научный журнал по биологии Молекулярная биология ISSN: 0026-8984

ASOKAN R., KRISHNA KUMAR N.K., MANAMOHAN M., SHARATH CHANDRA G., SITA T. — 2014 г.

Обратная транскрипция и последующая количественная ПЦР в реальном времени (RT-qPCR) – чувствительный метод, который в настоящее время широко используется для количественной оценки экспрессии генов. Однако метод требует нормализации результатов с подходящим референсным геном (RG), что имеет важнейшее значение для минимизации различий, связанных с приготовлением образцов. Информации о подходящих RG не хватает и в целом, и тем более относительно насекомых, в том числе и для хлопковой совки Helicoverpa armigera – экономически значимого вредителя. Как потенциальный инструмент для контроля над этим вредителем рассматривается технология РНК-интерференции (РНКi), которая основана на доставке двухцепочечной РНК (дцРНК) в клетки и на точной количественной оценке умолкания (сайленсинга) соответствующих генов. В данном исследовании мы оценили пригодность пяти потенциальных RG, а именно: -актина (ACTB), 18S рРНК (18S), глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (GAPDH), -тубулина (TUB) и фактора элонгации-1 альфа (EF1- ) – для изучения генной экспрессии у H. armigera при действии дцРНК и на различных этапах развития организма и составили их ранжированные списки с помощью программного обеспечения geNorm, NormFinder и BestKeeper. Выявлено, что в экспериментах по РНКi лучше использовать одни RG, а при исследовании стадий развития другие – в первом случае наиболее стабильно экспрессируются гены 18S и GAPDH, в то время как во втором TUB и GAPDH. Нами показано, что выбор неподходящего RG приводит к ошибочной оценке экспрессии целевого гена – в данном случае химотрипсина. Полученные результаты позволят проводить точную оценку экспрессии генов H. armigera.

ВАСИЛЕНКО М.А., ЗАТОЛОКИН П.А., КИРИЕНКОВА Е.В., ЛИТВИНОВА Л.С., МАЗУНИН И.О., МОЖЕЙ О.И. — 2014 г.

Метаболический синдром – комплекс метаболических, гормональных и клинических нарушений. Дефекты функционирования митохондрий играют немаловажную роль в патогенезе метаболического синдрома. В ходе настоящего исследования продемонстрировано изменение количества копий митохондриальной ДНК (мтДНК) в образцах жировой ткани разной локализации и лейкоцитах периферической крови у пациентов с метаболическим синдромом, ранжированных по индексу массы тела. Выявлена тенденция к истощению мтДНК при увеличении индекса массы тела.

НОВОСЕЛОВ В.И., РАВИН В.К., ШАРАПОВ М.Г. — 2014 г.

Пероксиредоксины – широко представленная в живом мире, эволюционно древняя группа селеннезависимых пероксидаз. Пероксиредоксины защищают клетки от различных пероксидов и играют важную роль в поддержании окислительно-восстановительного гомеостаза, кроме того они участвуют в передаче внутриклеточных и межклеточных сигналов. В данном обзоре рассмотрены пероксиредоксины из различных царств живых организмов, представлены последние данные по регуляции экспрессии генов пероксиредоксинов, а также структуре и функции этих ферментов.

CHEN Z.-Y., GU X.-D., SHI L.-B., SONG N., WANG Y. — 2014 г.

В нескольких видах опухолей замечено нарушение регуляции экспрессии белков, вовлеченных в сигнальный путь SUMO. Важную роль в этом процессе играет субъединица 1 фермента-активатора SUMO (SUMO-activating enzyme subunit 1 – SAE1). Нами обнаружено, что в клеточной линии рака толстой кишки RKO происходит интенсивная экспрессия SAE1. Для подавления экспрессии SAE1 клетки RKO трансдуцировали лентивирусным вектором, содержащим siRNA к SAE1. РНК-интерференция эффективно и специфично подавляла экспрессию гена-мишени SAE1 в RKO как на уровне мРНК, так и на уровне белка. Сайленсинг SAE1 приводил к ингибированию клеточной пролиферации и уменьшению числа колоний RKO. Кроме того, как показано методом проточной цитометрии, специфический нокдаун SAE1 замедлял клеточный цикл на фазе G0/G1 и индуцировал апоптоз клеток RKO. На основании полученных результатов можно предположить, что SAE1 играет важную роль в развитии опухоли при раке толстой кишки, и рассматривать этот белок как потенциальную мишень при лечении этого заболевания.

