Архив научных статейиз журнала «Генетика»
-
ОСОБЕННОСТИ ГЕНОВ БЕЛКА ОБОЛОЧКИ РОССИЙСКИХ ШТАММОВ ВИРУСА ЗЕЛЕНОЙ КРАПЧАТОЙ МОЗАИКИ ОГУРЦА
АНДРЕЕВА Э.Н., ОДИНЦОВА Т.И., ПУХАЛЬСКИЙ В.А., СЛАВОХОТОВА А.А., ШИЯН А.Н. — 2007 г.
Представлены результаты изучения первичной структуры генов белка оболочки патогенного штамма ВЗКМО МС-1 и вакцинного штамма ВИРОГ-43М. По аминокислотному составу белков оболочки штаммы ВИРОГ-43M и МС-1 являются типичными представителями ВЗКМО, так как имеют гомологию 98100% с белками оболочки различных представителей данной группы тобамовирусов. Гены белка оболочки патогенного штамма МС-1 и вакцинного ВИРОГ-43М имеют одинаковый нуклеотидный состав, из чего следует, что аттенуированность штамма не определяется этим геном. Полностью идентичным оказался аминокислотный состав белков оболочки у российских и двух греческих штаммов GR-3, GR-5, однако нуклеотидная последовательность генов белков оболочки у этих штаммов отличается по 13 позициям, что свидетельствует о неидентичности этих штаммов российским.
-
ОСОБЕННОСТИ РАСПРОСТРАНЕНИЯ НАСЛЕДСТВЕННЫХ БОЛЕЗНЕЙ В РАЗЛИЧНЫХ ПОПУЛЯЦИЯХ РОССИИ
БАРЫШНИКОВА Н.В., ГИНТЕР Е.К., ЕЛЬЧИНОВА Г.И., ЗИНЧЕНКО Р.А., ПОЛЯКОВ А.В. — 2007 г.
Работа посвящена особенностям территориального распространения наследственных болезней в различных популяциях и этнических группах России. Анализируются основные закономерности формирования груза и спектра наследственных болезней в 10 регионах России (пять этнических групп: русские из шести регионов, марийцы, чуваши, удмурты, адыгейцы). На основе изучения корреляций предположено, что основной причиной генетической дифференциации популяций по отягощенности наследственными болезнями является дрейф генов. Проанализировано накопление наследственных заболеваний в отдельных популяциях и/или этнических группах. Представлены наследственные заболевания, обнаружившие локально высокие частоты в отдельных популяциях или этнических группах. Анализ основных закономерностей и изменчивости различных популяций и этнических групп по накоплению отдельных наследственных заболеваний проводили с использованием анализа главных компонент, который описывает эти закономерности в более наглядном виде. Показано, что гены наследственных болезней могут служить мощным инструментом для характеристики этногенетических процессов, происходящих в популяциях.
-
ОСОБЕННОСТИ СТРУКТУРНОЙ ОРГАНИЗАЦИИ ГЕНА DIP1 В ЛИНИЯХ DROSOPHILA MELANOGASTER, МУТАНТНЫХ ПО ГЕНУ FLAMENCO
КИМ А.И., НЕФЕДОВА Л.Н., РОМАНОВА Н.И. — 2007 г.
