научный журнал по биологии Молекулярная биология ISSN: 0026-8984

ВОЛКОВ Ε.М., КУЗНЕЦОВА С.А., САПАРБАЕВ М.К., ТАРАНЕНКО М.В. — 2004 г.

8-Оксогуанин-ДНК-гликозилазы играют ключевую роль в репарации окислительных повреждений ДНК. Ферменты эксцизионной репарации формамидопиримидин-ДНК-гликозилаза Escherichia coli (Fpg) и 8-оксогуанин-ДНК-гликозилаза человека (hOGGl) катализируют удаление остатков 7,8-ди-гидро-8-оксогуанина (oxoG) из ДНК и последующее расщепление углеводофосфатного остова. Контакты между фосфатными группами ДНК и аминокислотами из активных центров этих ферментов играют важную роль в специфическом связывании и катализе. С целью создания негидролизуемых аналогов субстратов Fpg и hOGGl изучено влияние модификации фосфатных групп, связанных с поврежденным нуклеозидом, на субстратную специфичность модифицированных ДНК-дуплексов. Новые oxoG-содержащие аналоги субстратов Fpg и hOGGl сконструированы на основе синтетических ДНК-дуплексов, содержащих пирофосфатную либо замещенную пирофосфатную группу, связанную с 5'(3')-ОН-группами 8-оксогуанозина. Показано, что эти соединения узнаются и специфически связываются исследуемыми ферментами. При изучении механизма их взаимодействия с Fpg и hOGGl установлено, что модификация межнуклеотидного фосфата, связанного с 3'-ОН группой 8-оксогуанозина, препятствует выщеплению остатка oxoG из поврежденной цепи ДНК. Вместе с тем показано, что оба фермента эффективно расщепляют ДНК-дуплексы с аналогичной модификацией фосфата, связанного с 5'-ОН-группой oxoG. ДНК-дуплексы, содержащие пирофос-фатную/замещенную пирофосфатную группу на 3'-ОН 8-оксогуанозина, являются негидролизуемыми аналогами субстратов исследуемых 8-оксогуанин-ДНК-гликозилаз и могут быть использованы для проведения структурных исследований комплексов oxoG-содержащих ДНК с каталитически активными формами этих ферментов и их про- и эукариотических гомологов.

АКУЛЕНКО Н.В., ИВАШИНА Т.В., КСЕНЗЕНКО В.Н., ШАЛОЙКО Л.А., ШЛЯПНИКОВ М.Г. — 2004 г.

Обнаружены новые сайт-специфические эндонуклеазы F-TflI, F-TflII и F-TflIV, относящиеся к семейству H-N-H. Они кодируются открытыми рамками считывания, расположенными в области генов тРНК бактериофага Т5. Показано, что эндонуклеаза F-TflIV вносит двухцепочечный разрыв в псевдопалиндромную последовательность ДНК длиной в 17 п.н., образуя 3'-выступающие концы из одного нуклеотида. В отличие от F-TflIV, эндонуклеазы F-TflI и F-TflII вносят одноцепочечные разрывы в несимметричные сильновырожденные последовательности ДНК, причем каждая из них -только в одну цепь (матричную или кодирующую). Анализ аминокислотных последовательностей исследуемых эндонуклеаз показал, что они обладают высокой гомологией в области H-N-H-мотива и С-концевой последовательности, формирующих предполагаемый каталитический домен. N-ko-нец эндонуклеазы F-TflIV гомологичен последовательности, образующей НТН-домен LuxR-семейства транскрипционных регуляторов, который отвечает за связывание и узнавание ДНК. В N-концевой последовательности эндонуклеаз F-TflI и F-TflII выявлен составной мотив NUMOD4, обнаруживаемый также в предполагаемых узнающих доменах определенной группы H-N-H-эндонуклеаз. Высказано предположение о двухдоменной структуре эндонуклеаз F-TflI, F-TflII и F-TflIV - с N-концевым узнающим и С-концевым каталитическим доменами, а также об их эволюционном происхождении путем рекомбинации каталитического и узнающих доменов.

МИРОНОВ А.С. — 2004 г.

ВИКТОРОВА Л.С., СОСУНОВ В.В. — 2004 г.