КОМАРОВА Е.Ф., ПОГОРЕЛОВА Ю.А., ПОЗДНЯКОВА В.В., РОЗЕНКО Л.Я., ФРАНЦИЯНЦ Е.М., ХОХЛОВА О.В., ЧЕРЯРИНА Н.Д. — 2014 г.

Полагают, что меланома кожи возникает в результате малигнизации врожденного или приобретенного пигментного невуса под воздействием внешних факторов. В образцах ткани меланомы кожи больных обоего пола и ткани пигментных невусов проведен сравнительный анализ методом ИФА активности плазмина, плазминогена, содержания и активности активатора плазминогена урокиназного типа, активатора плазминогена тканевого типа, ингибитора активатора плазминогена, уровня ростовых факторов – васкулоэндотелиального и его рецептора, эпидермального и его рецептора, трансформирующего фактора роста фибробластов, инсулиноподобного фактора 1 и 2. Выявленные изменения указывают на возможные механизмы злокачественной трансформации невусов кожи. Эти результаты могут оказаться полезными при разработке методов оценки степени риска неопластического перерождения невусов и методов профилактики.

БУТОВСКАЯ М.Л., ВАСИЛЬЕВ В.А., ДРОНОВА Д.А., КУЛИКОВ А.М., ЛАЗЕБНЫЙ О.Е., РЫСКОВ А.П., СУХОДОЛЬСКАЯ Е.М., ШИБАЛЕВ Д.В., ЩЕРБАКОВА О.И. — 2014 г.

Проведен анализ VNTR-полиморфизма и изучена структура 3-некодирующей области гена переносчика дофамина (DAT1/SLC6A3) у мужчин африканских популяций хадза и датога. Выявлены различия в распределении частот аллелей и генотипов этого гена в популяциях хадза и датога. У хадза чаще встречается аллель с 9 повторами в 3-некодирующей области и гомозиготный генотип 9/9 DAT1. У датога более распространен аллель DAT1 с 10 повторами и гомозиготный генотип 10/10 DAT1. Впервые определена структура аллельных вариантов DAT1 с 3, 8 и 12 повторами. Обнаружено, что по расположению и типу повторов аллельный вариант с 11 повторами у датога значительно отличался от описанного ранее у представителей других популяций. Мы предполагаем, что вариации в числе и типах повторов в 3-некодирующей области могут влиять на функционирование гена DAT1.

EJTEHADI F., GHORBANI M.J., SABET E.E., SALEHI Z. — 2014 г.

Язвенная болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки ( , PUD) – распространенное заболевание, поражающее значительное число людей во всем мире, и на его возникновение могут влиять условия окружающей среды и генетические факторы. Белки теплового шока ( , HSP) главным образом функционируют как молекулярные шапероны и индуцируются во время стрессовых воздействий. Как показано, замена A на G в позиции 1267 гена HSPA1B коррелирует с уровнем экспрессии мРНК HSPA. В данной работе оценивали взаимосвязь между полиморфизмом A1267G в гене HSPA1B и риском заболевания PUD в популяции жителей Ирана. В исследовании принимали участие 100 субъектов, прошедших гастроскопию. Образцы ДНК, экстрагированные из биоптатов, генотипировали, используя ПЦР с оценкой полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (PCR-RFLP). В результате гастроскопии PUD диагностировано у 50 пациентов, среди которых распределение генотипов AA, AB и BB соответствовало 10, 88 и 2%. У других 50 пациентов (без PUD), составивших контрольную группу, распределение по генотипам AA/AB/BB составляло 40/52/8%. Значимая ассоциация выявлена между генотипом HSPA1B и PUD (6.76 OR; 95% CI, 2.26–20.2; p = 0.0006). Таким образом, полиморфизм A1267G гена HSPA1B может быть маркером чувствительности к PUD.