Осуществлено молекулярное клонирование гена DIP1, локализованного в районе 20А45, из линий с фенотипом flamenco: flam SS (SS), flam MS (MS), характеризующихся высоким темпом транспозиций ретротранспозона МДГ4 (gypsy), flam py + (P), несущей инсерцию конструкции на основе Р-элемента в область гена flamenco, и линии flamenco+. Рестрикционный анализ и результаты секвенирования клонированных фрагментов ДНК показали, что структура DIP1 в линиях flam SS, flam MS и flam py + (P), flamenco+ имеет существенные различия. В линиях flam SS и flam MS не выявлен сайт рестрикции DraI в положении 1765, находящийся в кодирующей части гена, а именно в домене, определяющем сигнал ядерной локализации белка DIP1. Эта мутация оказалась обусловленной мононуклеотидной заменой в сайте узнавания рестриктазы DraI, который превращается из ТТТААА в ТТТААG и поэтому не распознается ферментом. Эта замена приводит к изменению кодона ААА на ААG и является трансляционно незначащей, поскольку оба триплета кодируют одну и ту же аминокислоту лизин. В гене DIP1 в линиях flam SS и flam MS обнаружена инсерция фрагмента ДНК размером 182 пн, обозначенная IdSS (Insertion in DIP1 strain SS), которая локализована во втором интроне. Последовательность IdSS входит в состав ОРС, кодирующей гипотетическую транспозазу мобильного элемента НВ1, относящуюся к семейству Tc1/mariner. Предполагается, что она может приводить к нарушениям конформации ДНК и хромосомы, в частности за счет образования петлевых структур, изменяя экспрессию гена DIP1 и, возможно, соседних с ним генов. В линиях flamenco+ и flam py + (P) внутри последовательности HB1 вставка IdSS делетирована. Делеция захватывает пять С-концевых аминокислотных остатков консервативного домена и всю С-концевую часть гипотетической транспозазы НВ1. Полученные данные позволяют предположить, что DIP1 принимает участие в контроле транспозиций МДГ4 (gypsy) либо самостоятельно, либо взаимодействуя с другими элементами генома.
-
ОЦЕНКА ВКЛАДА ПЕРЕРАСПРЕДЕЛЕНИЯ ЭКСПРЕССИИ ЛОКУСОВ И АЛЛЕЛЬНЫХ ЗАМЕЩЕНИЙ В ГЕНЕТИЧЕСКУЮ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЮ ТАКСОНОВ РАЗНЫХ РАНГОВ У ЖИВОТНЫХ
ТРУВЕЛЛЕР К.А., ЧЕРНЫШОВ К.И. — 2007 г.
Проведена количественная оценка вклада разных групп локусов (i локусы с идентичным, s сходным, d полностью различающимся набором аллелей; o локусы, для которых отмечено изменение экспрессии) в формирование генетических различий между таксонами животных разного ранга. Показано, что на внутривидовом уровне основное значение имеют i- и s-локусы; на видовом уровне картина дифференциации меняется, количественно на первый план выходят d-локусы и появляются o-локусы, что указывает на принципиальные изменения геномов при видообразовании. Соотношение вклада выделенных групп локусов относительно стабильно в пределах класса, а для разных классов различается. Интересно, что птицы достигают значений видового уровня дифференциации амфибий (по соотношению выделенных компонентов) лишь на уровне семейств. Данный метод анализа особенно эффективно использовать для выделения гибридных популяций или особей.
-
ОЦЕНКА ЭФФЕКТИВНОСТИ ОБЛУЧЕНИЯ СЕМЯН ТЕПЛОВЫМИ НЕЙТРОНАМИ ДЛЯ ИНДУКЦИИ АБЕРРАЦИЙ ХРОМОСОМ У ХЛОПЧАТНИКА GOSSYPIUM HIRSUTUM L. В М1
РАХМАТУЛЛИНА Э.М., САНАМЬЯН М.Ф. — 2007 г.
Показано, что облучение семян хлопчатника тепловыми нейтронами в дозах 15, 25 и 35 Гр индуцирует большое число измененных растений, в том числе стерильных и химерных. Установлено, что в основном фенотипические изменения обусловлены возникновением геномных, хромосомных и десинаптических мутаций. Присутствие этих мутаций в кариотипе растений М1 часто приводило к снижению мейотического индекса и фертильности пыльцы. У транслокационных форм снижение фертильности пыльцы было обусловлено преобладанием квадривалентов в форме колец и цепей с примыкающим типом расхождения хромосом из транслокационных комплексов. На основании форм и размеров мультивалентных ассоциаций дана предварительная оценка локализации транслокационных точек разрывов. Отличительной особенностью воздействия тепловых нейтронов в М1 после облучения было индуцирование большого числа уникальных аберраций хромосом, заключавшееся в появлении у одного и того же растения сразу нескольких типов мутаций (геномных и хромосомных), комплекса обменов на одно ядро и множественных обменов с вовлечением трех негомологичных хромосом.
