научный журнал по химии Биоорганическая химия ISSN: 0132-3423

CHANDAN S., GOWDA D. C., SHARMA A., SUHAS R. — 2013 г.

Since discovery and development of effective as well as safe drugs has brought a progressive era in human healthcare that is accompanied by the appearance of drug resistant bacterial strains, there is constant need of new antibacterial agent having novel mechanisms of action to act against the harmful pathogens. In the present study, several N-terminal substituted urea/thiourea derivatives were synthesized by the reaction of glutamic acid and 3-(1-piperazinyl)-1,2-benzisothiazole with various substituted phenyl isocyanates/isothiocyanates. Elemental analysis, IR, 1H NMR, 13C NMR and mass spectral data confirmed the structure of the newly synthesized compounds. The derivatives were investigated for their antibacterial and antifungal activities against various pathogens of human origin by agar well diffusion method and microdilution method. The preliminary antimicrobial bioassay reveals that the compounds containing fluoro and bromo as substituents showed promising antimicrobial activity.

FATEMEH SOGHRA JAHED, GHOLAMHASAN IMANZADEH, GHOLAMREZA ZARRINI, SEYED MEHDI RAZAVI — 2013 г.

Zosima absinthifolia (Vent) Link (Apiaceae) is a perennial herb indigenous to Iran. It has been used as a medicinal plant from ancient time in Iran, Turkey and Pakistan. In the present work, air-dried and powdered plant roots were extracted with n-hexane, dichloromethane and methanol, respectively, using Soxhlet apparatus. The dichloromethane extract was subjected to vacuum liquid chromatography (VLC) and preparative thin layer chromatography (P-TLC) to yield two pyranocoumarins, aegelinol and agasyllin. The antimicrobial assay was performed using agar dilution method. The results showed that purified compounds have modest to weak antibacterial and antifungal activity.

JIAN JING — 2013 г.

Linear hepta-peptide Cys-Lys-Gly-Asp-Trp-Asp-Cys was synthesized first and then disulfide bond was formed between the Cys1 and Cys7 to develop cyclo-heptapeptide containing Lys-Gly-Asp-sequence. Structural simulation showed that Lys-Gly-Asp-motif (KDG) displayed functional conformation. The cyclo-heptapeptide exhibited potent anti-platelet aggregation activity based on specific recognition and interaction with the GPIIb-IIIa receptor on platelet cell membrane. The specific and potent anti-platelet activity makes the KGD-containing cyclo-heptapeptide a possible therapeutic agent.

GEIES AHMED A., KAMAL EL-DEAN ADEL M., RADWAN SHABAN M., TOLBA MAHMOUD S., ZAKI REMON M. — 2013 г.

Reaction of 4-chlorocoumarin-3-carbonitrile with ethyl thioglycolate and ethyl glycinate hydrochloride leads to a series of title products. Hydrazinolysis of amino thienocoumarin carboxylate afforded the hydrazino derivative which underwent various reactions to build new heterocyclic rings containing thienocoumarin moiety. Chloro acetylation of aminoester compound afforded the chloro acetyl amino which underwent nucleophilic substitution reactions various amines. The following treatment with formaldehyde under Mannich conditions afforded the corresponding imidazo derivatives. Reaction of chloroacetylamino with potassium thiocyanate yielded ethylpyrimidothieno coumarin sulfanylacetate which was used as a versatile precursor for synthesis of other heterocycles. On the other hand, reaction of chloro coumarin carbonitrile with hydrazine gave the aminopyrazolocoumaine which reacted with bifunctionally compounds to give the substituted pyrimido derivatives. Diazotization and coupling of aminopyrazole with ethylcyanoacetate yielded ethylaminotriazinopyrazolocoumarine carboxylate. Several of the compounds obtained demonstrated considerable antifungal and antibacterial activity in the in vitro test systems.

AMIN ABDOLLAHI, BAHAREH RAZAVI, MEHDI PORDEL — 2013 г.

The synthesis of a new series of 8-bromo-6-alkyl-1-aryl-6H-isoxazolo[4,3-e]indole derivatives is described. All the newly synthesized compounds were screened for their antibacterial activity against Escherichia coli HB101, Staphylococcuse aureus pathogens (methicillin resistant S. aureus and methicillin susceptible S. aureus), Pseudomonas aeruginosa, and Bacillus subtilis; also MIC values of these compounds were determined.

ANSHU DANDIA, GAJANAND SHARMA, PREETI BANSAL, RICHA SHARMA — 2013 г.