АЛФИМОВА М.В., ГОЛИМБЕТ В.Е., КОРОВАЙЦЕВА Г.И., ЛЕЖЕЙКО Т.В. — 2014 г.

Ген нейротрофического фактора головного мозга (BDNF) считается одним из основных генов-кандидатов, связанных с развитием шизофрении. При поиске ассоциации гена BDNF с заболеванием обычно используют полиморфизм Val66Met. Однако появляется все больше сведений, что этот полиморфизм связан не только с заболеванием, но и с его клиническими особенностями. Мы сравнили распределение аллелей и генотипов гена BDNF среди больных (n = 1785) и в контрольной группе (n = 1092) и не обнаружили ассоциации полиморфизма Val66Met с шизофренией. Не выявлено связи этого полиморфизма с аффективным синдромом в клинической картине заболевания. В то же время генотип ValVal связан с более высоким уровнем тревожности, оцениваемой с помощью клинической шкалы (шкала PANSS), у мужчин. Проведено психометрическое исследование с использованием личностных опросников EPI, MMPI, STAI (n = 363), а также нейрокогнитивные тесты на концентрацию внимания (n = 227) и вербальную беглость (n = 392). Носители генотипа ValVal отличались более высоким уровнем тревоги, оцениваемой MMPI, и лучшим выполнением когнитивных тестов. Обнаружен взаимный эффект личностной тревожности, оцениваемой по STAI, и генотипа на когнитивные функции. В группе с высоким уровнем тревожности эффективность выполнения когнитивных тестов не зависела от генотипа, а в группе с низким уровнем тревожности у носителей варианта ValVal число правильных ответов было значимо выше по сравнению с носителями варианта Met. Этот эффект следует учитывать при изучении ассоциации полиморфизма Val66Met с когнитивными функциями у больных шизофренией.

ГАРЕЕВА А.Э., ХУСНУТДИНОВА Э.К. — 2014 г.

Шизофрения, тяжелейшее психическое заболевание, поражает около 1% населения мира и приводит к инвалидизации и социальной дезадаптации человека. Одна из основных гипотез нейробиологического механизма этой болезни предполагает нарушение глутаматергической нейротрансмиссии. В исследованиях больных шизофренией post mortem обнаруживаются изменения в степени аффинности глутаматных рецепторов, в транскрипции их генов, а также изменения в экспрессии их субъединиц в префронтальной коре, гиппокампе и таламусе мозга. Исследования ассоциации генов, кодирующих ионотропные каинатные рецепторы и AMPA-рецепторы глутамата, с шизофренией не дали однозначных результатов. Мы изучали ассоциацию полиморфных вариантов генов GRIA2 и GRIK2 с параноидной шизофренией до и после терапии галоперидолом на примере русских и татар из Республики Башкортостан (257 больных и 349 здоровых). Выявлены следующие генетические маркеры повышенного риска развития параноидной шизофрении у татар – GRIK2*ATG (OR = 3.5), GRIK2*TGG (OR = 3.12), у русских – GRIA2*CCC (OR = 9.60); маркеры пониженного риска у татар – генотип GRIA2*T/T (rs43025506) гена GRIA2 (OR = 0.34), у русских – GRIA2*CCT (OR = 0.481). Генетическими маркерами низкой эффективности терапии параноидной шизофрении галоперидолом при негативной (NEGAT, притупленный аффект, алогия, ангедония) и позитивной (POSIT, бред галлюцинации, расстройство мышления) формах являются генотипы GRIK2*T/T (rs2 227281) гена GRIK2 и GRIA2*С/С у русских, GRIK2*A/A (rs995640) гена GRIK2 у татар. Генетические маркеры низкой эффективности терапии галоперидолом при позитивной симптоматике – GRIA2*С/С у русских; у татар данных маркеров не обнаружено. Подтверждается гипотеза о том, что гены рецепторов глутамата вовлечены в этиопатогенез шизофрении. Отмечены межэтнические различия в специфичности генетических факторов риска развития данного заболевания.

