научный журнал по химии Биоорганическая химия ISSN: 0132-3423

Архив научных статейиз журнала «Биоорганическая химия»

  • Синтез новых ингибиторов агрегации тромбоцитов - замещенных пиридилизоксазолов и их 4,5-дигидроаналогов

    ВАРФОЛОМЕЕВ С. Д., ВРЖЕЩ П. В., ДЕМИНА О. В., КОЗЛОВСКИЙ В. И., ХОДОНОВ А. А. — 1995 г.

    Осуществлен синтез ряда замещенных пиридилизоксазолов и их 4,5-дигидроаналогов 1,3-диполярным циклоприсоединением замещенных нитрилоксидов с алкенами или алкинами. Синтезированные соединения в концентрации 1х10 -6 - 1х10 -3 Μ ингибируют агрегацию тромбоцитов человека, вызванную индуктором агрегации - арахидоновой кислотой. Низкая токсичность этих соединений позволяет рассматривать их как потенциальные антитромбозные препараты.A number of substituted pyridylisoxazoles and their 4,5-dihydro analogs were synthesized by 1,3-dipolar cycloaddition of substituted nitrile oxides to either alkenes or alkynes. The synthesized compounds inhibit arachidonic acid-induced aggregation of human thrombocytes at concentrations of 10 -6 to 10 -3 M. Due to low toxicity, these compounds can be regarded as potential antithrombosis medicines.

  • Синтез октадециловых эфиров гидрофобных пролинсодержащих пептидов

    ЁСИПОВА О. В., ЗВОНКОВА Е. Н., ИСХАКОВА Ф. Х. — 1995 г.

    Разработаны схемы синтеза октадециловых эфиров гидрофобных пептидов, содержащих L -пролин, и получены их дейтериймеченые аналоги. С помощью 1H- и 13С-ЯМР-спектроскопии отмечено наличие цисс-транс -конформеров по связи Х-Рrо.Schemes of synthesis of octadecyl esters of hydrophobic peptides containing L -proline residue and their deuterated analogs were developed. cis -trans -Conformers around the X-Pro peptide bond were detected by 1H and 13C NMR.

  • Синтез октадециловых эфиров гистидинсодержащих трипептидов в качестве потенциальных регуляторов роста растений

    ГАФУРОВ Р. Г., ЗВОНКОВА Е. Н., ОГРЕЛЬ АН. А. — 1995 г.

    Синтезированы октадециловые эфиры ди- и трипептидов строения Phe-His, Val-His, Phe-Val-His и Val-Phe-His с применением различных методов. С использованием компьютерных программ минимизации рассчитаны наиболее энергетически выгодные конформации этих пептидов и проведен их сравнительный анализ с известным регулятором роста растений - паклобутразолом. Показано, что удлинение пептидной цепи приводит к более точному топохимическому соответствию пептидных производных паклобутразолу, чем это имеет место для производных аминокислот.

  • Синтез потенциальных антиметаболитов в ряду модифицированных по углеводу пиримидиновых 2'-дезоксинуклеозидов

    БАХМЕДОВА А. А., МЕЛЬНИК С. Я., ЯРЦЕВА И. В. — 1995 г.

    Взаимодействием 3'-амино-2',3'-дидезокси- или 5'-амино-2',5'-дидезокси-5-замещенных пиримидиновых нуклеозидов с N-этилмалеимидом в DMF в присутствии триэтиламина получены диастереомерные 2',3'-дидезокси-3'-(N'-этилсукцинимидо)- или 2',5'-дидезокси-5'-(N'-этилсукцинимидо)-аминонуклеозиды. В случае 5-триметилсилил- и 5-бензилоксиметил-2'-дезоксиуридина диастереомерные 3'-(N'-этилсукцинимидо)аминопроизводные разделены препаративной ТСХ. Структура синтезированных соединений подтверждена данными УФ-, ИК- и 1H-ЯМР-спектров. Полученные модифицированные нуклеозиды не обладают цитотоксическими свойствами in vitro на культуре клеток

  • Синтез ретиноидов с модифицированной полярной группой и их противоопухолевая активность. Сообщение I

    АСТАПОВА М. В., ДЕРЯБИНА Е. Л., ДРАНИЦЫНА С. М., КИРИЛЛОВА Ю. Г., КОСТАНЯН И. А., СТАРОВОЙТОВА Е. В., ХОДОНОВ А. А., ЧЕРЕВАТАЯ Г. В., ШВЕЦ В. И. — 1995 г.