-
ПАМЯТИ АКАДЕМИКА ВЛАДИМИРА АЛЕКСАНДРОВИЧА СТРУННИКОВА (15.07.191409.12.2005)
МИТРОФАНОВ В.Г., ОЗЕРНЮК Н.Д., СТРУННИКОВА Л.В. — 2007 г.
-
ПАМЯТИ АЛЕКСЕЯ ПАВЛОВИЧА АКИФЬЕВА (19382007)
2007
-
ПАМЯТИ ВИТАЛИЯ ВЛАДИМИРОВИЧА СУХОДОЛЬЦА (19372007)
2007
-
ПЕРСПЕКТИВЫ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ АВТОФЕРТИЛЬНОСТИ В СЕЛЕКЦИИ СОРТОВ-ПОПУЛЯЦИЙ У РЖИ
ВОЙЛОКОВ А.В. — 2007 г.
Успехи селекции гибридов у ржи связаны с использованием автофертильных форм. Автофертильность у ржи определяется мутациями в одном из трех гаметофитных локусов S, Z или T, контролирующих реакцию несовместимости. Попытки создания синтетических популяций на основе объединения автофертильных форм, отобранных по общей комбинационной способности, не привели к успеху из-за высокого уровня самоопыления. Предлагается схема селекции, включающая в себя скрещивание линии, несущей мутацию автофертильности в локусе S, с растениями улучшаемой популяции, самоопыление полученных гибридов, отбор и переопыление лучших инбредных потомств с последующим устранением мутации автофертильности из селектируемого материала с помощью изозимного маркера Prx7. Схема может быть использована для улучшения существующих сортов ржи, их дифференциации на субпопуляции разного хозяйственного назначения, создания и совершенствования комплементарных генных пулов в селекции гибридов. Возможность реализации предлагаемой схемы подкреплена разработкой оригинального высокопроизводительного оборудования, предназначенного для проведения изозимного анализа.
-
ПОВЕДЕНИЕ ПОЛОВЫХ ХРОМОСОМ В РАННЕМ МЕЙОЗЕ У ТРЕХ ВИДОВ ЛЕСНЫХ МЫШЕЙ РОДА APODEMUS (RODENTIA, MURIDAE)
САФРОНОВА Л.Д., ЧЕРЕПАНОВА Е.В. — 2007 г.
Изучена профаза первого деления мейоза у лесных мышей видов Apodemus (Sylvaemus) flavicollis, A. (S.) ponticus и A. (S.) uralensis методами световой и электронной микроскопии. На основании данных электронно-микроскопического анализа синаптонемных комплексов сперматоцитов I у этих трех видов представлено описание их кариотипов. Осевые элементы половых хромосом на стадии раннейсредней пахитены синаптируют по большей части длины Y-оси; к поздней пахитене началу диплотены участок синапсиса сокращается, и на стадии диакинезаметафазы I X- и Y-хромосомы ассоциируют конец-в-конец у всех изученных видов. Синаптическое поведение половых хромосом у изученных видов оказалось очень схожим. Полученные результаты обсуждаются в свете ранее опубликованных данных об особенностях поведения половых хромосом у разных видов грызунов в профазе мейоза I и их дифференциальной структуре.
-
ПОДТВЕРЖДЕНИЕ ПОЛОЖИТЕЛЬНОЙ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ВЗАИМОСВЯЗИ МАЯТНИКООБРАЗНЫХ ДВИЖЕНИЙ С АУДИОГЕННОЙ ЭПИЛЕПСИЕЙ, КАТАЛЕПСИЕЙ И “НЕРВНОСТЬЮ” У КРЫС
БАРЫКИНА Н.Н., КОЛПАКОВ В.Г., ПЛЮСНИНА И.З., ПРОКУДИНА О.И., ЧУГУЙ В.Ф. — 2007 г.