BADER M., АЛЕНИНА Н.В., БАРАНОВА Т.В., БЕЛОЦЕРКОВСКАЯ Е.В., ДЕНИСЕНКО А.Д., ЛАРИОНОВА Е.Е., МУСТАФИНА О.Е., ПАВЛИНОВА Л.И., ПАТКИН Е.Л., САСИНА Л.К., СОЛОВЬЕВ К.В., СУЧКОВА И.О., ХУСНУТДИНОВА Э.К. — 2014 г.

Рецептор В2 брадикинина принимает участие во многих процессах, включая регуляцию артериального давления и сокращения гладких мышц, вазодилатацию, воспаление, отек, клеточную пролиферацию и формирование болевых ощущений. Особое внимание уделяется этому рецептору как одному из факторов, обладающих кардиопротективным и инфарктлимитирующим эффектом. Предполагается, что определенные генетические варианты как в кодирующих, так и в некодирующих районах гена рецептора B2 брадикинина (BDKRB2), могут участвовать в модуляции его экспрессии. В 3-нетранслируемом районе экзона 3 гена BDKRB2 находится минисателлитный повтор (B2-VNTR), который может влиять на стабильность мРНК. В связи с этим важным представляется поиск возможных ассоциаций определенных аллелей минисателлита B2-VNTR с различными формами ишемической болезни сердца. В данной работе проведен сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов B2-VNTR у здоровых индивидов и больных ишемической болезнью сердца (клинические формы: стенокардия и инфаркт миокарда), русских по этнической принадлежности. Результаты анализа полиморфизма длины B2-VNTR указывают на то, что этот тандемный повтор может быть отнесен к классу низкополиморфных негипервариабельных минисателлитов. Во всех выборках обнаружены три аллеля B2-VNTR, состоящие из 43, 38 и 33 повторов. Преобладающими были аллели из 43 и 33 повторов. Не выявлено статистически значимых различий в частоте аллелей и генотипов B2-VNTR между мужчинами и женщинами в контрольной выборке, а также между здоровыми мужчинами и мужчинами со стенокардией и инфарктом миокарда. Таким образом, не обнаружено связи между полиморфизмом длины аллелей B2-VNTR и двумя клиническими формами ишемической болезни сердца у мужчин. Однако мы не исключаем возможности существования ассоциации между носительством коротких аллелей (38 и 33 повтора) B2-VNTR и кардиопротективными эффектами рецептора В2 брадикинина у женщин с ишемической болезнью сердца. Данное предположение требует дальнейшего изучения.

БАШИНСКАЯ В.В., БОЙКО А.Н., КУЛАКОВА О.Г., ФАВОРОВ А.В., ФАВОРОВА O.O. — 2014 г.

Полногеномный поиск ассоциаций (genome-wide association study, или GWAS) является мощным инструментом исследования генетической архитектуры полигенных заболеваний человека, который применяется для выявления генетических факторов, связанных с риском развития, клиническими фенотипами и эффективностью лечения этих заболеваний. Этот метод основан на определении частот однонуклеотидных полиморфных вариантов (single nucleotide polymorphism, SNP), распределенных по всему геному, с использованием микрочипов или других технологий, которые позволяют одновременно генотипировать от нескольких десятков тысяч до нескольких миллионов SNP в одном образце. Возможность обнаружения SNP с высокозначимыми различиями в частотах между сравниваемыми группами больных и индивидов контрольной группы сделала GWAS методом, широко используемым для изучения генетической предрасположенности к комплексным заболеваниям, формирующимся на полигенной основе. На примере рассеянного склероза (РС), который может служить прототипом всех комплексных заболеваний, мы рассматриваем основные достижения и проблемы, связанные с применением GWAS для выявления генов, вовлеченных в развитие РС, расширения на этой основе представлений о молекулярных механизмах, участвующих в патогенезе, и идентификации генетических факторов риска.