    Осуществлен синтез ряда ретиноидов, модифицированных по концевой полярной группе. Биологический скрининг на культуре клеток промиелоцитарной линии человека HL-60 показал, что свободная карбоксильная группа в молекуле ретиноидов не является единственной группировкой, обеспечивающей проявление дифференцирующей активности.Several retinoids with modified polar group were synthesized. Biological screening using HL-60 promyelocyte leukemia cells showed that the free carboxyl in the retinoid molecules is not the only group responsible for exhibiting the differentiating activity.

  • Синтез стеароильных производных пролинсодержащих гидрофобных пептидов

    ЕСИПОВА О. В., ЗВОНКОВА Ε. Н., ИСХАКОВА Ф. Х. — 1995 г.

    Синтезированы стеароильные производные гидрофобных пролинсодержащих ди- и трипептидов и их дейтериймеченые аналоги. На основании данных ЯМР показано, что происходит сдвиг цис-транс- равновесия по связи Χ-Pro (Х - ацильный или аминоацильный остаток) в пользу транс- конформеров для соединений, содержащих в структуре фрагмент Ste-Pro, в отличие от соединений, где X - Вос-группа или остаток глицина.Hydrophobic stearoyl derivatives of proline-containing di- and tripeptides and their deuterated analogs were synthesized. It was shown by NMR spectroscopy that cis-trans -equilibrium around an X-Pro peptide bond is displaced towards trans -conformers for compounds containing a Ste-Pro fragment as opposed to the compounds containing Воc-Pro or Gly-Pro fragments.

  • Синтез флуоресцентных 3'-карбамоильных производных тимидина

    БЕРЛИН Ю. А., БОРЕСКОВ Ю. Г. — 1995 г.

    Описан синтез ряда флуоресцентных 3'-уретанов тимидина путем взаимодействия соответствующего 3'-карбонилимидазолида с аминоалкильными производными флуоресцеина, аминофенилбензоксазола и пирена.Synthesis of a number of fluorescent thymidine 3'-urethanes was carried out by coupling of a corresponding 3'-carbonylimidazolide with aminoalkyl derivatives of fluorescein, aminophenylbenzoxazole, or pyrene.

  • Синтез фосфоресцентных металлопорфиринов с изотиоцианатной группой

    МИРОНОВ А. Ф., ПОНАМОРЕВА О. Н., РУМЯНЦЕВА В. Д., ЧУДИНОВ А. В. — 1995 г.

    В качестве потенциальных фосфоресцентных меток для белков синтезированы палладиевые комплексы 6,7-бис(Nα-лизино)мезопорфирина IX и его изотиоцианатного производного

  • Синтез циклического аналога энкефалина пролонгированного действия

    БОБРОВА И. В., ВОСЕКАЛНА И. А., МЕКШУН Е. И., МЫШЛЯКОВА Н. А., ПАПСУЕВИЧ О. С. — 1995 г.

    Классическими и твердофазным методами пептидной химии синтезированы циклический аналог энкефалина - cyclo(Lys-Tyr-DMet-Gly-Phe-Pro-) и два соответствующих линейных гексапептида, содержащих остаток лизина на N- и С-конце молекулы; Lys-Tyr-DMet-Gly-Phe-Pro и Tyr-DMet-Gly-Phe-Pro-Lys. Наблюдается значительная пролонгация анальгетического эффекта циклического аналога энкефалина, исследованного методом "tail pinch" при интрацистернальном введении мышам. Циклоаналог оказывает слабое влияние на периферические опиатные рецепторы изолированного сегмента подвздошной кишки морской свинки. Присоединение остатка лизина к N-концу молекулы пентапептида энкефалина на порядок увеличивает селективность связывания с опиатным рецептором μ-типа.A cyclic analog of enkephalin, cyclo(

  • Синтез этиламида циклического ундекапептида последовательности 593 - 603 трансмембранного гликопротеина gp-41 вируса иммунодефицита человека второго типа

    БЕСПАЛОВА Ж. Д., КУДРЯВЦЕВА Е. В., МОЛОКОЕДОВ А. С., ОВЧИННИКОВ М. В., СИДОРОВА М. В. — 1995 г.