Настоящий обзор посвящен двум недавно обнаруженным реакциям: 1) реакции выщепления З'-концевого нуклеотида растущей цепи ДНК в присутствии относительно высоких концентраций некомплементарных r/dNTP либо r/dNDP, катализируемой различными ДНК-полимеразами (реакция псевдопирофосфоролиза); 2) реакции выщепления З'-концевого нуклеотида РНК-транскрипта РНК-полимеразами, стимулируемой некомплементарными r/dNTP. Механизм реакций для ДНК- и РНК-полимераз различен. В случае ДНК-полимераз в присутствии некомплементарных нуклеозид-трифосфатов З'-концевой нуклеотид ДНК выщепляется в виде динуклеозид-5',5"-тетрафосфата, тогда как в случае РНК-полимераз некомплементарные нуклеозидтрифосфаты стимулируют 3'→5'-экзонуклеазное расщепление РНК. В обзоре представлен материал, касающийся возможного участия реакции псевдопирофосфоролиза, катализируемой обратной транскриптазой (OT) вируса иммунодефицита человека (ВИЧ), в механизме резистентности ВИЧ к нуклеозидным ингибиторам OT, в частности, к азидотимидину. Обсуждаются также другие механизмы устойчивости ОТ к нуклеозидным ингибиторам.

ВОРОНОВ А.С., КУПРИЯНОВА Н.С., РЫСКОВ А.П., ФИРСОВ С.Ю., ШИБАЛЕВ Д.В. — 2004 г.

Индивидуальная и внутривидовая гомогенность повторяющихся единиц рДНК, как принято считать, поддерживается с помощью согласованной эволюции, обеспечиваемой механизмами неравного кроссинговера и генной конверсии. Однако эти механизмы могут приводить к прямо противоположным результатам - к коррекции или элиминированию новых вариантов генов, или к распространению новых вариантов по индивидуальным кластерам гомологичных и негомологичных хромосом. Нами клонированы и частично секвенированы 36 копий участка межгенного рибосомного спейсера человека с координатами 22763-23523, считая от стартовой точки транскрипции, полученных путем ПЦР-амплификации из генома одного индивида. Этот участок, обогащенный поли (G) и (AG) n-кластерами, входит в состав элемента LR2 длиной 2 т.п.н. межгенного рибосомного спейсера. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей показал, что среди 36 рекомбинантных вставок нет ни одной идентичной пары, а 26 клонов отличаются лишь по числу повторяющихся элементов в паралогичных (G) n и (AG) n-кластерах. Остальные 10 клонов отличались не только числом повторяющихся элементов в кластерах, но и содержали инсерции или делеции разной длины, которые не соответствуют ранее охарактеризованным полиморфным вариантам межгенного рибосомного спейсера человека.

БРОК-ВОЛЧАНСКИЙ А.С., ДЕЕВ А.А., ЛУКЬЯНОВ В.И., ОЗОЛИНЬ О.Н., ПУРТОВ Ю.А. — 2004 г.

Идентификация ДНК-белковых и белок-белковых контактов в транскрипционных комплексах является необходимым этапом аннотации каждого промотора. Используемые с этой целью экспериментальные подходы позволяют определить принадлежность промотора к регулону одной из семи альтернативных σ-субъединиц РНК-полимеразы и зависимость его активности от известных факторов белковой и небелковой природы. Такая информация содержится и в нуклеотидной последовательности промоторной ДНК, поэтому, зная стартовую точку транскрипции, с высокой точностью можно предсказать тип промотора и способ его белковой регуляции. Значительно сложнее предсказать матричную активность промотора, которая зависит не только от специфических контактов между σ-субъединицами и соответствующими консенсусными элементами, но и от множества пока не поддающихся простому учету неспецифических факторов. В обзоре рассмотрены особенности контактов, формируемых α-субъединицами РНК-полимеразы, по-видимому, без участия функциональных групп азотистых оснований. Предпринята попытка сопоставить нуклеотидные последовательности промоторов разных типов в местах потенциального связывания α-субъединиц и обсудить возможное значение этого взаимодействия для регуляции транскрипции.

БРАГА Э.А., ЗАБАРОВСКИЙ Е.Р., КИСЕЛЕВ Л.Л. — 2004 г.