АНТОНЕЦ К.С., ГАЛКИН А.П., КОНДРАШКИНА А.М., НИЖНИКОВ А.А. — 2014 г.

Ранее мы выявили и охарактеризовали нехромосомный детерминант [NSI+] дрожжей Saccharomyces cerevisiae, обладающий свойствами приона. Этот детерминант вызывает снижение эффективности терминации трансляции, которое фенотипически детектируется как нонсенс-супрессия в штаммах со сниженной функциональной активностью фактора терминации eRF3. В результате геномного скрининга установлено, что увеличение экспрессии гена SUP45, кодирующего белок Sup45 (фактор терминации трансляции eRF1), маскирует, но не элиминирует нонсенс-супрессию в штаммах [NSI+]. В представленной работе впервые показано, за счет чего возникает нонсенс-супрессия в штаммах [NSI+]. Установлено, что в присутствии фактора [NSI+] снижается относительное количество мРНК SUP45, что влечет за собой уменьшение количества белка Sup45 в стационарной фазе роста. Полученные данные свидетельствуют в пользу того, что структурный белок нехромосомного детерминанта [NSI+], по-видимому, является фактором транскрипции или же прямо или опосредованно участвует в регуляции стабильности мРНК в клетке.

АРТЕМОВ А.А., ГАВРИЛОВ А.А., ГУЩАНСКАЯ Е.С., ЛОГАЧЕВА М.Д., ПЕНИН А.А., РАЗИН С.В., УЛЬЯНОВ С.В. — 2014 г.

Пространственная организация эукариотического генома тесно связана с его функционированием. В частности, взаимодействие промоторов генов с удаленными энхансерными элементами в составе активаторных хроматиновых блоков, а также привлечение генов к общим транскрипционным фабрикам играет важную роль в активации транскрипции генов. Большинство работ, посвященных анализу пространственного взаимодействия регуляторных элементов генома, выполнено на моделях ткане-специфичных генов. Между тем остается не ясным, какой вклад в пространственную организацию хромосом вносят гены домашнего хозяйства, которые транскрибируются в большинстве клеточных типов и числом заметно превосходят число транскрибирующихся тканеспецифичных генов. С целью ответить на этот вопрос мы провели полногеномный анализ пространственных взаимодействий генов домашнего хозяйства курицы CARHSP1 и TRAP1, расположенных на хромосоме 14, используя для этого технологию 4С. Установлено, что для промоторов этих генов повышена частота ассоциации с транскрипционно активными областями хромосом и с участками, обогащенными сайтами связывания общего транскрипционного фактора Sp1 и CpG-островками, которые маркируют промоторы генов домашнего хозяйства. В то же время, при анализе взаимодействий участка хромосомы 14 из обедненной генами области не обнаружено подобных преференций. Указания на ассоциацию промоторов генов домашнего хозяйства получены и в независимых цитологических экспериментах по визуализации неметилированных CpG-островков в индивидуальных ядрах клеток человека. В них выявлена кластеризация CpG-островков в ядерном пространстве. В результате проведенных исследований получены доказательства того, что взаимодействие промоторов генов домашнего хозяйства – важный фактор, определяющий пространственную организацию интерфазных хромосом.

ГАВРИЛОВ А.А., ГУЩАНСКАЯ Е.С., РАЗИН С.В. — 2014 г.

Многочисленные исследования посвящены изучению пространственной организации генома, поскольку очевидно, что она тесно связана с его функционированием. В работах, наряду с классическими цитологическими методами, используют биохимические методы (условные названия – 3С, 4С, 5С, Hi-C), с помощью которых удается детектировать взаимодействия между отдаленными регионами хроматиновой фибриллы, в том числе в масштабе всего генома. В настоящем обзоре мы рассматриваем результаты этих исследований, которые позволяют объяснить функциональную основу многоуровневой компартментализации ядра и выявить некоторые закономерности образования высших уровней компактизации хроматина. Рассматривается вопрос об энхансер-промоторных взаимодействиях, участвующих в регуляции экспрессии генов. В этой связи дана новая интерпретация модели активаторного хроматинового блока и альтернативной модели активного хроматинового компартмента, которая предложена при пересмотре некоторых этапов метода 3С.