    Классическими методами пептидной химии в растворе осуществлен синтез этиламида циклического дисульфида пептидного антигена ВИЧ-2, соответствующего последовательности 593 - 603 белка gp-41. Показано отсутствие рацемизации при фрагментарной конденсации. Проведено сравнение различных методов образования дисульфидной связи.Ethylamide of cyclic disulfide of peptide HIV-2 antigen corresponding to 593 - 603 sequence of gp41 protein was synthesized by conventional methods of peptide chemistry in solution. The absence of racemizatton during fragment condensation was shown. Different methods of disulfide bond formation were compared.

  • Соединения, подобные ацикловиру. IX*. Синтез 7-гидрокси-2,5-диоксагептильных производных нуклеиновых оснований

    ГОТТИХ Б. П., КОЧЕТКОВА С. В., СМИРНОВ И. П., ФЛОРЕНТЬЕВ В. Л., ЦИЛЕВИЧ Т. Л., ЩАВЕЛЕВА И. Л. — 1995 г.

    С использованием в качестве алкилирующих агентов 7-ацетокси-1-хлор-2,5-диоксагептана и 8-ацетокси-2-хлор-3,6-диоксаоктана синтезированы 7-гидрокси-2,5-диоксагептильные и рацемические 7-гидрокси-1-метил-2,5-диоксагептильные производные урацила, тимина, цитозина, аденина, гуанина и 1,2,4-триазол-3-карбоксамида.7-Hydroxy-2,5-dioxaheptyl and racemic 7-hydroxy-1-methyl-2,5-dioxaheptyl derivatives of uracil, thymine, cytosine, adenine, guanine, and 1,2,4-triazole-3-carboxamide were synthesized using 7-acetyloxy-1-chlor-2,5-dioxaheptane and 8-acetyloxy-2-chlor-3,6-dioxaoctane as alkylating agents.

  • Спектроскопия ЯМР в исследованиях пространственной структуры мембранных пептидов и белков (обзорная статья)

    АРСЕНЬЕВ А. С., ПЕРВУШИН К. В. — 1995 г.

    В обзоре обсуждены проблемы, связанные с установлением пространственного строения мембранных пептидов и белков методом спектроскопии ЯМР высокого разрешения. Анализируются полученные этим методом данные о пространственной структуре и внутримолекулярной динамике мембраносвязанных форм около 30 пептидов и белков, таких как некоторые гормоны, нейропептиды, липопептиды, пептидные антибиотики, белки оболочки бактериофагов и трансмембранные участки интегральных мембранных белков. В тех случаях, когда удается подобрать адекватную искусственную среду солюбилизации (органические растворители, мицеллы детергентов или везикулы липидов), спектроскопия ЯМР позволяет получать уникальную информацию о строении и динамике мембранных пептидов и белков, что является основой для исследования их структурно-функциональных связей.

  • Структурная организация риморфина и его синтетических аналогов

    АХМЕДОВ Н. А., ЗЕЙНАЛОВА Η. М., МАХМУДОВА Т. А., ХАЛИЛОВ Р. И. — 1995 г.

    Методом теоретического конформационного анализа исследованы структура и конформационные возможности риморфина. Показано, что пространственная организация может быть представлена И низкоэнергетическими состояниями основной цепи. Из решения обратной структурной задачи найдены модифицированные аминокислотные последовательности ([Ala 2], [Ala 3], [MePhe 9], [MeLys 10], [MeVal 11], [МеVа1 12]-аналоги), пространственные структуры которых отвечают набору низкоэнергетических, потенциально физиологически активных конформаций.