An environmentally benign solvent free synthesis of various spiro-1,4-dihydropyridines (1,4-DHPs) incorporating 2-oxindole/piperidines is performed in 5–8 min with reasonable purity in 80–90% yield under microwave irradiation using montmorillonite KSF as an inorganic solid support. The reaction is found to be general with respect to various cyclic carbonyl compounds, e.g. cyclohexanone, substituted indole-2,3-dione, and piperidinone derivatives. In our study, these compounds were also found effective against dermatophytes and other fungal organisms. Our results suggest that novel spiro derivatives can be used for the treatment of dermatophytosis or ringworm infections.

ABDEL HAFEZ SH. H., ABDEL LATIF N. A., BREAK L. M. — 2013 г.

Synthesis of benzofuran-1,3-thiazolidinone derivatives is described herein. These compounds were prepared via a concise and short route by condensation reaction of khellinone with aromatic/aliphatic amines followed by cyclization using thioglycolic acid. The newly synthesized compounds were characterized using the well known spectroscopic tools (IR, 1H NMR, and mass spectroscopy), as well as microanalysis. In frames of biological screening of the compounds, antioxidant activity was assessed in vitro.

БУТВИЛОВСКАЯ В. И., ВИННИЦКИЙ Л. И., ЗАСЕДАТЕЛЕВ А. С., ЗУБЦОВА Ж. И., МАСЛЕННИКОВ В. В., РЕЗНИКОВ Ю. П., РУБИНА А. Ю., САВВАТЕЕВА Е. Н., САМОХИНА Л. О., ЦЫБУЛЬСКАЯ М. В., ЧЕЧЁТКИН В. Р. — 2013 г.

Разработан прототип тест-системы для одновременного количественного анализа девяти онкомаркеров в сыворотке крови. Основной частью тест-системы является биочип ОМ-9, который содержит иммобилизованные антитела против девяти онкомаркеров: альфа-фетопротеина (АФП), раково-эмбрионального антигена (РЭА), хорионического гонадотропина человека (ХГЧ), карбогидратных антигенов СА 15-3, СА 125, СА 19-9, свободной и общей форм простат-специфического антигена (ПСАсвоб, ПСАобщ), нейрон-специфической енолазы (НСЕ). Разработан протокол двустадийного сэндвич-анализа для проведения одновременного количественного определения девяти маркеров в сыворотке крови пациента. Получены основные аналитические характеристики метода, позволяющие рассматривать данный прототип тест-системы как перспективную разработку для дальнейшего клинического применения. Прототип тест-системы был апробирован на образцах сывороток крови больных онкологическими заболеваниями (252 сыворотки) и на сыворотках здоровых доноров (185 сывороток). Было показано, что для больных онкозаболеваниями превышение концентрации одного или нескольких онкомаркеров над уровнем нормы наблюдалось в 76.6% случаев, в то время как для здоровых доноров мы регистрировали такое превышение концентрации какого-либо маркера только в 6% случаев. Применение современных статистических методов обработки результатов медицинских исследований, ROC-анализа (receiver operating characteristic curves) и логистической регрессии, на примере группы больных колоректальным раком продемонстрировало значительно более высокую диагностическую эффективность одновременного анализа девяти онкомаркеров на биочипах (площадь под ROC-кривой (AUC) составила 0.84) по сравнению с традиционным в таких случаях анализом двух маркеров РЭА и СА 19-9 (AUC = 0.59). Разработанный прототип тест-системы может быть рекомендован как для оценки здоровья населения, например при проведении диспансеризации, так и для мониторирования опухолевого процесса в послеоперационном периоде или после курса специфической терапии.

АБРАМОВ А. Ю., ВОЛЬПИНА О. М., КАМЫНИНА А. В., КОРОЕВ Д. О., ФИЛАТОВА М. П. — 2013 г.

Известно, что при болезни Альцгеймера токсическое действие бета-амилоида на клетки мозга ассоциировано с такими молекулярными изменениями, как оксидативный стресс, увеличение внутриклеточной концентрации Ca2+ в нейронах и астроцитах, а также активация продукции свободных радикалов в астроцитах. Прионный белок может служить посредником для токсического действия бета-амилоида. В работе исследовано влияние аффинноочищенных антител к фрагменту 95–123 прионного белка (PrP-(95-123)) на индуцированную бета-амилоидом гибель нейронов и астроцитов, а также на изменения внутриклеточной концентрации кальция (Са2+-сигнал), производство свободных радикалов и активацию каспазы 3. Впервые показано, что антитела к PrP-(95-123)-фрагменту предохраняют нейроны и астроциты от индуцированной бета-амилоидом гибели, не изменяя внутриклеточную концентрацию Са2+ под действием бета-амилоида. При этом протективное действие антител к прионному белку сопровождается понижением продукции активных форм, индуцированных бета-амилоидом в астроцитах, а также замедлением активации каспазы 3 в нейронах и астроцитах. Таким образом, индукция антител к синтетическому PrP-(95-123)-фрагменту может служить перспективным подходом к терапии болезни Альцгеймера.