Представлены результаты нескольких исследовательских групп по следующим направлениям: 1) идентификация полиморфных локусов в геноме человека; 2) локализация и анализ генов, связанных с эпителиальными опухолями разных локализаций; 3) разработка молекулярных маркеров социально значимых онкологических заболеваний. Работы по первым двум направлениям инициированы и выполнялись в значительной мере при поддержке Российской национальной программы “Геном человека”. Для выявления новых полиморфных локусов в геноме человека проведен анализ ди-, три- и тетрануклеотидных тандемных повторов в составе космид упорядоченной клонотеки хромосомы 13, NotI-клонов и космид, локализованных на хромосоме 3, а также в составе коллекций EST мозга. Суммарно идентифицировано девять полиморфных и до 200 STS-маркеров. Маркеры в NotI-клонах хромосомы 3 связаны с генами; полиморфные локусы (NL1-024, NL2-007 и EST04896) использованы при поиске делеций в области 3р в ДНК опухолей. С помощью делеционного картирования 3р в эпителиальных опухолях пяти локализаций определено шесть критичных участков, потенциально содержащих TSG: два участка - в дистальном районе 3р и четыре участка - в области 3р21.3. Установлена значимая корреляция частоты аллельных делеций со стадией и степенью анапла-зии опухолей (P < 0.05). Согласно этим данным, гены из области 3р связаны не только с возникновением, но и с прогрессией опухолей, и могут быть использованы в качестве прогностических маркеров. Показано, что в районах LUCA и AP20 из области 3р21.3 наблюдается высокая частота (90%) аберраций, в том числе до 20% гомозиготных делеций. Пик аллельных делеций в районе D3S2409-D3S3667 (600 т.п.н.) статистически достоверен (P = 10 -3). Районы AP20 и D3S2409-D3S3667 (3р21.3) определены нами впервые. В районах LUCA, AP20 и D3S2409-D3S3667 (3р21.3) идентифицированы кластеры генов-супрессоров. Важно, что метилирование TSG 3р RASSF1A и RAR-beta2 - ранние события в канцерогенезе, а SEMA3B связано с прогрессией опухолей, что можно использовать как для ранней диагностики, так и для послеоперационного прогноза течения заболевания.

КИСЕЛЕВ Л. — 2004 г.

ВЕНЬЯМИНОВА А.Г., ГРАЙФЕР Д.М., ДЕМЕШКИНА Н.А., КАРПОВА Г.Г., РЕПКОВА М.Н. — 2004 г.

В работе изучали модификацию 18S рРНК производным pUUUGUU, несущим перфторфенилази-догруппу на атоме N7 остатка гуанина, в составе комплекса с 80S рибосомами человека и Val-тРНк, которая направляет модифицированный кодон GUU в Р-участок. С помощью метода обратной транскрипции показано, что модификации подвергается инвариантный нуклеотид G1702 18S рРНК. На основании сопоставления полученных результатов с данными по аффинной модификации рибосом человека производными тетра- и гептарибонуклеотидов с алкилирующей группой на 3'-конце сделан вывод о том, что между кодонами в А- и Р-участках 80S рибосомы матрица делает изгиб, в результате чего эти кодоны оказываются сближенными с G1702 18S рРНК.

АКИФЬЕВ Б.Н., ДИЖЕ Э.Б., ЕФРЕМОВ А.М., ЖДАНОВА О.Ю., КИДГОТКО О.В., ЛАПИКОВ И.А., МОГИЛЕНКО Д.А., ОЛЕЙНИКОВА Г.Н., ОРЛОВ С.В., ПЕРЕВОЗЧИКОВ А.П. — 2004 г.

Ген аполипопротеина A-I (apoA-I) человека в составе плазмидных векторов экспрессии переносили in vivo мышам линии C57B1/6 с помощью метода гидродинамических инъекций в хвостовую вену. Использовали плазмидные векторы экспрессии apoA-I двух видов: 1) pCMV capoAI - кДНК apoA-I под контролем промотора CMV; 2) pAlg - геномный локус, в котором интронированный ген apoA-I находится под контролем собственной протяженной 5'-регуляторной области (APOAI). Гидродинамические внутривенные инъекции плазмид обоих типов приводят к появлению в клетках печени мышей мРНК apoA-I человека, в крови животных - белка человека ApoA-I. Динамика содержания ApoA-I человека в сыворотке крови мышей, инъицированных указанными плазмидами, различна. В случае pCMV capoAI - ApoA-I человека выявляется на следующий день после инъекции в максимальном количестве, затем его содержание к концу второй недели спадает до нуля. В случае pAlg - содержание ApoA-I человека достигает максимальных значений на 5-7 сут (в отдельных случаях до концентрации 20 мкг/мл в сыворотке) и в дальнейшем медленно спадает в течение месяцев (в контролируемом случае через полгода это количество составляло 25% от максимального значения). Опыты по “спасению” pAlg, выделенной (спустя 50 сут после инъекции) из ядер клеток печени, свидетельствуют о том, что плазмида длительно сохраняется в эписомном виде. Значительный уровень ApoA-I человека в сыворотке и его длительное поддержание после инъекции мышам pAlg могут объясняться свойствами 5'-регуляторной области (APOAI) или(и) экзонно-ин-тронной структуры гена apoA-I. Поскольку инъекции мышам различных вариантов APOAI, сцепленных с геном люциферазы, не приводят к длительному сохранению активности люциферазы в печени, делается вывод, что наличие интронов в структуре гена apoA-I необходимо для эффективной и продолжительной его работы после доставки мышам методом гидродинамических инъекций.