  • Структурные свойства рибосомного белка S8 из экстремального термофила Thermus thermophilus

    ВАСИЛЕНКО К. С., ВЫСОЦКАЯ В. С., ГАРБЕР М. Б., НАРИЖНЕВА Н. В., НАСИБУЛЛИН У. Ф., УВЕРСКИЙ В. Н. — 1995 г.

    Ген рибосомного белка S8 из экстремального термофила Thermus thermophilus экспрессирован в Escherichia coli с использованием штамма BL21(DF3) и вектора рЕТЗ-1. Разработана методика выделения этого белка из штамма-суперпродуцента, позволяющая получать 8-12 мг продукта из 1 л культуры. С помощью спектроскопии КД определена вторичная структура белка S8. Показано, что он обладает высокой устойчивостью к денатурирующим агентам.The gene of ribosomal protein S8 from the extreme thermophile Thermits thermophilus was expressed in E. coli using the strain BL21(DE3) and vector pET3-l. A method of isolating this protein from the superproducing strain was developed, which makes it possible to obtain 8-12 mg of product from 11 of culture. The secondary structure of protein S8 was determined by using CD spectroscopy. The protein was shown to be highly resistant to denaturants.

  • Структурный анализ изоформ Na +,k +-atp-aзы мозга теленка

    ВЛАДИМИРОВА Н. М., МОДЯНОВ Н. Н., ПОТАПЕНКО Н. А. — 1995 г.

    Определены изоформный состав, тип функционирующих комплексов Na +,K +АТР-азы в ряде мембран мозга теленка и константы ингибирования их уабанном. Выявлена повышенная чувствительность к эндогенному протеолизу каталитической субъединицы α3 в составе нативного ферментного комплекса. Локализована точка специфического протеолиза в области полипептидной цепи, уникальной для всех изоформ типа α3: PNDNR 492 ↓ (Υ 493) (по нумерации α3-субъединицы человека). Впервые показано, что во всех препаратах фермента, содержащих α2- и α3-изоформы, выделенных как по методу Йоргенсена, так и по методу Эсмана, присутствуют два других белка - β5-цепь тубулина и глицеральдегид-3-фосфат-дегидрогеназа, биологический смысл ассоциации которых пока неясен.

  • Субстратные свойства диоксолановых аналогов 3-дезокситимидин-5'-трифосфата в реакциях синтеза ДНК, катализируемых различными ДНК-полимеразами

    БИБИЛАШВИЛИ Р. Ш., ВИКТОРОВА Л. С., ЕФИМЦЕВА Е. В., МИХАЙЛОВ С. Н., РОЗОВСКАЯ Т. А. — 1995 г.

    Исследованы субстратные свойства аналогов 3'-дезокситимидин-5'-трифосфата на основе 2,4-дизамещенных 1,3-диоксоланов в реакциях синтеза ДНК, катализируемых различными ДНК-полимеразами. Показано, что 4'-трифосфаты (±)- цис -4-гидроксиметил-2-(тимин-1-илметил)-1,3-диоксолана и соответствующего (±)- транс -изомера являются терминирующими субстратами концевой дезоксинуклеотидилтрансферазы. Также оказалось, что 4'-трифосфат (±)- цис -4-гидроксиметил-2-(тимин-1-илметил)-1,3-диоксолана терминирует синтез ДНК, катализируемый обратной транскриптазой ВИЧ, а 2'-трифосфат (±)- цис -2-гидроксиметил-4-(тимин-1-илметил)-1,3-диоксолана является терминатором в синтезе ДНК, катализируемом обратной транскриптазой ВИЧ и фрагментом Кленова ДНК-полимеразы I.

  • ТВЕРДОФАЗНЫЕ ФЕРМЕНТАТИВНЫЕ РЕАКЦИИ V*. СРАВНЕНИЕ КАТАЛИТИЧЕСКИХ СВОЙСТВ СУБТИЛИЗИНА И α-ХИМОТРИПСИНА В ОТСУТСТВИЕ РАСТВОРИТЕЛЯ

    МАКСАРЕВА Е. Ю., ХУРГИН Ю. И. — 1995 г.

