научный журнал по химии Биоорганическая химия ISSN: 0132-3423

Архив научных статейиз журнала «Биоорганическая химия»

  • ДИЗРЕГУЛЯЦИЯ КАЛЬПАИНОВОЙ СИСТЕМЫ В МОЗГЕ КРЫС ПРИ НЕЙРОДЕГЕНЕРАЦИИ, ИНДУЦИРОВАННОЙ БЕТА-АМИЛОИДОМ

    КАНЦЕРОВА Н. П., ЛЫСЕНКО Л. А., НЕМОВА Н. Н., РЕНДАКОВ Н. Л., СЕЛЬВЕРОВА Н. Б. — 2013 г.

    Получены экспериментальные доказательства нарушения регуляции кальцийзависимого протеолиза в мозге крыс – биомоделей болезни Альцгеймера. Введение амилоидогенного пептида А1-40 в область гиппокампа вызывало активацию основных форм кальпаинов в мозге крыс наряду со снижением уровня их естественного ингибитора – кальпастатина. При коррекции индуцированной у крыс патологии были подтверждены нейропротекторные свойства стероидного гормона эстрадиола и предложен один из механизмов его защитного действия. Полученные результаты позволяют судить не только о биохимических перестройках в белковом оснащении патологически измененного мозга, но и о механизмах нейродегенерации и нейропротекции.

  • ЗАЩИТНЫЕ ГРУППЫ В ХИМИЧЕСКОМ СИНТЕЗЕ ОЛИГОРИБОНУКЛЕОТИДОВ

    АРАЛОВ А. В., ЧАХМАХЧЕВА О. Г. — 2013 г.

    Представлены материалы, касающиеся химического синтеза олигорибонуклеотидов и применяемых при этом защитных групп. Подробно рассматриваются последние данные по способам блокирования 2-OН-функций производных нуклеотидов, представляющих собой мономеры для синтеза РНК.

  • ИЗУЧЕНИЕ АКТИВНОГО ЦЕНТРА ДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕОЗИДМОНОФОСФАТКИНАЗЫ БАКТЕРИОФАГА Т5 МЕТОДОМ САЙТ-НАПРАВЛЕННОГО МУТАГЕНЕЗА

    МИКУЛИНСКАЯ Г. В., СКОБЛОВ Ю. С., ТАРАН С. А., ФЕОФАНОВ С. А. — 2013 г.

    На основании компьютерной модели активного центра дезоксирибонуклеозидмонофосфаткиназы бактериофага Т5 (dNMPKT5) определены аминокислотные остатки, важные для ферментативной активности. В результате сайт-направленного мутагенеза, клонирования и экспрессии гена dNMPKT5 в клетках E. coli получен ряд белков, содержащих единичные замены консервативных аминокислотных остатков активного центра – S13A, D16N, T17N, T17S, R130K, K131E, Q134A, G137A, T138A, W150F, W150A, D170N, R172I, E176Q. После ионообменной и аффинной хроматографической очистки полученные препараты мутантных форм белка были электрофоретически гомогенными. Исследование ферментативной активности этих белков на природных акцепторах фосфорильной группы (dAMP, dCMP, dGMP, dTMP) показало, что замены заряженных аминокислот NMP-связывающего домена – R130, R172, D170 и E176 – приводят к практически полной потере ферментативных свойств. Установлено, что для каталитической активности фермента важно наличие НО-группы аминокислотного остатка в положении 17. На основании изменений удельной активности мутантных форм фермента предполагается, что остатки аргининов 130 и 172 участвуют в связывании -фосфорильной группы донора и -фосфорильной группы акцептора, а остаток аспарагиновой кислоты в положении 16 АТР-связывающего сайта также участвует в связывании ряда акцепторов фосфорила, прежде всего dTMP. Непропорциональное изменение ферментативной активности на разных субстратах у частично активных мутантов – G137A, T138A, T17N, Q134A, S13A, D16N – позволяет предполагать, что в связывании разных акцепторов фосфорила участвуют разные аминокислотные остатки.

  • ИММУННЫЕ ПРОТЕАСОМЫ В РАЗВИТИИ ИММУННОЙ СИСТЕМЫ КРЫСЫ

    АБРАМОВА Е. Б., АСТАХОВА Т. М., ЕРОХОВ П. А., КАРПОВА Я. Д., ЛЮПИНА Ю. В., СТЕПАНОВА А. А., ШАРОВА Н. П. — 2013 г.