Исследовали взаимоотношения между предрасположением к маятникообразным движениям (МД), каталепсией и аудиогенной эпилепсией при селекции на “нервность” и застывание. Показана положительная генетическая связь между МД, каталепсией и аудиогенной эпилепсией. Крысы линии, селектированной на усиление МД (МД+), с частотой 8090% проявляют предрасположенность к аудиогенным приступам, тогда как у крыс линии, свободной от МД (МД), эта частота составляет 1040%.
-
ПОЛИМОРФИЗМ C1473G В ГЕНЕ TPH2 ОСНОВНОЙ ФАКТОР, ОПРЕДЕЛЯЮЩИЙ ГЕНЕТИЧЕСКУЮ ИЗМЕНЧИВОСТЬ АКТИВНОСТИ ТРИПТОФАНГИДРОКСИЛАЗЫ-2 В ГОЛОВНОМ МОЗГЕ МЫШЕЙ
КУЛИКОВ А.В., ОСИПОВА Д.В., ПОПОВА Н.К. — 2007 г.
Медиатор мозга серотонин участвует в регуляции многих физиологических функций и видов поведения. Ключевым ферментом синтеза серотонина в мозге является триптофангидроксилаза-2 (ТПГ-2). В работе выявлена ассоциация полиморфизма C1473G в гене tph2, приводящего к замене Pro447 на Arg447 в молекуле ТПГ-2, с активностью фермента в мозге мышей 10 инбредных линий. Показано сцепление полиморфизма с активностью ТПГ-2 в мозге гибридов F2 между линиями C57BL/6 и CC57BR. Результаты свидетельствуют о том, что полиморфизм C1473G в гене tph2 является основным фактором, определяющим генетическую изменчивость активности фермента в головном мозге мышей.
-
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНА АПОЛИПОПРОТЕИНА Е APOE В ПОПУЛЯЦИЯХ РОССИИ И СОПРЕДЕЛЬНЫХ СТРАН
БОЙКО С.Г., БОРИНСКАЯ С.А., ВЕРШУБСКАЯ Г.Г., ВЕСЕЛОВСКИЙ Е.М., ГАРМАШ И.В., ГУПАЛО Е.Ю., КАЛЬИНА Н.Р., КОЖЕКБАЕВА Ж.М., КОЗЛОВ А.И., ОГУРЦОВ П.П., ПАРШУКОВА О.Н., РОГАЕВ Е.И., САНИНА Е.Д., ЯНКОВСКИЙ Н.К. — 2007 г.
В 16 популяциях, представляющих 12 этнических групп (всего 1103 индивида) России и сопредельных стран, установлены частоты аллелей и генотипов гена аполипопротеина Е (APOE), участвующего в регуляции липидного обмена. Частоты аллеля 4, являющегося фактором риска болезни Альцгеймера и ишемической болезни сердца, варьируют в исследованных группах от менее 5 до более 20%, а мажорного аллеля 3 от менее 75 до 95%. Частоты аллелей 3 и 4 составили 0.714 и 0.205 у саамов, 0.735 и 0.220 у коми-ижемцев, 0.770 и 0.130 у коми-зырян, 0.771 и 0.149 у удмуртов, 0.734 и 0.149 у мари, 0.841 и 0.122 у эвенков, 0.788 и 0.163 у бурят, 0.764 и 0.202 у чукчей, 0.875 и 0.075 у иранцев, 0.956 и 0.044 у горцев Памира, 0.771 и 0.094 у украинцев, 0.795 и 0.091 у белорусов. У русских разных регионов частоты этих аллелей составили 0.728 и 0.139 (Кострома), 0.795 и 0.105 (Москва), 0.857 и 0.092 (Ростов-на-Дону), 0.824 и 0.083 (Краснодар) соответственно. Показано, что частоты аллелей 3 и 4 гена APOE в исследованных популяциях имеют широтное распределение, соответствующее градиенту частот этих аллелей в популяциях Евразии.
-
ПОЛИМОРФИЗМ И ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ МУЛЬТИЛОКУСНЫХ МАРКЕРОВ ДНК В ПРИРОДНЫХ ПОПУЛЯЦИЯХ DROSOPHILA MELANOGASTER
ВАУЛИН О.В., ГУНДЕРИНА Л.И., ЗАХАРОВ И.К. — 2007 г.