    Показана способность субтилизина Carlsberg (КФ 3.4.21.14) гидролизовать п-нитроанилид N-сукцинил-L-фенилаланина в твердой фазе в отсутствие растворителя. Для реализации этого процесса необходима определенная степень гидратации белка, достигаемая при относительном давлении паров воды (p/ps) не ниже критического значения 0.49. Максимальное превращение субстрата происходит при p/ps 0.92. Такая же зависимость от гидратации наблюдается и для твердофазной инактивации субтилизина бензилсульфонилфторидом. Закономерности протекания твердофазных реакций α-химотрипсина и субтилизина, принадлежащих к разным семействам сериновых протеиназ, практически одинаковы.

  • Тотальный синтез и свойства простагландинов. Xxxviii. Синтез производных 11-дезоксипростагландина-е1 с аминокислотами и аминами

    МЫШЛЯКОВА Н. В., СОКОЛОВ Г. П., ТУРОВСКИЙ И. В., ФРЕЙМАНИС Я. Ф. — 1995 г.

    Для изучения физиологического действия 11-дезоксипростагландина Е1-α методом смешанных ангидридов синтезирован ряд его амидов с аминокислотами и некоторыми аминами. Исследованы их миотропные свойства.In order to study the physiological functions of 11-deoxyprostaglandin Ε1-α, a series of its amide derivatives with amino acids and some amines were synthesized using mixed anhydride technique. The myotropic properties of newly synthesized compounds were investigated.

  • Триптический гемпептид цитохрома с Candida valida

    ЖУРАВЛЕВА Д. В., КУЛИШ М. А., МИРОНОВ А. Ф. — 1995 г.

    Предложен метод прямого выделения гемсодержащего пептида из обогащенной цитохромом с биомассы дрожжей, дающий возможность получать гемпептид без дополнительных стадий очистки. Установлена аминокислотная последовательность тетрадекапептида цитохрома с Candida valida. Масс-спектрометрически определена молекулярная масса цитохрома с дрожжей С. valida и его гемсодержащего фрагмента.Method for direct isolation of hemepeptide from enriched yeast biomass have been developed. This method makes it possible to eliminate the process of cytochrome с purification. Amino acid sequence for the Candida valida hemepeptide is proposed. Exact molecular masses for both cytochrome с and its hemepeptide are determined by mass-spectrometry.

  • Тритерпеновые гликозиды Hedera taurica XIII*. Строение таурозидов st-ι1 и St-I2 из стеблей плюща крымского

    ГРИШКОВЕЦ В. И., ЦВЕТКОВ О. Я., ЧИРВА В. Я., ШАШКОВ А. С. — 1995 г.

    Из стеблей плюща крымского Hedera taurica Carr. (сем. Araliaceae) выделены таурозиды St-I1 и St-I2, представляющие собой соответственно известный 3-O-[β-D-глюкопиранознл-(1→2)-G-β→α-L-apaбинопиранозил]-28-O-[α-L-рамнопиранозил-(1→4)-O-β-D-глюкопиранозил-(1→6)-O-β-D-глюкопиранозил]хедерагенин и новый 3-O-[α-L-рамнолиранозил-(1→2)-O-β-D-глюкопиранозил]-28-O-[α-L-рамнопиранозил-(1→4)-O-β-D-глюкопиранозил-(1→6)-O-β-D-глюкопиранозил]хедерагенин.The taurosides, St-I1 and St-I2, isolated from the stems of Crimean ivy Hedera taurica Carr. (Araliaceae), were shown to be the known glycoside, 3-O-[β-D-glucopyranosyl-(1→2)-O-α-L-arabinopyranosyl]-28-O-[α-L-rhamnopyranosyl-(1→4)-O-β-D-glucopyranosyl-(1→6)-O-β-D-glucopyranosyl]hederagenin, and a new glycoside, 3-O-[α-L-rhamnopyranosyl-(1→2)-O-β-D-glucopyranosyl]-28-O-[α-L-rhamnopyranosyl-(1→4)-O-β-D-glucopyranosyl-(1→6)-O-β-D-glucopyranosyl]hederagenin, respectively.