    Исследована динамика экспрессии иммунных субъединиц LMP7 и LMP2 протеасом в эмбриональном и раннем постнатальном развитии селезенки и печени крысы в сравнении с динамикой химотрипсинподобной и каспазаподобной активностей протеасом и динамикой экспрессии молекул ГКГ (главного комплекса гистосовместимости) класса I. Проанализировано также распределение иммунных субъединиц LMP7 и LMP2 по клеткам селезенки и печени в процессе развития. Обнаружена общая для обоих органов тенденция к повышению экспрессии как субъединицы LMP7, так и субъединицы LMP2 на 21-й постнатальный день (П21) по сравнению с эмбриональным периодом при постоянном общем уровне протеасом. При этом в отдельные периоды развития динамика экспрессии иммунных субъединиц в селезенке и печени отличалась. Если в селезенке наблюдалось постепенное увеличение количества обеих иммунных субъединиц на П1, П18 и П21, то в печени период постепенного повышения на 16-й и 18-й эмбриональный день (Э16 и Э18) сменялся периодом падения уровня иммунных субъединиц на П5. Этот уровень достоверно не изменялся до П18 и повышался на П21. Выявленные изменения сопровождались увеличением химотрипсинподобной активности и падением каспазаподобной активности протеасом в селезенке к П21 по сравнению с эмбриональным периодом, что свидетельствует о повышении способности протеасом к образованию антигенных эпитопов для молекул ГКГ класса I. В печени обе активности возрастали к П21 по сравнению с эмбриональным периодом. Подобную динамику каспазаподобной активности можно объяснить не только сменой протеолитически активных конститутивных и иммунных субъединиц, но и дополнительными регуляторными механизмами. Кроме того, обнаружено, что повышение экспрессии иммунных субъединиц протеасом в раннем развитии селезенки связано с процессом последовательного формирования белой пульпы В- и Т-лимфоцитами, обогащенными иммунными субъединицами. В печени же повышение уровня иммунных субъединиц к П21 сопровождалось повышением их экспрессии в гепатоцитах, в то время как падение их уровня к П5 может быть связано с утратой печенью функции первичного лимфоидного органа иммунной системы к этому периоду и исчезновением из нее В-лимфоцитов, обогащенных иммунными протеасомами. В селезенке и печени выявлялись молекулы ГКГ класса I в периоды повышения уровня иммунных субъединиц протеасом. На Э21 печень была обогащена нейрональной NO-синтазой (nNOS), уровень которой падал после рождения и повышался к П18. Этот факт указывает на возможность индукции экспрессии иммунных субъединиц LMP7 и LMP2 в гепатоцитах по сигнальному пути с участием nNOS. В совокупности полученные результаты свидетельствуют о том, что Т-клеточный иммунный ответ, развивающийся в селезенке по отношению к клеткам печени, у крыс возможен начиная с периода П19–П21. Во-первых, в этот период сформирована Т-зона белой пульпы селезенки. Во-вторых, повышенный уровень иммунных протеасом и молекул ГКГ класса I в гепатоцитах может обеспечить образование антигенных эпитопов из чужеродных белков и доставку их на поверхность клеток для предъявления цитотоксическим Т-лимфоцитам.

  • ИССЛЕДОВАНИЕ БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНОЙ КОНФОРМАЦИИ ГБ-115, ДИПЕПТИДНОГО АНАЛОГА ХОЛЕЦИСТОКИНИНА-4

    ГУДАШЕВА Т. А., ДЕЕВА О. А., КИРЬЯНОВА Е. П., КОЛИК Л. Г., ЛЕЗИНА В. П., СЕРЕДЕНИН С. Б. — 2013 г.