БУРСА Т.Р., ГАЛЕЕВ И.В., ЗОТОВА Е.В., НОСИКОВ В.В., САВОСТЬЯНОВ К.В., СТРОКОВ И.А., ЧИСТЯКОВ Д.А. — 2004 г.

Проведен сравнительный анализ распределения аллелей и генотипов полиморфных маркеров генов, кодирующих ферменты антиокислительной защиты, у больных сахарным диабетом типа 1 с диабетической полинейропатией и без диабетической полинейропатии. Группы больных (всего 180 человек) формировали по принципу неперекрывающихся (“полярных”) фенотипов. В группу “ДПН+” (п = 86) вошли больные с диабетической полинейропатией и длительностью сахарного диабета типа 1 не более 5 лет. Контрольную группу “ДПН-” (n = 94) составили лица без клинического диагноза диабетическая полинейропатия, болеющие сахарным диабетом типа 1 на протяжении 10 и более лет. Сравнительный анализ с использованием точного критерия Фишера выявил достоверные различия в распределении аллелей и генотипов полиморфного маркера Т(-262)С гена САГ. Полиморфные маркеры С1167Т гена САT, Pro/Leu гена GPX1 и 0/+ генов GSTT1 и GSTM1 не показали достоверных различий в распределении аллелей и генотипов, что свидетельствует об отсутствии ассоциации между данными полиморфными маркерами и диабетической полинейропатией в изученных нами группах больных.

ЛАВРИК О.И., СУХАНОВА М.В., ХОДЫРЕВА С.Н. — 2004 г.

Поли(АОР-рибозо)полимераза 1 (PARP-1) - ядерный белок высших эукариот, специфически распознающий разрывы в ДНК. Фермент активируется при наличии таких разрывов и осуществляет синтез поли(А0Р-рибозы), ковалентно присоединенной к некоторым белкам, причем главным акцептором является сам PARP-1. Этот белок задействован в большинстве ДНК-зависимых процессов - в репликации, рекомбинации и репарации, в процессе гибели клеток (апоптозе и некрозе). Пoли(ADP-рибoзил)ирoвание белков рассматривается как механизм, обеспечивающий формирование внутриклеточного сигнала о повреждении ДНК и модулирование функций белков в ответ на генотоксические воздействия. В обзоре главное внимание уделено роли PARP-1 и пoли(ADP-рибo-зил)ирования в эксцизионной репарации оснований - основном процессе, обеспечивающем репарацию разрывов в ДНК. Рассмотрены основные из предполагаемых функций PARP-1 в этом процессе, где он может выступать как фактор, инициирующий формирование комплекса белков эксцизионной репарации оснований; как временная защита концов ДНК; как фактор модулирования структуры хроматина за счет пoли(ADP-рибoзил)ирoвания гистонов и как сигнал в механизме распознавания уровня повреждений ДНК в клетке.

АЛФИМОВА М.В., ГОЛИМБЕТ В.Е., МИТЮШИНА Н.Г. — 2004 г.

Известно, что межличностные различия по таким чертам темперамента, как тревожность, невротизм, избегание ущерба, обусловлены, в том числе, и присутствием различных аллелей генов, участвующих в обмене серотонина. Ассоциация инсерционного-делеционного полиморфизма гена переносчика серотонина с этими чертами была выявлена ранее. В настоящей работе изучена связь полиморфных аллелей гена рецептора серотонина типа 2А (5HTR2A) с личностными характеристиками, измеряемыми с помощью нескольких опросников. Обнаружена ассоциация двух полиморфных маркеров гена 5HTR2A, Т102С и A1438G, с вариабельностью некоторых особенностей аффективноличностной сферы, относящихся к интегральным характеристикам темперамента, а именно эмоциональностью, активностью и социабельностью (общительностью). Значимые различия выявлены только между гетерозиготными и гомозиготными носителями обоих полиморфных маркеров. Гетерозиготные носители аллелей А1 /А2 (Т102С) характеризовались низким уровнем черт тревожного ряда, а также высокими оценками по шкале Гипомания и низкими - по шкале Социальная интро-версия по сравнению с гомозиготными, что свидетельствует о более высокой активности и социа-бельности гетерозигот. Носители генотипа A/G (A1438G) отличались от гомозигот G/G более низким уровнем социальной интроверсии и более низкими значениями по шкале Отсутствие близких друзей, что указывает на их большую общительность. Полученные результаты позволяют предположить, что полиморфные аллели гена рецептора серотонина ассоциированы с чертами личности у психически здоровых людей.