ДЕРГУНОВА Л.В., ЗБОРОВСКАЯ И.Б., ЗИНОВЬЕВА М.В., ЛИМБОРСКАЯ С.А., РОЖКОВА А.В., САСС А.В. — 2014 г.

В последние годы большое внимание уделяется изучению особенностей экспрессии генов в раковых клетках. К числу таких генов относится ген сфингомиелинсинтазы 1 (SGMS1). Сфингомиелинсинтаза 1 (SMS1) катализирует синтез сфингомиелина и диацилглицерина из фосфатидилхолина и церамида. Регулируя уровень проапоптотического медиатора церамида и антиапоптотического медиатора диацилглицерина, SMS1 может поддерживать баланс между процессами клеточной гибели и пролиферации. Кроме того, показано, что содержание сфингомиелина и уровень сфингомиелинсинтазной активности в опухолях многих тканей изменяются. Однако до сих пор практически не изучены особенности функционирования гена SGMS1 на уровне транскрипции. В данной работе исследовали экспрессию гена SGMS1 в опухолях легкого и пищевода человека по сравнению с прилежащей здоровой (неизмененной) тканью с использованием метода ПЦР в реальном времени. В ткани рака легкого уровень экспрессии гена SGMS1 снижается. В опухоли и прилежащей ткани пищевода уровни экспрессии гена SGMS1 статистически не отличаются: в семи из 15 образцов уровень повышается, в пяти – снижается. Таким образом, в опухолях разного происхождения характер экспрессии гена SGMS1 различен.

MOHD-AZMI MOHD LILA, SHEIKH-OMAR ABDUL RAHMAN, TAN SEOK SHIN, ZEENATHUL NAZARIAH ALLAUDIN — 2014 г.

Рекомбинантный аденовирус, содержащий ген VP2 вируса инфекционной болезни бурсы (ADV-VP2), обладает мощным противоопухолевым действием, обусловленным способностью индуцировать апоптоз в раковых клетках. В представленной работе клетки MCF-7 и MDA-MB-231 рака молочной железы человека инфицировали ADV-VP2. Через 4 ч после инфицирования в клетках MCF-7 наблюдали появление белка VP2. Анализ фрагментации ДНК в разные временные точки показал, что клетки MCF-7 и MDA-MB-231 вступали в апоптоз уже через 8 и 12 ч после заражения соответственно. В клетках MCF-7 и MDA-MB-231 апоптоз индуцировался через разные промежутки времени после инфицирования, но продолжался в течение 36 ч. Индукция апоптоза под действием ADV-VP2 подтверждена методом TUNEL с темно-коричневым окрашиванием апоптотических клеток. С использованием количественной проточной цитометрии с двойным окрашиванием клеток аннексином V/P1 анализировали различные стадии апоптоза. Обработанные ADV-VP2 культуры MCF-7 и MDA-MB-231 содержали 25.58 ± 9.02 и 14.51 ± 3.12% клеток на ранних и 6.09 ± 4.06 и 77.12 ± 5.09% на поздних стадиях апоптоза соответственно. Выявлены существенные различия в числе клеток двух типов, находящихся на ранних и поздних стадиях апоптоза, а также в числе живых и апоптотических клеток, обработанных ADV-VP2. Действие ADV-VP2 на линии клеток рака молочной железы человека показано тремя методами. По-видимому, с использованием ADV-VP2 можно будет получить вакцину, предназначенную для генотерапии рака.

CAI X.-J., TANG J.-C., XIE A.-Y. — 2014 г.