    С использованием конформационного анализа методом 1-ЯМР-спектроскопии в растворе и метода пространственно ограниченных аналогов исследована биологически активная конформация амида N-(6-фенилгексаноил)глицил-триптофана (ГБ-115), высокоактивного ретродипептидного аналога холецистокинина-4 с анксиолитической активностью. Изучение связи предпочтительной конформации в растворе и анксиолитической активности в ряду производных ГБ-115 показало, что биологически активной конформацией этого соединения является бета-изгиб. Данные 1-ЯМР спектроскопии по ядерному эффекту Оверхаузера позволили уточнить, что это -изгиб типа II. Последующий синтез и изучение фармакологической активности новых пространственно ограниченных аналогов дипептида ГБ-115: этилового эфира (2S)-2-{(3R)-3-[(6-фенилгексаноил)амино]-2-оксопирролидин-1-ил}-3-(1H-индол-3-ил)пропионовой кислоты, этилового эфира N-(6-фенилгексаноил)глицил-N-метилтриптофана, метилового эфира (2S)-2-[(10,11-дигидро-5Н-дибен-зо[b, f ]азепин-5-илкарбонил)амино]-3-(1Н-индол-3-ил)пропионовой кислоты и метилового эфира (2S)-2-[({3-[(этоксикарбонил)амино]-10,11-дигидро-5Н-дибензо[b, f ]азепин-5-ил}карбонил)амино]-3-(1Н-индол-3-ил)пропионовой кислоты свидетельствовали в пользу активной конформации ГБ-115 как изгиба II-типа.

  • ИССЛЕДОВАНИЕ ФЛУОРЕСЦИРУЮЩИХ КОМПОНЕНТОВ И КОМПЛЕКСООБРАЗОВАНИЯ С ФЕНИЛАЛАНИНОМ, ТИРОЗИНОМ И ТРИПТОФАНОМ ПРЕПАРАТА “ГЕПАРИН”

    АХМАДЕЕВА Г. Х., ОСТАХОВ С. С., СУЛТАНБАЕВ М. В., ЮНУСОВ В. М., ЮНУСОВ М. С. — 2013 г.

    Спектрально-люминесцентным и спектрофотометрическим методами в коммерческом препарате гепарина (Hep) обнаружено присутствие примесей свободных ароматических аминокислот – Phe и Tyr, а также белка эластина. Изучено тушение флуоресценции аминокислот Trp, Tyr и Phe препаратом гепарина и определены константы Штерна-Фольмера (К), отражающие устойчивость его комплексов с аминокислотами. Устойчивость комплексов АК–Hep растет для АК в ряду Trp < Tyr < Phe (соответственно K = 19 ± 2 < 39 ± 3 < 710 ± 70 М-1), что, по-видимому, определяет доминирующий вклад примеси фенилаланина в препарате гепарина. Высказано предположение, что примесь в препарате гепарина животного эластина, значительно отличающегося по структуре от человеческого, при лекарственном применении препарата может быть причиной аллергических реакций вплоть до анафилактического шока.

  • К МЕХАНИЗМУ АНТИАРИТМИЧЕСКОГО ДЕЙСТВИЯ АЛЛАПИНИНА

    ВАХИТОВА Ю. В., ФАРАФОНТОВА Е. И., ХИСАМУТДИНОВА Р. Ю., ЦЫПЫШЕВА И. П., ЮНУСОВ В. М., ЮНУСОВ М. С. — 2013 г.

    Аллапинин (лаппаконитина гидробромид) – препарат для лечения нарушений ритма сердца, проявляющий свойства, типичные для антиаритмиков IC-класса. Механизм его электрофизиологического действия связан с блокадой Na+-каналов с последующим угнетением скорости деполяризации и, как следствие, замедлением проведения импульса и снижением возбудимости в проводящей системе сердца. На данный момент не установлено, с какими факторами связаны побочные эффекты (тахикардия, артериальная гипертензия, нарушения координации и др.) Аллапинина, в связи с чем представляется актуальным исследование молекулярных механизмов его действия. Гены-мишени препарата идентифицировали в условиях моделирования аконитиновой аритмии у крыс с использованием коммерческого набора Rat Neuroscience Ion Channels & Transporters RT2 ProfilerTM PCR Array (SABioscienses). При сравнительной оценке экспрессии 84 генов у опытных (аконитиновая аритмия/Аллапинин) и контрольных (аконитиновая аритмия/физиологический раствор) животных установлены мРНК 18 генов, изменения уровня которых в опыте отличался от контрольного более чем в 2 раза. Установлено, что на фоне аконитиновой аритмии Аллапинин вызывает увеличение уровня мРНК генов, кодирующих различные типы К+-каналов (kcna6, kcnj1, kcnj4, kcnq2, kcnq4), Са2+-канала (cacna1g), везикулярного переносчика ацетилхолина (slc18a3). Снижение уровня мРНК отмечено для генов, кодирующих Na+-канал (scn8a), К+-каналы (kcne1, kcns1), генов мембранных транспортеров (atp4a, slc6a9). Полученные нами данные свидетельствуют о том, что в условиях аконитиновой аритмии Аллапинин модулирует экспрессию генов Na+-, K+-, Ca2+-каналов, проводящих ионные токи (INa, Ito, IKs, IK1, ICaT), которые участвуют в формировании различных фаз потенциала действия. Выявленное влияние препарата на уровень мРНК генов, кодирующих переносчики ацетилхолина и глицина, позволяет сделать предположение об участии указанных нейромедиаторов в механизмах реализации антиаритмических свойств Аллапинина.

