). Состав жирных кислот штамма МЕ близок к составу штамма D. dechloracetivorans ВО и имеет сходство с D. portus. На основании генотипических и фенотипических признаков штамм МЕ может рассматриваться как в новый вид с названием Desulfovibrio hontreеnsis sp. nov.

  • ТРАНСМЕМБРАННАЯ АДЕНИЛАТЦИКЛАЗА КОНТРОЛИРУЕТ ФАКТОРЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ ФИТОПАТОГЕНА PSEUDOMONAS SIRINGAE И МУТУАЛИСТА RHIZOBIUM LEGUMINOSARUM

    ЛОМОВАТСКАЯ Л.А., РОМАНЕНКО А.С., РЫКУН О.В. — 2015 г.

    Рассматривается возможная роль трансмембранной аденилатциклазы фитопатогена Pseudomonas siringae pv. pisi и симбиотрофного микроорганизма Rhizobium leguminosarum bv. viceae в контроле активности факторов вирулентности – ферментов, деградирующих клеточную стенку растений (целлюлазы и пектиназы). Обнаружено, что трансмембранная аденилатциклаза (АЦ) контролирует активность факторов вирулентности как фитопатогенов, так и симбионтов, однако стратегии обоих микроорганизмов, проявляемые в молекулярном диалоге с растениями с участием их аденилатциклазной сигнальной системы, имеют не только ряд сходств, но и принципиальных отличий.

  • ТРОФИЧЕСКИЕ ЗАКОНОМЕРНОСТИ ФУНКЦИОНИРОВАНИЯ И МИКРОБНЫЙ ПРОФИЛЬ ЭВОЛЮЦИОННО СЛОЖИВШЕЙСЯ АССОЦИАТИВНОЙ КУЛЬТУРЫ КЕФИРНЫХ ЗЕРЕН

    ГРАДОВА Н.Б., ЕГОРОВА М.А., КАЛИНИНА А.Н., ХОХЛАЧЕВА А.А. — 2015 г.

    Для анализа ассоциативной культуры кефирных грибков применено сочетание микробиологических методов определения функциональной активности выделенных микробных изолятов и молекулярно-биологических методов их идентификации. Совокупность 16S рРНК анализа и денатурирующего градиентного гель-электрофореза позволила определить микробный профиль кефирных грибков и выявить среди компонентов ассоциации молочнокислые бактерии двух физиологических групп, отличающихся способностью использования лактозы для молочнокислого брожения. На основании исследования функциональной активности и микробного профиля кефирных грибков, длительное время (более 4-х лет) культивируемых на молоке, не содержащем лактозу, показана роль индуцибельного фермента -галактозидазы молочнокислых бактерий в функциональной устойчивости микробного сообщества кефирных грибков. Полученные данные расширяют общее представление о возможных трофических закономерностях рассматриваемых микробных сообществ и могут быть использованы для разработки алгоритма экспериментального создания функционально устойчивой ассоциативной культуры кефирных грибков.

  • УСТОЙЧИВОСТЬ ДРОЖЖЕЙ РАЗНЫХ ЭКОЛОГИЧЕСКИХ ГРУПП К ДЛИТЕЛЬНОМУ ХРАНЕНИЮ В ВЫСУШЕННОМ СОСТОЯНИИ

    ГЛУШАКОВА А.М., ЖЕЛТИКОВА Т.М., КАЧАЛКИН А.В., ЧЕРНОВ И.Ю. — 2015 г.

    Исследована устойчивость 14 видов дрожжевых грибов, принадлежащих к различным экологическим группам, к длительному сохранению жизнеспособности в высушенном состоянии. Результаты показали, что наименее устойчивыми оказались педобионтные дрожжи, выделяющиеся почти исключительно из почв гумидного климата и представленные такими видами, как Cryptococcus podzolicus, Cr. terricola, Lipomyces starkeyi. Неустойчивы к высушиванию также “нектарные” дрожжи, ассоциированные с нектаром энтомофильных растений (Metschnikowia reukaufii, Candida bombi). Эти виды полностью погибают в течение первого месяца хранения. Несколько более устойчивы эврибионтные виды, постоянно присутствующие в самых разнообразных местообитаниях: Cryptococcus magnus, Cr. victoriae, Debaryomyces hansenii, Cr. wieringae. Наиболее устойчивы к высушиванию представители пигментированных фитобионтных дрожжей, такие как Rhodotorula mucilaginosa и Sporobolomyces roseus, а также штаммы аскомицетовых дрожжей рода Candida, относящиеся к патогенным и условно-патогенным видам (Candida albicans, C. parapsilosis). Обнаружено, что особенности распространения дрожжей в природных местообитаниях тесно связаны с их способностью переносить длительные периоды высушивания.