Проведен анализ изменчивости и дивергенции геномной ДНК в двух российских и трех украинских популяциях Drosophila melanogaster с использованием мультилокусных (RAPD) маркеров. В изученных популяциях D. melanogaster обнаружен высокий уровень полиморфизма RAPD-маркеров. Оценка генетических расстояний между популяциями показала низкую степень генетической дифференциации географически удаленных популяций D. melanogaster. Установлено существование значительного потока генов между популяциями D. melanogaster и показана зависимость его от географического расстояния между популяциями.
-
ПОЛИМОРФИЗМ И ФЕНОГЕОГРАФИЯ СИЗЫХ ГОЛУБЕЙ ЕВРОПЫ
ОБУХОВА Н.Ю. — 2007 г.
Исследована изменчивость окраски оперения сизых голубей в 192 городах и населенных пунктах Европы. Как и в предыдущих работах, выделяли шесть окрасочных фенотипов, основные из которых сизый, переходный и меланистический. Выявлены закономерности распределения частот фенотипов в городах и сельских ландшафтах. Наиболее меланизированными оказались популяции голубей, обитающие в условиях повышенной плотности. Популяции сельских ландшафтов менее меланизированы, чем городские. Частота встречаемости птиц аберрантной окраски колеблется случайно и повышается в некоторых локальных местообитаниях. Показано, что фенотипическая структура популяций синантропных сизых голубей Европы находится под влиянием широтного градиента.
-
ПОЛИМОРФИЗМ КУЛЬТУРНОГО ЯЧМЕНЯ (HORDEUM VULGARE L.) ТУРЦИИ ПО ГОРДЕИН-КОДИРУЮЩИМ ЛОКУСАМ
ЛЯЛИНА Е.В., МАРТЫНОВ С.П., ПОМОРЦЕВ А.А. — 2007 г.
Методом электрофореза в крахмальном геле изучен полиморфизм гордеинов, контролируемых локусами Hrd A, Hrd B и Hrd F, у 93 образцов местных ячменей, отнесенных к 17 древним провинциям Турции. Для локуса Hrd A обнаружено 45 аллелей с частотами 0.1129.34%, для локуса Hrd B 51 аллель с частотами 0.118.07% и для локуса Hrd F 5 аллелей с частотами 0.7541.29%. На основе кластерного анализа матрицы частот аллелей сделан вывод о сходстве популяций ячменя из различных древних провинций Турции. Обнаружена кластерная структура популяций местного ячменя, большинство из которых (82%) принадлежит к трем кластерам. Первый кластер составили популяции из шести провинций: Фракии, Вифинии, Понта, Лидии, Каппадокии, Армении; второй из пяти провинций: Пафлагонии, Галатии, Ликаонии, Киликии и Месопотамии; третий из трех провинций: Фригии, Карии, Ликии. Популяции из провинций Мизия, Памфлия и Сирия не вошли ни в один из кластеров.
-
ПОЛИМОРФИЗМ КУЛЬТУРНОГО ЯЧМЕНЯ (HORDEUM VULGARE L.) ЮЖНОЙ АРАВИИ ПО ГОРДЕИН-КОДИРУЮЩИМ ЛОКУСАМ
ЛЯЛИНА Е.В., ПОМОРЦЕВ А.А. — 2007 г.
Методом электрофореза в крахмальном геле изучен полиморфизм гордеинов, контролируемых локусами Hrd A, Hrd B и Hrd F, у 89 образцов местных ячменей из Южной Аравии (Йемена). Для локуса Hrd A обнаружено 36 аллелей, для локуса Hrd B 48 аллелей и для локуса Hrd F 5 аллелей. Показано существование семейств блоков компонентов гордеинов, контролируемых локусами Hrd A и Hrd B. На основе расчета генетических расстояний сделан вывод о большем сходстве популяций ячменя из Йемена и Эфиопии между собой в сравнении с популяциями из Египта, что подтверждает гипотезу Ф.Х. Бахтеева о происхождении эфиопских ячменей.