  • КАЛИКС[4]АРЕНХАЛКОНАМИДЫ С-136 И С-137 ГИПЕРПОЛЯРИЗУЮТ МЕМБРАНУ МИТОХОНДРИЙ МИОМЕТРИЯ

    БАБИЧ Л. Г., БОЙКО В. И., КЛЯЧИНА М. А., КОСТЕРИН С. А., ШЛЫКОВ С. Г. — 2013 г.

    Каликсарены – макроциклические соединения, взаимодействующие с биологически активными молекулами и ионами, вызывающие тем самым изменение хода ряда биохимических и биофизических процессов. Цель работы – исследование влияния каликс[4]аренов (К[4]A) С-136, С-137 и С-138 (приведены шифры) на поляризацию внутренней мембраны митохондрий миометрия крыс. Структура молекул синтезированных К[4]A была подтверждена методами 1-ЯМР и ИК-спектроскопии. С-136 и С-137 на нижнем ободе каликсареновой молекулы содержат две амидохалконовые группы, а С-138 – одну. С-136 и С-137 различаются наличием эфирных или гидроксильных групп, соответственно, на нижнем ободе каликсареновой платформы, а также длиной алкильного спейсера между амидохалконовыми группами и макроциклом. Было показано, что в водной среде и в DMF С-136, С-137 и С-138 образуют мицеллы. Облучение мицелл аргоновым лазером на проточном цитометре приводит к появлению автофлуоресценции. В водной среде мицеллы К[4]A взаимодействуют с положительно заряженным потенциалчувствительным флуоресцентным зондом TMRM. Однако К[4]A, растворенные в DMF, не взаимодействуют с зондом TMRM. Уровень поляризации митохондриальных мембран тестировали с помощью флуоресцентных зондов MTG и TMRM на конфокальном микроскопе и зонда TMRM на проточном цитометре. Опыты проводили с использованием клеток миометрия в культуре и суспензии пермеабилизированных дигитонином миоцитов матки. С-136 и С-137 (10 мкМ) гиперполяризовали мембрану митохондрий. Максимальный эффект составлял 173% относительно контроля. В то же время С-138 не влиял на мембранный потенциал митохондрий. Обсуждается связь между структурной организацией молекул исследуемых каликс[4]аренов и их действием на поляризацию митохондриальной мембраны.

  • КОЛИЧЕСТВЕННОЕ СРАВНЕНИЕ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ ПРИ ИХ СОЕДИНЕНИИ С ПОМОЩЬЮ IRES ИЛИ КОДИРУЮЩЕЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 2А-ПЕПТИДА ТЕШОВИРУСА СВИНЕЙ В БИЦИСТРОННОМ ВЕКТОРЕ

    ВВЕДЕНСКИЙ А. В., ВИНОГРАДОВА Т. В., КОПАНЦЕВ Е. П., КУЗЬМИЧ А. И. — 2013 г.