ГОЛУБЕНКО М.В., ЕФИМОВА Е.В., КАРПОВ Р.С., КОШЕЛЬСКАЯ О.А., КУЧЕР А.Н., МАКЕЕВА О.А., ПАВЛШКОВА Е.Н., ПУЗЫРЕВ В.П., ПУЗЫРЕВ К.В., ЦИМБАЛЮК И.В. — 2004 г.

Приведены результаты изучения взаимосвязи полиморфизма A2350G в экзоне 17 гена ангиотензин-I-превращающего фермента (АСЕ) и А1166С в 3'-нетранслируемой области гена рецептора ангиотензина II первого типа (AGTR1) с гипертрофией левого желудочка (ГЛЖ) у больных с эссенциальной гипертонией (ЭГ) и артериальной гипертонией (АГ) в сочетании с сахарным диабетом 2-го типа (СД2). Больные с ЭГ и АГ в сочетании с СД2 не отличаются по частотам аллелей и генотипов изученных полиморфных вариантов от контрольной группы здоровых индивидов. Вместе с тем, обнаружена ассоциация обоих генетических маркеров с ГЛЖ при эссенциальной гипертонии: аллель 1166С гена AGTR1 достоверно чаще встречается у больных с ГЛЖ (33.6% против 20.7% у больных без ГЛЖ). Данный вариант AGTR1 определяет и величину индекса массы миокарда левого желудочка (ИММЛЖ) у пациентов с ЭГ (р = 0.007). Аллель 2350G гена АСЕ встречается в 1.5 раза, а генотип GG - в 3.5 раза чаще в подвыборке больных с ГЛЖ при ЭГ, чем без ГЛЖ; ИММЛЖ статистически значимо (р = 0.002) отличается у носителей разных генотипов - от максимального у пациентов с генотипом GG до минимального у гомозигот АА. Таким образом, наличие аллелей 1166С гена AGTR1 и 2350G гена АСЕ может рассматриваться как предрасполагающий фактор для развития ГЛЖ при эссенциальной гипертонии. У больных, имеющих сочетание АГ с СД2, не выявлено достоверно значимых ассоциаций исследованных полиморфных вариантов с наличием и степенью развития ГЛЖ. Это может указывать на существование иной структуры генетической компоненты, определяющей подверженность к развитию ГЛЖ при различных причинах, ее вызывающих.

МАРУСИН А.В., ПУЗЫРЁВ В.П., СПИРИДОНОВА М.Г., СТЕПАНОВ В.А. — 2004 г.

Изучено распределение аллелей и генотипов двух генов алкогольдегидрогеназ ADH1B (полиморфизм A/G в экзоне 3, выявляемый рестриктазой Ms/I) и ADH7 (полиморфизм G/C в интроне 5, выявляемый рестриктазой Styl) в трех русских популяциях сибирского региона. Выявлено отсутствие межпопуляционных и межполовых различий по частотам этих аллелей. Аллель ADH1B*G (+Ms/I, A2) встречается с низкой частотой (3.6-7.5%), частота “мутантного” аллеля ADH7 (-Styl, В2) в общей выборке трех популяций (n = 339) составила 46.02%. Частоты аллелей этих генов в популяциях удовлетворяют равновесию Харди-Вайнберга и равновесию по сцеплению. В общей популяции и среди жителей г. Томска (n = 113) обнаружено повышение частоты аллеля В2 ADH7 (на 11 и 9%, P = 0.001 и Р = 0.017 соответственно) в старшей возрастной группе (после 40 лет). Не обнаружено влияния полиморфных аллелей генов ADH7 и ADH1B на антиоксидантную активность, оцененную по способности плазмы крови снижать выход продуктов, реагирующих с тиобарбитуровой кислотой в модельной системе “ионы Fе 2+-лецитин”. В выборке г. Томска у носителей аллеля A2 ADH1B выявлено статистически значимое снижение содержания сывороточных липопротеинов очень низкой плотности (на 9.95%, Р = 0.045) и близкое к статистически значимому понижение систолического давления (на 6.80%, Р = 0.068) и содержания триглицеридов в сыворотке крови (на 6.16%, Р = 0.058).