БОТИКОВ А. Г., ГАЛЕГОВ Г. А., ДЕРЯБИН П. Г., КОНСТАНТИНОВА И. Д., ЛЬВОВ Д. К., МИРОШНИКОВ А. И., МУЗЫКА И. С., ФАТЕЕВ И. В. — 2013 г.

Усовершенствован биотехнологический способ получения противовирусного препарата рибавирина по реакции трансгликозилирования добавлением каталитических количеств арсената натрия в реакционную смесь. Такой подход позволяет гидролизовать избыточное количество природного нуклеозида – донора рибозы гуанозина и, как следствие, упростить состав реакционной смеси и процесс выделения рибавирина. Показано, что комбинация препаратов рибавирина и озельтамивира карбоксилата снижает репродукцию вируса гриппа А в культуре клеток по сравнению с каждым препаратом, взятым в отдельности. Аналогичные результаты получены в экспериментах на лабораторных животных (белых мышах Balb/C), инфицированных вирусом гриппа А H3N2/Aichi/68.

АКОПОВ С. Б., АМИРХАНОВ Н. В., АМИРХАНОВ Р. Н., БУЛАНЕНКОВА С. С., ЗАРЫТОВА В. Ф., МИХАЙЛОВ В. С., НИКОЛАЕВ Л. Г., ПОТАПОВ В. К., СВЕРДЛОВ Е. Д. — 2013 г.

Сравнивали способность коротких олигомеров пептидо-нуклеиновой кислоты и олигонуклеотидов, содержащих модифицированные остатки 5-метилцитидина, 2-аминоаденозина и 5-пропинил-2-дезоксиуридина (SBO), обладающих повышенным сродством к комплементарной нуклеотидной последовательности, производить аффинный захват целевого двунитевого фрагмента ДНК c такой последовательностью одной из цепей из смеси фрагментов по механизму концевой инвазии. Оба типа зондов в подобранных условиях показали высокую эффективность отбора. Зонды на основе SBO могут представлять собой более доступную и простую в приготовлении альтернативу ПНК для этих целей.

ГНЕЗДИЛОВ О. И., ГУРЬЯНОВ И. Д., КАРАМОВА Н. С., КОШКАРОВА Л. А., ЮСУПОВА Д. В. — 2013 г.

Из биомассы бактерий Serratia marcescens АТСС 9986 выделен пигментный комплекс,который с применением хроматографических методов разделен на отдельные фракции. Анализ фракций спектрофотометрическим методом, тонкослойной хроматографией, ЯМР- и масс-спектрометрией позволил выделить из комплекса так называемую “красную фракцию”, подтвердить идентичность продукта красной фракции пигменту продигиозину и доказать его чистоту. Установлены особенности токсического действия продигиозина. Впервые определена возможность индукции пигментом мутаций в клетках Salmonella typhimurium TA 100 (тест Эймса) и хромосомных повреждений эритробластов млекопитающих.

АЛЕКСАНДРОВА Л. А., ИВАНОВ М. А. — 2013 г.

В обзоре рассмотрены методы синтеза фурано-, тиофено- и пирроло[2,3-d]пиримидиновых дезоксирибонуклеозидов и их производных и исследования взаимосвязи структура – противовирусная активность полученных соединений в отношении вирусов варицелла зостер, гепатита С и ряда других.

ВИНОКУРОВ М. Г., КАЗАКОВА Л. И., КОЧЕТКОВА О. Ю., МОШКОВ Д. А., ШАБАРЧИНА Л. И. — 2013 г.

Получены микрокапсулы, сформированные из синтетических (полистиролсульфонат натрия и полиалилламин гидрохлорид) и биодеградируемых (декстрансульфат и полиаргинин гидрохлорид) полиэлектролитов на карбонатных микрочастицах. Методом просвечивающей электронной микроскопии исследована ультраструктурная организация биодеградируемых микрокапсул. Оболочка биодеградируемых микрокапсул хорошо сформирована уже при шести полиэлектролитных слоях со средней толщиной 44 ± 3.0 нм, а их внутренний полиэлектролитный матрикс более разряжен, чем у синтетических микрокапсул. С помощью метода спектроскопии оценена эффективность включения FITC-меченного БСА методом адсорбции в синтетические микрокапсулы в зависимости от числа полиэлектролитных слоев в них. Показано, что максимальное количество белка включалось в капсулы, имеющие 6 и 7 полиэлектролитных слоев (4 и 2 пг/капсулу соответственно). Сделан вывод, что адсорбция белков в готовые полиэлектролитные капсулы позволяет избежать потери белка по сравнению с методом, в котором для капсулирования используют биоминеральные ядра, получаемые методом копреципитации

ЕФРЕМОВ М. А., КАМЫШНИКОВ О. Ю., КИРИЛИНА Е. А., МАСТЕРНАК Т. Б. — 2013 г.