    В биотехнологии часто требуется осуществить одновременную экспрессию нескольких целевых генов. С этой целью активно разрабатываются мультицистронные векторы, кодирующие несколько белков. Наиболее часто в коммерчески доступных векторах такого типа используют различные варианты внутреннего сайта посадки рибосом вируса энцефаломиокардита (IRES EMCV). Однако многие исследователи считают более перспективным использование бицистронных векторов на основе последовательностей, кодирующих саморасщепляющиеся 2А-пептиды. В работе проведено сравнение эффективности экспрессии генов в клеткаx, трансфицированных бицистронными векторами на основе IRES EMCV или нуклеотидной P2A-последовательности, соответствующей 2А-пептиду тешовируса-1 свиней. Эффективность экспрессии определена в трeх клеточных линиях млекопитающих посредством измерения уровня коэкспрессии генов, кодирующих флуоресцентные белки RFP и EGFP, связанных друг с другом через IRES или P2A-последовательность. Более высокий уровень экспрессии трансгенов обнаруживался в клетках, трансфицированных генетической конструкцией на основе P2A-последовательности.

  • КОМПАКТНЫЙ МИКРОЧИП ДЛЯ ТИПИРОВАНИЯ ВИРУСА ГРИППА А

    КОСТИНА Е. В., РЯБИНИН В. А., СИНЯКОВ А. Н. — 2013 г.

    Предложен вариант универсального олигонуклеотидного гибридизационного микрочипа размером 6 ? 5 спотов (4 ? 4 мм), функционирующий по принципу “один спот – один субтип”, который может явиться прообразом биосенсора для фиксации вируса гриппа А и типирования 15 субтипов гемагглютинина и 9 субтипов нейраминидазы.

  • КОМПАРТМЕНТАЛИЗАЦИЯ ПЕРЕДАЧИ СИГНАЛОВ, ОПОСРЕДОВАННЫХ АКТИВНЫМИ ФОРМАМИ КИСЛОРОДА

    БЕЛОУСОВ В. В., ЕНИКОЛОПОВ Г. Н., МИШИНА Н. М. — 2013 г.

    Локализация сигнальных молекул вблизи их мест действия является центральным принципом клеточной передачи сигнала. Колокализация многокомпонентных сигнальных комплексов осуществляется через белковые каркасы, которые позволяют достичь большей специфичности, чем в случае простой диффузии того же набора участников процесса. Пероксид водорода, образующийся в результате реакции дисмутации супероксид-аниона в клетках в ответ на активацию мембранных рецепторов, участвует в регуляции сигнальных каскадов. Мишенями пероксида служат тиоловые группы остатков цистеина, имеющие низкие значения рКа и расположенные в активных центрах ферментов. Обсуждаются вопросы локализации различных NADPH-оксидазных комплексов, продуцирующих активные формы кислорода (АФК), и подчеркивается, что локализация сигнальных молекул вблизи их мест действия является центральным принципом клеточной передачи сигнала. Представлены данные, полученные с помощью исследований локальной продукции АФК с использованием генетически кодируемых флуоресцентных индикаторов (“HyPer”), напрямую свидетельствующие об ограничении распространения АФК в клетке.

  • КОМПОЗИТЫ ПЕПТИДО-НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ С НАНОЧАСТИЦАМИ ДИОКСИДА ТИТАНА. II+. ДИССОЦИАЦИЯ ДНК/ПНК ДУПЛЕКСОВ В СОСТАВЕ НАНОКОМПОЗИТОВ TIO2 · ПОЛИЛИЗИН · ДНК/ПНК И В РАСТВОРЕ. ВЛИЯНИЕ ПОЛИЛИЗИНА

    АМИРХАНОВ Н. В., АМИРХАНОВ Р. Н., ЗАРЫТОВА В. Ф. — 2013 г.

    При создании эффективных лекарственных препаратов важным является не только их транспорт, но и возможность освобождения препарата от “транспортера” после доставки его в клетку. Показано, что пептидо-нуклеиновые кислоты (ПНК) в составе нанокомпозитов TiO2· PL · ДНК/ПНК диссоциируют c типичным видом кривой термической денатурации, а полилизин (PL) в составе нанокомпозита практически не влияет на диссоциацию ДНК/ПНК-дуплексов. Эти данные свидетельствуют, что ПНК в составе нанокомпозитов TiO2· PL · ДНК/ПНК иммобилизованы обратимо и способны диссоциировать в раствор освобождаясь при этом от TiO2-носителя. В противовес этому, диссоциация ДНК/ДНК – и ДНК/ПНК-дуплексов в физиологическом растворе в присутствии PL не наблюдается. Выявлено, что в растворе PL аномально сильно влияет на характер изменения оптической плотности от температуры и от времени для ДНК/ДНК- и в меньшей степени для ДНК/ПНК-дуплексов. Сделано предположение, что в растворе PL с ДНК/ДНК-дуплексами образует тройные поликомплексы (-PL · ДНК/ДНК-)m, которые способны агрегировать и выпадать в осадок. ДНК/ПНК-дуплексы могут взаимодействовать с PL в растворе с образованием тройных монокомплексов PL · (ДНК/ПНК)n, состоящих из одной цепи PL и одного или нескольких (n) ДНК/ПНК-дуплексов, которые не выпадают в осадок, но из которых диссоциация дуплексов ДНК/ПНК затруднена.