-
ПОЛУЧЕНИЕ ПШЕНИЧНО-РЖАНЫХ ЗАМЕЩЕННЫХ ЛИНИЙ НА ОСНОВЕ ОЗИМЫХ СОРТОВ РЖИ С ИДЕНТИФИКАЦИЕЙ КАРИОТИПОВ МЕТОДАМИ С-БЭНДИНГА, GISH И SSR-МАРКЕРОВ
АДОНИНА И.Г., ДОБРОВОЛЬСКАЯ О.Б., ДУБОВЕЦ Н.И., КРАВЦОВА Л.А., СИЛКОВА О.Г., ШУМНЫЙ В.К., ЩАПОВА А.И. — 2007 г.
Продолжено создание пшенично-ржаных замещенных линий (2n = 42) на основе скрещивания (Triticum aestivum L. ? Secale cereale L.) ? Triticum aestivum L. с использованием озимых сортов ржи Вятка и Вьетнамская местная. В BC1F5 выделены две линии, в кариотипе которых вместо пары гомологичных хромосом пшеницы присутствует гомеологичная ей пара хромосом ржи. Хромосомный состав линий проанализирован методами GISH, C-бэндинга и SSR-анализа. Комплексный анализ позволил выявить по одной паре хромосом ржи при отсутствии пшенично-ржаных транслокаций, а также идентифицировать хромосомы ржи и определить, по каким хромосомам пшеницы произошло замещение. Линии, полученные от скрещивания с рожью сорта Вятка и рожью Вьетнамская местная, были идентифицированы как 1Rv(1A), 5Rviet(5A) соответственно. Проведенная хромосомная паспортизация линий позволяет использовать их в селекционных программах и генетических исследованиях.
-
ПОПУЛЯЦИОННАЯ СТРУКТУРА СЕЛЬСКИХ НАСЕЛЕННЫХ ПУНКТОВ РЕСПУБЛИКИ САХА (ЯКУТИЯ): МИГРАЦИОННЫЕ ПРОЦЕССЫ
ДАНИЛОВА А.Л., КОНЕВА Л.А., КУЧЕР А.Н., НОГОВИЦИНА А.Н. — 2007 г.
Приведены результаты анализа миграционных процессов и гаметной структуры сельских популяций Республики Саха (Якутия). Установлено, что обследованные популяции различаются по интенсивности и направленности миграций, которые определяются социально-экономическим развитием регионов и этническим составом населенных пунктов. Высокий уровень дальних миграций при низком уровне внутриулусных характерен для территорий с промышленно-транспортным развитием и в большей степени для пришлого (некоренного) населения, тогда как в сельскохозяйственных регионах большее значение имеют внутриулусные миграции. Гаметная структура младшей возрастной группы не всегда согласуется с миграционной активностью предыдущих поколений, а результативность миграций (согласованность миграционных потоков с гаметной структурой в зависимости от мест происхождения гамет) различна для мужчин и женщин.
-
ПОПУЛЯЦИОННАЯ СТРУКТУРА СЕЛЬСКИХ НАСЕЛЕННЫХ ПУНКТОВ РЕСПУБЛИКИ САХА (ЯКУТИЯ): ФАМИЛЬНАЯ СТРУКТУРА
ДАНИЛОВА А.Л., КОНЕВА Л.А., КУЧЕР А.Н., НОГОВИЦИНА А.Н. — 2007 г.
Приведены данные о распространенности фамилий в 12 сельских этно-территориальных группах Республики Саха (Якутия). Обследованные популяции характеризуются высоким накоплением отдельных фамилий, при этом у представителей разных национальностей, проживающих на одной территории, спектр фамилий существенно перекрывается. Установлены территориальные и этнические различия в величинах случайной изонимии, индекса миграции, разнообразия фамилий и показателя избыточности распределения фамилий. Величины коэффициента родства по изонимии, рассчитанные для отдельных этнических групп (якуты, эвены, русские) и суммарно для представителей всех национальностей, проживающих в обследованных населенных пунктах, определялись географической удаленностью сравниваемых популяций и интенсивностью миграционных процессов.