Изменение характера взаимодействий между внеклеточным матриксом и клеткой играет важную роль в онкогенезе и метастазировании опухолей. Матрицеллюлярный гликопротеин фибулин-5 экспрессируется в богатых эластином тканях и организует структуры матрикса, взаимодействуя со многими внеклеточными белками. Экспрессия фибулина-5 тесно ассоциирована с эмбриональным развитием и органогенезом. Дефицит фибулина-5 приводит к развитию системных дефектов эластиновых волокон у мышей, что проявляется дряблостью кожи, эмфизематозными поражениями легких и извитостью сосудов. У мышей с нуль-мутацией гена фибулина-5 наблюдается усиление ангиогенеза при заживлении ран или имплантации поливинилацетатных губок и матригеля. Это указывает на способность фибулина-5 подавлять образование сосудов, т.е. он действует как ингибитор ангиогенеза. Фибулин-5 играет также критическую роль в пролиферации, миграции и инвазии опухолевых клеток определенного типа. Влияние фибулина-5 на образование опухолей, по-видимому, в сильной степени зависит от контекста, что может быть связано с его способностью ингибировать ангиогенез. В представленном обзоре обсуждаются последние достижения в понимании роли фибулина-5 в онкогенезе. Рассмотрена способность фибулина-5 промотировать и супрессировать развитие опухолей, а также перспективы использования фибулина-5 в качестве лекарственного средства и/или мишени для терапии рака.

ГЕЛЬФАНД М.С., СТЕПАНОВА В.В. — 2014 г.

Рассмотрены и обобщены известные типы редактирования РНК. Приведены примеры исследования редактирования с использованием различных типов экспериментальных данных. Описаны типичные ошибки предсказания сайтов РНК-редактирования и процедуры, позволяющие избежать перепредсказания. Обсуждены возможные перспективы новых технологий и направления исследований РНК-редактирования.

АЛИФИРОВА В.М., БОЧАРОВА А.В., ЖУКОВА И.А., ЖУКОВА Н.Г., МАРУСИН А.В., СТЕПАНОВ В.А. — 2014 г.

В работе проведен репликативный анализ ассоциаций с болезнью Альцгеймера (БА) 15 генетических маркеров, связанных по результатам полногеномных исследований с когнитивными нарушениями. В российской популяции выявлена ассоциация БА с rs2616984 гена CSMD1 (OR = 1.50, 95% CI = 1.07–2.09, p-value = 0.018) и возможные взаимосвязи с заболеванием rs3131296 гена NOTCH4 (OR = 1.53, 95% CI = 0.98–2.39, p-value = 0.06) и rs2229741 гена NRIP1 (OR = 1.35, CI = 0.99–1.85, p-value = 0.061). Обнаружены комбинации эпистатически взаимодействующих генов (CSMD1 и NRIP1; NOTCH4, CSMD1 и NRIP1; TLR4, CSMD1 и NRIP1) и сочетания их генотипов, значимо ассоциированные с БА и характеризующиеся наибольшей прогностической значимостью. Обсуждаются возможные молекулярные механизмы вовлечения изученных генов в патогенез заболевания. Биоинформационный анализ биологических процессов, молекулярных функций и белок-белковых взаимодействий генов БА показывает, что исследованные гены могут играть модулирующую или модифицирующую роль, соучаствуя в различных регуляторных и сигнальных путях, задействованных в процессах развития заболевания.

ИЛЬИНСКАЯ О.Н., ШАХ МАХМУД Р. — 2014 г.

Многие рибонуклеазы (РНКазы) способны подавлять репродукцию РНК-содержащих вирусов в культурах инфицированных клеток и лабораторных животных, однако молекулярные механизмы противовирусного действия РНКаз изучены недостаточно. В представленном обзоре рассмотрены наиболее изученные внутриклеточные РНКазы, обладающие противовирусной активностью (РНКаза L, белок MCPIP1, РНКазы эозинофилов), а также РНКазы, применяемые экзогенно (РНКаза А, BS-РНКаза, онконаза, биназа, синтетические РНКазы). Особое внимание уделено двум важным, хотя и не всегда обязательным свойствам этих РНКаз: каталитической активности и способности к димеризации. Предложена схема элиминации вируса экзогенными РНКазами, отражающая возможные типы взаимодействия РНКаз с вирусом и клеткой. Приведены доказательства того, что РНКазы, как классические компоненты иммунной защиты, представляют значительный интерес для разработки новых противовирусных препаратов.