  • КОНЪЮГАТЫ ЦИКЛООЛИГОСАХАРИДНЫХ МАТРИЦ С УГЛЕВОДНЫМИ ЛИГАНДАМИ: МЕТОДЫ СИНТЕЗА И ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ С ЛЕКТИНАМИ

    ГЕНИНГ М. Л., НИФАНТЬЕВ Н. Э., ТИТОВ Д. В., ЦВЕТКОВ Ю. Е. — 2013 г.

    В обзоре рассмотрены основные методы получения моно- и олигодентатных гликоконъюгатов на основе циклодекстриновых и циклоолиго- -(1 6)-D-глюкозаминовых матриц. Обсуждаются данные по биологической активности гликоконъюгатов на примере их взаимодействия с углеводсвязывающими белками – лектинами.

  • МЕМБРАНОПРОТЕКТОРНЫЕ СВОЙСТВА ДИАСТЕРЕОМЕРОВ 13(2)-N-Н-ОКТИЛ-N-(2-ГИДРОКСИ-3-ИЗОБОРНИЛ-5-МЕТИЛБЕНЗИЛ)АМИДА МЕТИЛФЕОФОРБИДА A

    БЕЛЫХ Д. В., БУРАВЛЕВ Е. В., КУЧИН А. В., ТАРАБУКИНА И. С., ЧУКИЧЕВА И. Ю., ШЕВЧЕНКО О. Г. — 2013 г.

    Исходя из (+)- и (–)-энантиомеров 2-изоборнил-4-метилфенола синтезированы два диастереомера 13(2)-N-н-октил-N-(2-гидрокси-3-изоборнил-5-метилбензил)амида метилфеофорбида a. Оценка мембранопротекторной и антиоксидантной активности отдельных диастереомеров на модели Н2О2-индуцированного гемолиза эритроцитов показала, что стереохимия изоборнильного заместителя в синтезированных конъюгатах не оказывает влияния на их биологическую активность.

  • МЕТИЛИРОВАНИЕ 5-КОНЦЕВОЙ ОБЛАСТИ ПСЕВДОГЕНА PTENP1 ПРИ РАКЕ И ГИПЕРПЛАЗИЯХ ЭНДОМЕТРИЯ

    КОВАЛЕНКО Т. Ф., ОЗОЛИНЯ Л. А., ПАТРУШЕВ Л. И., СОРОКИНА А. В. — 2013 г.

    Генетические мутации в гене опухолевого супрессора PTEN часто обнаруживают в малигнизированных клетках человека, и эти изменения генома особенно характерны для рака эндометрия. Исследования, проведенные нами ранее, указывали на возможность реализации альтернативного эпигенетического механизма в инактивации гена PTEN при раке эндометрия через метилирование его промоторной области. Кроме того, недавно в литературе появились указания на участие псевдогена PTENP1 в позитивной регуляции экспрессии гена PTEN. С учетом этого в работе разными методами исследован статус метилирования области минимального промотора гена опухолевого супрессора PTEN и -концевой последовательности его псевдогена PTENP1 при раке и гиперплазиях эндометрия. Установлено, что исследованная ДНК гена PTEN не метилирована. В то же время область псевдогена PTENP1 более чем в 50% случаев метилирована при раке (11/18) и гиперпластических процессах (5/9) эндометрия, но не в большинстве исследованных нормальных тканей. Предполагается, что метилирование последовательностей псевдогена может ингибировать обычно наблюдаемую его транскрипцию, и, в соответствии с концепцией конкурирующих эндогенных мРНК (кэРНК), могло бы сопровождаться подавлением экспрессии гена PTEN по механизму РНК-интерференции. Таким образом, аберрантное подавление транскрипции псевдогена PTENP1 посредством его метилирования может вносить вклад в патогенез рака эндометрия. -концевой последовательности его псевдогена PTENP1 при раке и гиперплазиях эндометрия. Установлено, что исследованная ДНК гена PTEN не метилирована. В то же время область псевдогена PTENP1 более чем в 50% случаев метилирована при раке (11/18) и гиперпластических процессах (5/9) эндометрия, но не в большинстве исследованных нормальных тканей. Предполагается, что метилирование последовательностей псевдогена может ингибировать обычно наблюдаемую его транскрипцию, и, в соответствии с концепцией конкурирующих эндогенных мРНК (кэРНК), могло бы сопровождаться подавлением экспрессии гена PTEN по механизму РНК-интерференции. Таким образом, аберрантное подавление транскрипции псевдогена PTENP1 посредством его метилирования может вносить вклад в патогенез рака эндометрия.