АЙТХОЖИНА Н.А., ДЗИСЮК Н.В., ЛЮДВИКОВА Е.К. — 2004 г.

Исследован полиморфизм участка мтДНК главной некодирующей области (D-петли мтДНК) общей протяженностью 528 п.н. в трех выборках современных популяций казахов (алматинской, семипалатинской и алтайской), а также образцов ДНК древних людей, проживавших на современной территории Казахстанского Алтая. Использовали полимеразную цепную реакцию (ПЦР) и ПДРФ-анализ (полиморфизм длин рестрикционных фрагментов) по тринадцати сайтам рестрикции BamHl, EcoRV, Sau3Al (1 сайт рестрикции), Kpnl (2 сайта), Haelll (3 сайта), Rsal (5 сайтов рестрикции). Определены распределения частот каждого сайта, рассчитаны показатели генного разнообразия h, значения генетических расстояний между различными популяциями казахов и другими популяциями мира. По аналогии с современными образцами проводили ПДРФ-анализ контрольного региона мтДНК ископаемых образцов. Два исследуемых образца митохондриальной ДНК из кургана 11 по всем анализируемым сайтам рестрикции были мономорфны.

ВИКТОРОВА Т.В., САГИДУЛЛИН А.Ф., ШАНГАРЕЕВА З.А. — 2004 г.

BO LI, JIAKUAN CHEN, JUN CHEN, MING XIAO, WENWEI LU, YAMEI ZHEN, YUJING WANG — 2004 г.

Вирус классической чумы свиней (CSFV) вызывает болезнь, важную в экономическом отношении. Ранее с помощью метода оценки количества информации мы предсказали, что 21-нуклеотидная последовательность, локализованная на нетранслируемом 3'-конце (3'UTR), важна для репликации генома CSFV. В данной работе мы экспериментально изучили эту последовательность с помощью сайт-направленного мутагенеза. Показано, что полноразмерные 3'UTRs способны инициировать синтез РНК, а 3'UTRs, лишенные последних 21 н. - нет. Концевая 21-нуклеотидная последовательность в отсутствие остальной части 3'UTR способна инициировать синтез РНК, хотя и со значительно меньшей эффективностью. Показано, что эта последовательность нужна для репликации генома CSFV. Остальная часть 3'UTR также необходима для нормального синтеза РНК. Весьма вероятно, что 21-нуклеотидная последовательность участвует в инициации репликации генома CSFV, а в остальной части 3'UTR локализованы элементы, обеспечивающие нормальный уровень синтеза РНК. Высказано предположение, что репликаза CSFV связывается с этой последовательностью и инициирует репликацию генома CSFV. Показано, что мутация в позиции 216 21-нуклеотидной последовательности и замены 3'-концевого нуклеотида 3'UTR приводят к прекращению инициации синтеза РНК, а мутация в положении 212 не влияет на инициацию, но приводит к снижению уровня синтеза РНК. Из четырех мутаций 3'UTR в положении 219 три приводят к прекращению инициации синтеза РНК, а одна вызывает снижение уровня синтеза РНК. Таким образом, для синтеза РНК наиболее важен тимин в позиции 216, а кроме того, важны гуанин в положении 219 и цитидин в положении 228; тимин в позиции 212 имеет наименьшее значение.

ГЕЛЬФАНД М.С., МИРОНОВ А.А. — 2004 г.

Представлен обзор работ авторов по компьютерному анализу генома человека. Работа состоит из двух частей - одна посвящена разработке методов предсказания экзон-интронной структуры генов, а вторая - исследованию альтернативного сплайсинга. В первой части работы описаны идеи методов предсказания структуры генов с использованием информации о гомологии продукта гена с известным белком, или геномной последовательности с последовательностью гомологичного гена из другого организма. Тестирование предложенных методов показало их высокую эффективность. С использованием разработанных методов и баз данных EST был проведен анализ сплайсинга генов человека. Нами было впервые показано, что количество альтернативно сплайсируемых генов составляет не менее 35% от общего числа генов. Далее, проведено сравнение альтернативного сплайсинга в геномах человека и мыши. Было показано, что 50% альтернативно сплайсируемых генов (25% от общего числа генов) имеют специфические изоформы, представленные в одном организме и не представленные в другом.

ЗЕЛЕНИН А.В. — 2004 г.