Изучена способность пептида костномозгового происхождения миелопептида-1 (МП-1) влиять in vivo и in vitro на функциональную активность фагоцитов здоровых и подвергнутых цитостатическому воздействию (введению циклофосфана) мышей. Выявлен корригирующий эффект МП-1 in vitro на функциональную активность фагоцитов костного мозга и периферической крови. Установлена схема введения МП-1 мышам с циклофосфаниндуцированным иммунодецицитом, оптимальная для получения максимального иммунокорригирующего действия. Наиболее выраженный эффект МП-1 на количественные показатели и функциональную активность фагоцитов разной локализации показан при его введении до цитостатика; в этих условиях пептид влияет на нейтрофилы периферической крови. Полученные результаты позволяют рассматривать МП-1 как препарат, предохраняющий фагоциты периферической крови от повреждающего воздействия циклофосфана.

АХМЕТОВА А. И., БАЛАБАН Н. П., НЯМСУРЭН Ч., ШАРИПОВА М. Р. — 2013 г.

Впервые из клеточных лизатов рекомбинантного штамма Escherichia coli выделена и исследована фитаза Bacillus ginsengihumi. Фермент очищен до гомогенного состояния, установлена его первичная структура. Сделано заключение, что фитаза относится к классу -пропеллерных фосфатаз. Молекулярная масса белка составила 41 кДа, рI 4.8. Изучены некоторые физико-химические свойства фермента.

ЗАВРИЕВ С. К., РЯЗАНЦЕВ Д. Ю., СТАХЕЕВ А. А., ХАЙРУЛИНА Д. Р. — 2013 г.

На основе последовательностей нуклеотидов гена фосфатпермеазы разработана система высокоспецифичной ПЦР-идентификации фитопатогенного гриба Fusarium cerealis. Секвенирование и последующий анализ показали, что этот ген обладает высокой степенью полиморфизма и может быть использован как для филогенетических исследований, так и в качестве маркера для подбора специфических праймеров. Исследования специфичности разработанных праймеров подтвердили отсутствие перекрeстных реакций с ДНК близкородственных видов грибов рода Fusarium. ПЦР в реальном времени продемонстрировала высокую чувствительность тест-системы, составившую 10 пг специфической ДНК на реакцию.

АНТИМОНОВА А. Н., БАЕВ Д. С., ГРИГОРЬЕВ И. А., ЖУКОВА Н. А., ПЕТРЕНКО Н. И., СОРОКИНА И. В., ТОЛСТИКОВА Т. Г., ШУЛЬЦ Э. Э. — 2013 г.

Показано, что амиды бетулоновой кислоты, содержащие фрагменты нитроксильных радикалов, обладают антихолестатическим эффектом. Наличие пиперидинового нитроксильного фрагмента в структуре бетулоновой кислоты повышает ее гепатопротекторную активность. Внутрижелудочное введение пиперидинового нитроксильного производного в дозе 50 мг/кг в течение 8 дней после перевивки карциномы легких Льюис не оказывает влияния на рост трансплантатов, но увеличивает продолжительность жизни мышей-опухоленосителей.

КУРЬЯНОВ В. О., ЛУЩИК А. А., ЧУПАХИНА Т. А. — 2013 г.

Взаимодействие 1-(2-ацетамидо-3,4,6-три-О-ацетил-2-дезокси- -D-глюкопиранозилокси)-бензотриазола с первичными и вторичными алифатическими и циклоалифатическими спиртами, а также с диизопропилиденгалактозой в среде кипящего дихлорметана, в присутствии промоторов – кислот Льюиса – протекает с образованием алкил-О-глюкозаминидов с 1,2-транс-конфигурацией гликозидной связи. Показано, что в этих условиях другие глюкозаминиды производных гидроксиламина в рассматриваемую реакцию не вступают. Строение синтезированных гликозидов доказано 1-ЯМР-спектроскопией, а также сравнением с соединениями-свидетелями.

БОРВИНСКАЯ Е. В., НЕМОВА Н. Н., СМИРНОВ Л. П. — 2013 г.

Из печени щуки Esoх lucius выделена глутатион-S-трансфераза (GST), которая очищена до гомогенного состояния согласно критериям подвижности при SDS-электрофорезе и изоэлектрофокусировании. Фермент представляет собой гомодимер с молекулярной массой субъединицы 25235.36 Да (по данным ВЭЖХ-МС/МС) и pI около 6.4. Исследованы первичная структура, субстратная специфичность, термостабильность, зависимость каталитической активности фермента от кислотности среды и концентрации субстрата. Выделенная изоформа GST была идентифицирована как GST класса альфа.