  • МИКРОБНЫЕ МЕТАБОЛИТЫ – ИНГИБИТОРЫ БИОСИНТЕЗА СТЕРОЛОВ, ИХ ХИМИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И ОСОБЕННОСТИ МЕХАНИЗМА ДЕЙСТВИЯ

    ТРЕНИН А. С. — 2013 г.

    Ингибиторы биосинтеза стеролов (ИБС) широко распространены в природе, отличаются заметным разнообразием как по химической структуре, так и по механизму действия. Многие из них, обладая выраженной биологической активностью, хорошо проявили себя при разработке различных лекарственных средств. В обзоре детально описаны биологически активные метаболиты микробного происхождения с установленной химической структурой, способные к подавлению биосинтеза стеролов. Рассматриваются ингибиторы мевалонатного пути биосинтеза холестерола (холестерина) и эргостеролов в клетках млекопитающих и грибов, проявляющие гиполипидемическую и противогрибковую активность, а также ингибиторы альтернативного – немевалонатного (пируват-глицеральдегидфосфатного) пути биосинтеза изопреноидов, перспективные для создания эффективных средств лечения ряда микробных и паразитарных инфекций. Представлен механизм действия указанных соединений на биохимическом и клеточном уровне, приводятся химические формулы основных природных ингибиторов и их полусинтетических производных.

  • МОДУЛЯЦИЯ АКТИВНОСТИ Cа2+-ЗАВИСИМЫХ ПРОТЕИНАЗ БЕСПОЗВОНОЧНЫХ ЖИВОТНЫХ И РЫБ ПРИ ВОЗДЕЙСТВИИ СЛАБЫХ НИЗКОЧАСТОТНЫХ МАГНИТНЫХ ПОЛЕЙ

    КАНЦЕРОВА Н. П., КРЫЛОВ В. В., ЛЫСЕНКО Л. А., НЕМОВА Н. Н., УШАКОВА Н. В. — 2013 г.

    Обсуждаются результаты экспериментов по влиянию слабых низкочастотных магнитных полей на внутриклеточные Са2+-зависимые протеиназы (кальпаины) беспозвоночных животных и рыб. Обнаружено, что прижизненное воздействие слабого низкочастотного магнитного поля с параметрами резонанса для ионов Са2+ приводит к значительному снижению активности кальпаинов у исследованных организмов. Показано, что препараты Cа2+-зависимых протеиназ, выделенные из беспозвоночных животных и рыб, также существенно инактивируются при действии изучаемого физического фактора. Обнаруженный феномен согласуется с интерференционной моделью действия слабых низкочастотных магнитных полей на биологические объекты.

  • МОЛЕКУЛЯРНАЯ МОДЕЛЬ ТРАНСЛОКАЦИИ ЭФФЕКТОРНЫХ СУБЪЕДИНИЦ ТОКСИНОВ С ОБЩЕЙ СТРУКТУРОЙ АВ5 ВНУТРЬ КЛЕТОК-МИШЕНЕЙ

    НОСКОВ А. Н. — 2013 г.

    Предложена модель транслокации А-субъединиц АВ5-токсинов как глобулярных структур. Эта модель основывается на физико-химических процессах, которые индуцируются после формирования поры в мембране. A-субъединица продвигается в цитоплазму посредством разницы потенциалов, создаваемой повышенной активностью К/Na- и Н+-АТP-аз, локализованных в мембране эндосомы. После восстановления внутриклеточными ферментами дисульфидной связи между А1- и А2-фрагментами А1-фрагмент субъединицы проникает в цитоплазму, а B-субъединицы возвращаются в эндосому. A1-фрагмент посредством АDP-рибозилирования или N-гликозилирования инактивирует внутриклеточную мишень, как правило белок, входящий в жизненно важный для клетки ферментативный комплекс. Вернувшиеся в эндосому B-субъединицы гидролизуются эндосомальными (лизосомальными) протеазами, и пора удаляется из мембраны. Эндосома интегрирует с общей клеточной мембраной, и ключевые ферменты (АТP-азы и другие, локализованные в компартменте, участвующем во взаимодействии с токсином) возвращаются в исходное мембранное положение. Предлагаемая модель рецептор-опосредованного эндоцитоза является универсальным механизмом транслокации эффекторных субъединиц токсинов и других белков внутрь клеток-мишеней посредством рецептор-опосредованного эндоцитоза, а также молекулярным инструментом восстановления целостности мембраны от воздействия на клетку поро-формирующих комплексов.

  • НЕОБЫЧНАЯ РЕАКЦИЯ АМИДИРОВАНИЯ АСПАРАГИНСОДЕРЖАЩИХ ГЛИКОПЕПТИДНЫХ АНТИБИОТИКОВ В ПРИСУТСТВИИ ГЕКСАФТОРФОСФАТА (БЕНЗОТРИАЗОЛ-1-ИЛ)ОКСИ-ТРИС(ПИРРОЛИДИНО)ФОСФОНИЯ (PYBOP)

    КОРОЛЕВ А. М., ОЛСУФЬЕВА Е. Н., ПРЕОБРАЖЕНСКАЯ М. Н., РЕЗНИКОВА М. И., СОЛОВЬЕВА С. Е. — 2013 г.

    Конденсирующий реагент гексафторфосфат бензотриазол-1-илокси-трис(пирролидино)фосфония (PyBOP) широко применяется в синтезе различных пептидов и их амидов, в частности карбоксамидов антибиотиков-гликопептидов группы ванкомицина и тейкопланина. Амидирование карбоксильной группы 7-го аминокислотного остатка (АК7) антибиотиков аминами в присутствии PyBOP обычно не сопровождается образованием заметных количеств побочных продуктов. Однако, при синтезе амидов эремомицина с объемными заместителями (адамантил, децил и др.) при использовании PyBOP при pH 8.5 (Et3N или (i-Pr)2EtN) был обнаружен побочный продукт, который был выделен и охарактеризован как незамещенный АК7-амид эремомицина. Взаимодействие Asn-содержащих антибиотиков эремомицина или ванкомицина с избытком реагента PyBOP и Et3N (pH 8.5) в отсутствие амина или аммиака приводило к образованию еще больших количеств соответствующих незамещенных АК7-амидов ( 20). Их строение установлено методами 1H-ЯМР и ESI MS, а также доказано сравнением с аутентичными образцами. Предположено, что источником аммиака в необычной реакции амидирования Asn-содержащих антибиотиков служит амидная группа остатка Asn (АК3).

  • НОВАЯ БАКТЕРИАЛЬНАЯ ВНУТРИКЛЕТОЧНАЯ ФИТАЗА ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ: ВЫДЕЛЕНИЕ И ХАРАКТЕРИСТИКА

    ГРАЙНЕР Р., ДАНИЛОВА Ю. В., СУЛЕЙМАНОВА А. Д., ШАРИПОВА М. Р. — 2013 г.

    Впервые из клеточного лизата энтеробактерий Pantoea vagans 3.2 выделена и исследована фитаза(мио-инозитол-1,2,3,4,5,6-гексакисфосфат-фосфогидролаза), отнесенная к классу гистидиновых кислых фосфатаз (КФ 3.1.3.26). Фермент очищен до гомогенного состояния, установлена его первичная структура. Молекулярная масса белка составила 46 кДа, Km – 0.28 мМ. Изучены некоторые физико-химические свойства фермента.